穆松
- 作品数：4 被引量：16H指数：2
- 供职机构：西南民族大学生命科学与技术学院动物遗传育种学国家民委教育部共建重点实验室更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 流感病毒基因的密码子偏好性及聚类分析被引量：3
- 2010年
- 流行性感冒病毒是一种造成人类及动物患流行性感冒的RNA病毒,它造成急性上呼吸道感染,并由空气迅速传播,在世界各地常有周期性的大流行.根据该病毒的基因组CDS序列,探讨了基因组序列密码子的使用模式和特性,并进行了病毒间的聚类分析.结果表明：流感病毒的G＋C含量均低于A＋U含量,偏向使用以A、U结尾的密码子的程度比使用以G、C结尾的较高,CUG、UCA、AGU、AGC、AGA、AGG、GUG、CCA、ACA、GGA、GCA、AUU、UGA、CAU、CAA、AAU、AAA、GAA等18个密码子为流感病毒共有的偏好性密码子,且以A结尾的居多,尤其偏爱AGA、GGA.聚类结果表明首先亚洲流感病毒H2N2和香港流感病毒H2N2聚为一类,亚洲流感病毒H1N1和俄罗斯流感病毒H1N1聚为一类,1997年和2003年~2004年发生的人禽流感聚为一类,说明它们的密码子使用的偏好性相似;而2009年爆发的甲型H1N1流感和任何一个流感的距离都比较远,说明甲型H1N1流感病毒是一种新型的病毒,不同于以往任何一种流感病毒.
- 徐利娟钟金城陈智华穆松
- 关键词：流感病毒密码子偏好性聚类分析
- 牛基因组中新的microRNA预测及分析
- 引言MicroRNA(miRNA)是一类调控真核基因表达的非编码小分子RNA。已证实miRNA在生物体生长、发育和疾病发生等过程中起着重要的作用。由于miRNA的表达具有组织特异性和时序性,这给克隆miRNA基因带来了很...
- 穆松钟金城陈智华徐利娟
- 关键词：MIRNA
- 文献传递
- 牦牛mtDNA编码蛋白质的基因密码子偏好性研究及聚类分析被引量：12
- 2010年
- 对牦牛线粒体DNA(mtDNA)编码蛋白质的基因序列进行分析,探讨基因序列密码子的使用模式和特性,并根据基因序列和密码子的偏好性对牦牛与其他物种间的进化关系进行聚类分析。结果表明,牦牛mtDNA编码蛋白质的基因偏爱使用碱基A以及以A结尾的密码子,UUC、UAC、CAC、CAA等28个密码子为牦牛mtDNA编码蛋白质基因的偏好性密码子。家牦牛与野牦牛亲缘关系最近,首先聚为一类,然后依次与其他牛、山羊、绵羊等物种相聚。
- 徐利娟钟金城杨万远马志杰穆松姬秋梅张成福
- 关键词：牦牛MTDNA密码子偏好性聚类分析
- 牛基因组中新的microRNA预测及分析被引量：1
- 2010年
- MicroRNA(miRNA)是一类调控真核基因表达的非编码小分子RNA,目前已证实miRNA在生物体生长、发育和疾病发生等过程中起着重要的作用。用同源搜索的计算分析法预测新的miRNAs是当前发现和鉴定miRNA的有效方法之一,本研究根据NCBI数据库中的牛EST、GSS信息以及猪、家犬、人、大猩猩和小家鼠5种哺乳动物的已经注册miRNA分子信息,预测牛新的候选miRNA,通过碱基错配、二级结构、A+U含量、自由能大小等分析候选序列特征,得到了17条牛新的候选miRNA。这对进一步寻找牛的miRNA和遗传育种研究提供了新的思路,具有一定的理论和实际意义。
- 穆松钟金城陈智华徐利娟
- 关键词：MIRNA
