杨万远
- 作品数:6 被引量:38H指数:4
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- 野牦牛线粒体基因组结构及其系统进化研究
- 野牦牛属高寒地区的特有物种,是我国最珍贵的野生动物遗传资源之一,已被列为国家一级重点保护动物。野牦牛是家牦牛的近缘野生种,在青藏高原恶劣的气候环境下,具有极强的抗寒能力和适应能力,是很好的育种材料,科学研究已证明家、野牦...
- 钟金城柴志欣马志杰王永杨万远拉环
- 关键词:野牦牛线粒体基因组系统进化
- 野牦牛mtDNA Cytb基因全序列测定及系统进化关系被引量:12
- 2009年
- 为从分子水平探究牦牛的分类地位和遗传多样性,试验测定了野牦牛细胞色素b基因全序列,并以绵羊为外群,构建野牦牛、家牦牛、大额牛、普通牛、瘤牛、水牛、非洲野牛、欧洲野牛、美洲野牛、非洲水牛等牛亚科种间系统进化树。结果表明:野牦牛细胞色素b基因全序列长1 140bp,序列间共有13个SNP多态位点,核苷酸变异类型包括转换和颠换,无插入和缺失,表明野牦牛具有较丰富的遗传多样性。研究结果支持将牦牛划分为牛亚科中一个独立属(即牦牛属)的观点。
- 杨万远陈雪梅钟金城陈生梅郭承恩孟丽武甫德
- 关键词:野牦牛细胞色素B进化
- 藏绵羊GHRH基因部分片段的克隆及HaeⅢ-RFLP分析被引量:4
- 2008年
- 对欧拉型藏绵羊生长激素释放激素(GHRH)基因部分片段进行PCR扩增、纯化和克隆测序,利用GenBank中的Blastn方法与普通牛相应基因序列进行了比对分析,并对54只欧拉型藏绵羊该基因片段进行了HaeⅢ-RFLP研究。结果表明:欧拉型藏绵羊与普通牛GHRH基因部分序列间同源性为93%;序列间碱基变异类型主要表现为碱基转换和颠换,亦存在碱基插入和缺失;54只欧拉型藏绵羊该基因片段HaeⅢ-RFLP分析均为单态,表现为AA基因型。
- 马志杰魏雅萍钟金城杨万远常怀普陈生梅
- 关键词:生长激素释放激素克隆PCR-RFLP
- 野牦牛线粒体基因组序列测定及其系统进化被引量:11
- 2015年
- 野牦牛属高寒地区的特有物种,是我国最珍贵的野生动物遗传资源之一,已被列为国家一级重点保护动物。对野牦牛mtDNA进行全序列测定和结构分析,并基于线粒体基因组序列对其系统发生进行了探讨。结果表明:(1)野牦牛线粒体基因组全序列的大小为16 322 bp,整个基因组由37个编码基因和D-loop区组成;22个tRNA基因序列长度为1 524 bp、2个RNA基因序列长度为2 528 bp、13个编码蛋白基因序列长度为11420 bp、D-loop区长度为892 bp。基因组中无间隔序列,基因间排列紧密,基因内无内含子。(2)野牦牛具有较丰富的遗传多样性。(3)分子系统发生关系显示牦牛为牛亚科中的一个独立属,即牦牛属(Poephagus),牦牛属包括家牦牛(Poephagus grunniens)和野牦牛(Poephagus mutus)2个种。野牦牛线粒体基因组全序列的获得和结构解析对研究牦牛的起源、演化和分类,以及野牦牛遗传资源的保护、开发和利用均具有重要的理论和实际意义。
- 钟金城柴志欣马志杰王永杨万远拉环
- 关键词:野牦牛线粒体基因组系统进化
- 牦牛mtDNA编码蛋白质的基因密码子偏好性研究及聚类分析被引量:12
- 2010年
- 对牦牛线粒体DNA(mtDNA)编码蛋白质的基因序列进行分析,探讨基因序列密码子的使用模式和特性,并根据基因序列和密码子的偏好性对牦牛与其他物种间的进化关系进行聚类分析。结果表明,牦牛mtDNA编码蛋白质的基因偏爱使用碱基A以及以A结尾的密码子,UUC、UAC、CAC、CAA等28个密码子为牦牛mtDNA编码蛋白质基因的偏好性密码子。家牦牛与野牦牛亲缘关系最近,首先聚为一类,然后依次与其他牛、山羊、绵羊等物种相聚。
- 徐利娟钟金城杨万远马志杰穆松姬秋梅张成福
- 关键词:牦牛MTDNA密码子偏好性聚类分析
- 欧拉型藏绵羊GHRHR基因部分片段的克隆及多态性研究被引量:3
- 2008年
- 对欧拉型藏绵羊生长激素释放激素受体(GHRHR)基因部分片段进行PCR扩增和克隆测序(GenBank Accession No:EU289218),利用BioEdit7.0.9.0、DnaSP 4.10.9和MEGA4.0等生物信息学软件对该部分序列与GenBank中普通牛、瘤牛、水牛相应序列进行比对分析,并对58只欧拉型藏绵羊该基因片段进行SmaI-RFLP研究。结果表明:欧拉型藏绵羊与普通牛、瘤牛、水牛3个物种基因序列间同源性大小依次为92.5%、92.0%、91.5%;4个物种间共发现41处序列间碱基差异(9.65/100 bp),其中藏绵羊与普通牛、瘤牛、水牛3个牛亚科物种均存在差异碱基29处。碱基变异类型主要表现为碱基转换和颠换,少数为碱基插入和缺失。推导的部分氨基酸序列间同源性大小依次为88.8%、88.8%、94.4%。58只欧拉型藏绵羊该基因片段SmaI-RFLP分析均为单态,表现为AA基因型。
- 马志杰魏雅萍钟金城杨万远陈绍威
- 关键词:PCR-RFLP