孙晶
- 作品数:3 被引量:19H指数:2
- 供职机构:中国科学院更多>>
- 发文基金:中国科学院知识创新工程四川省科技基础条件平台项目四川省应用基础研究计划项目更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 一种叠鞘石斛的鉴定方法
- 本发明属于生物技术领域,涉及一种中药材的鉴定方法,具体涉及采用红外光谱法结合化学计量学分析鉴定叠鞘石斛的方法。本发明方法由以下步骤组成:首先将待鉴定样品烘干,粉碎并过200目筛,取2mg左右粉末用红外光谱仪记录其红外光谱...
- 罗聪佩何涛孙晶淳泽
- 文献传递
- 铁皮石斛尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(UGP)的密码子偏好性分析被引量:17
- 2014年
- 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-Glucose pyrophosphorylase,UGPase)是糖代谢的主要酶类之一.为了解铁皮石斛(Dendrobium officinale)尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(UGP)的密码子使用特性,运用CHIPS、CUSP和CodonW在线程序分析自主克隆的铁皮石斛UGP基因(GenBank登录号:KF711982.1)的密码子偏好性,并与其他物种的UGP基因以及基因组进行比较.结果显示,铁皮石斛UGP基因偏好使用A/T结尾的密码子,27种偏好密码子(RSCU>1)中偏好性较强的有TAA和CCU(RSCU≥2).与其他物种的UGP基因密码子使用对比后,发现不同物种UGP基因密码子使用偏好性存在一定差异.在9个所选物种的聚类分析中,发现基于UGP基因CDS序列聚类的进化树比基于RSCU的聚类更与传统的系统发育观点接近.与3种生物基因组密码子使用频率比较发现,与大肠杆菌基因组密码子使用频率差值较大的有23个,与酵母和拟南芥基因组差值较大的均有13个,这预示着铁皮石斛UGP基因在酵母和拟南芥中的表达效率较高.本研究结果为铁皮石斛UGP基因选择最佳的外源表达系统以及提高其表达水平奠定了前期的研究基础.
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- 关键词:铁皮石斛密码子偏好性聚类分析
- 不同降雨频次对粗枝猪毛菜生育期化学计量特征的影响被引量:2
- 2021年
- 降水格局变化下,研究植物各器官碳(C)、氮(N)、磷(P)化学计量特征和养分传输通路的构建,有助于理解C、N、P元素分配规律,对本土植物的生存和延续具重要意义。本研究设置4个降水处理:每月增水1次20 mm(W1)、每月增水2次,每次10 mm(W2)、每月增水4次,每次5 mm(W4)和自然降水作为对照(CK)。探讨荒漠植物粗枝猪毛菜(Salsola subcrassa M. Pop.)不同器官(叶、茎、果)C、N、P化学计量特征及其中性洗涤纤维(Neutral Detergent Fiber,NDF)、酸性洗涤纤维(Acid Detergent Fiber,ADF)、酸性洗涤木质素(Acid Detergent Lignin,ADL)含量的差异,以期揭示降水模式变化对典型荒漠植物养分获取的影响。结果表明:(1)各降水频次下,随植株生长,粗枝猪毛菜叶片和果中N含量均逐渐减少,但茎中逐渐增多。与CK相比,W4处理提高了叶片、茎及果在整个生育期内的N含量;叶片和茎中P含量随植物生长均逐渐减少,但果中逐渐增多,与其他处理相比,W4处理提高了茎和果在整个生长时期内P含量。(2)各降水处理下,叶片和茎中C:N值随时间的推移均呈先增后减趋势,其C:P和N:P值逐渐增大,果中C:N与C:P值较稳定,而果中N:P值逐渐减小。与其他处理比,W4处理显著增大了叶片和果在果实成长期内的N:P值(P<0.05)。整体上,与CK相比,其余各频次降水均优化了粗枝猪毛菜的养分分配策略。(3)随植株生长,其叶片和茎的NDF、ADF及ADL含量均显著增加(P<0.05)且叶片在不同时期同一处理下均达到差异显著(P<0.05),与其他处理比,仅W4处理增加了茎和果在果实成长期的ADF含量。综上,W4处理下粗枝猪毛菜的养分分配更利于促进植株生长,表明该植物在高频次、小量级降雨下更利于优化养分分配、完成生活史。
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