兰瑞廷
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- 儿童脑膜炎大肠埃希菌毒力基因ibeC的分布研究
- 2015年
- 目的对Gen Bank的1620株大肠埃希菌基因组中儿童脑膜炎大肠埃希菌毒力基因ibeC的分布进行研究。方法下载Gen Bank现存并公开释放的1620株大肠埃希菌基因组数据,构建数据库,通过序列比对程序BLAST查找分析各菌株携带ibeC情况,使用Clustal X1.83软件对大肠埃希菌代表菌株的ibeC基因序列进行多序列比对。同时应用多位点序列分型方法(multi locus sequence typing,MLST)对1620株大肠埃希菌菌株的分布特点进行分析。用Bio Numerics V4.0软件,对342株不同来源、不同致病性代表菌株及MLST数据库中已经明确分群的72株大肠埃希菌菌株的不同ST型别构建最小生成树,分析菌株之间的种群结构。结果 1620株大肠埃希菌基因组中全部携带ibeC基因,ibeC序列平均相似值为98.21%,MLST将1620株大肠埃希菌菌株分成261个已知ST型,ECOR菌株共有49个ST型别,菌株ST型别与菌株来源关联性不强,不同来源、不同致病型别的菌株分布在不同家系。结论 ibeC基因广泛分布在各类大肠埃希菌中,脑膜炎相关大肠埃希菌与其他致病型大肠埃希菌所携带ibeC基因差异微小,菌株MLST聚类分析显示所有菌株分布广泛,来源复杂,进一步说明ibeC基因非常保守。
- 刘莎金东金东王艺婷王怡婷杨晶周娟许彦梅白向宁濮吉兰瑞廷熊衍文
- 关键词：IBEC基因分布大肠埃希菌
