复旦大学人类表型组研究院 作品数:108 被引量:1,082 H指数:9 相关机构: 同济大学医学院 同济大学医学院病理学与病理生理学系 遵义医科大学第三附属医院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 上海市科委国际合作基金 国家社会科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 理学 机械工程 更多>>
SACS基因新发突变致遗传痉挛性共济失调1例 被引量:2 2021年 Charlevoix-Saguenay型常染色体隐性遗传痉挛性共济失调(autosomal recessive spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay,ARSACS),是一种遗传性神经退行性疾病。最早由BOUCHARD等[1]于1978年发现于加拿大魁北克省。ARSACS典型的临床表现包括进行性小脑共济失调、周围神经病变伴远端肌肉无力萎缩、下肢痉挛[2]。 周燕妮 杨文波 刘小妮 董思其 俞海 王久存 陈向军不孕症的遗传学病因研究综述 被引量:3 2023年 不孕症是影响生殖健康的重要原因。不孕不育的发生受许多因素影响,遗传因素对于明确不孕症的诊断及再生育计划制定非常有意义。本文从遗传因素出发,对于女性不孕症中性腺发育不全、卵巢功能不全、卵母细胞成熟障碍、受精失败、卵裂失败及早期胚胎发育阻滞、空卵泡综合征等,男性不育症中精子发生、少弱畸形精子症、性腺发育等疾病进行了最新研究进展的总结,主要包括染色体异常、拷贝数变异以及单个基因的缺陷等变异类型的遗传病因。 张婷 闫铮 吴畏 孙赟 安宇关键词:不孕症 病因学 基因组 上海市社区中老年人群地中海饮食模式与死亡风险的关联研究 2025年 目的分析上海社区中老年人群地中海饮食模式与全因及肿瘤特异性死亡风险的关联。方法前瞻性纳入2016—2019年上海郊区自然人群队列和生物样本库(SSACB)项目完成基线调查≥45岁且饮食和营养问卷完整的45487名中老年人,随访至2023年12月31日,收集生存资料和死亡原因。使用改良地中海饮食(AMED)评分评价地中海饮食模式,根据评分将研究对象分为0~3分,4~5分和6~9分组。采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,log-rank检验比较3组间全因死亡累积生存率的差异;Gray检验比较3组间肿瘤特异性死亡累积发生率的差异。使用Cox比例风险模型和竞争风险模型分析AMED评分与全因及肿瘤特异性死亡的关联,采用限制性立方样条评估AMED评分与全因及肿瘤特异性死亡风险的剂量反应关系。结果所有研究对象基线年龄为(60.25±7.36)岁,男性17753名(39.0%),中位随访时间6.4年,随访期间共发生死亡1230例,其中肿瘤特异性死亡607例(49.3%)。AMED评分0~3分组13386名,男性6133名(45.8%);4~5分组20738名,男性8022名(38.7%);6~9分组11363名,男性3598名(31.7%)。AMED评分分组3组间全因死亡的累积生存率差异有统计学意义,肿瘤特异性死亡的累积发生率差异有统计学意义(均P<0.05)。Cox比例风险回归模型分析结果显示,AMED评分每增长1分,全因死亡的风险降低7%(HR=0.93,95%CI:0.90~0.97);以AMED评分0~3分组为参照,6~9分组全因风险降低27%(HR=0.73,95%CI:0.62~0.87)。竞争风险模型分析结果显示,AMED评分每增长1分,肿瘤特异性死亡的风险降低9%(HR=0.91,95%CI:0.87~0.97);以AMED评分0~3分组为参照,6~9分组肿瘤特异性死亡风险降低29%(HR=0.71,95%CI:0.55~0.91)。AMED评分与全因及肿瘤特异性死亡风险无非线性关联(均P_(非线性)>0.05)。结论上海社区中老年人群采用地中海饮食模式与全因、肿瘤特异性死亡风险降低相关。 陈怡舟 赵明 蔡汝君 陈兴栋 张铁军关键词:饮食习惯 地中海饮食 肿瘤 队列研究 醋酸杆菌代谢特性与解酒护肝作用机制研究进展 被引量:1 2021年 饮酒过多引起肝脏损伤、脂肪栓塞、昏迷休克甚至危害生命。醋酸杆菌(Acetobacter aceti)是生产发酵的重要微生物,它们独特的代谢形式,被称为“氧化”发酵,其主要特点是将乙醇氧化成醋酸。该文对醋酸杆菌的分类、有氧呼吸及氧化发酵方式进行介绍,并归纳总结近几年关于醋酸杆菌及其产品解酒护肝作用及可能的机制,期望为日后相关研究提供参考。 尹明雨 陈敏 赵一梦关键词:醋酸杆菌 解酒 护肝 中医表型组学的概念与相关研究体系的构建 被引量:24 2022年 提出中医表型组学是以中医核心理论为根本,以大型“证病结合”人群队列为基础,采用多学科联合和人工智能等手段,从宏观、中观、微观水平上系统地、定性与定量结合地测定中医证病发生发展全过程中的表型集合及中药干预下的转归机制,揭示中医现代科学内涵的一门学科。以大型“证病结合”人群队列为研究基础,以多学科联合与人工智能为技术实现途径,以中医经典理论科学内涵的阐释为研究内涵,可构建中医表型组学研究体系。总结中医表型组学的主要研究任务为在全面获取各尺度表型基础上,着眼于基因(先天之本)、环境(后天影响),通过微观表型作用于中观、宏观表型的路径机制,将宏观表型、中观表型和微观表型跨尺度关联,最终系统绘制中国人群生理、病理的中医表型组学图谱,实现中医的精准医学。 原淳淳 王晶 舒冰 梁倩倩 杨燕萍 赵东峰 徐浩 孙悦礼 张伟强 赵永见 施杞 唐德志 王拥军关键词:中医学 队列研究 人工智能 采用ACMG-ClinGen新指南对单中心拷贝数变异的大样本进行回顾性分析 2022年 目的通过对单中心拷贝数变异(copy number variations,CNVs)的大样本进行回顾性分析,探讨2019年美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)和临床基因组资源(Clinical Genome Resource,ClinGen)共同提出的《拷贝数变异解读和报告的技术标准指南》对CNVs评级以及临床实验室CNVs解读一致性的影响。方法对本中心2018年8月至2019年12月行单核苷酸多态性微阵列分析、按2011年ACMG指南评估为致病性以及不明临床意义(包括可能致病、临床意义不明和可能良性)的235例CNVs进行重新分析。4名工作人员根据2019年最新指南的解读标准重新进行分类。结果4名工作人员重新进行CNVs临床意义分类的一致性达91%,α检验系数为0.98。对比2011年和2019年版ACMG指南对于CNVs分类的结果显示,原致病性和临床意义不明确的变异解读基本保持一致;原可能致病和可能良性的变异重分析后90%(45/50)被分类为临床意义不明确,差异较为明显。结论最新的CNVs解读和报告标准通过半定量评分系统,结合本中心自建数据库,有助于提高实验室对CNVs结果分析的一致性,也让CNV的解读变得更加规范和透明。 张玉鑫 薛江阳 闫露露 刘颖文 庄丹燕 解敏 陈怡博 安宇 沈亦平 李海波关键词:拷贝数变异 一致性 新生儿线粒体病诊断与治疗专家共识(2024) 被引量:1 2024年 线粒体病是一组遗传代谢病,因线粒体结构和(或)功能异常造成能量代谢功能损害,可导致单器官或多器官功能障碍。在新生儿期发病的线粒体病为新生儿线粒体病。新生儿线粒体病致病基因复杂,患儿表型差异显著,常常病情凶险,缺乏特异和敏感的生物标志物,且治疗方法有限,诊断及救治极具挑战性。为进一步规范新生儿线粒体病的诊断与治疗,新生儿、神经、代谢内分泌及遗传学等专家基于国内外临床证据,结合实践经验,从概念、定义、早期识别、生化代谢、影像、基因检测、病理、治疗、遗传咨询及产前诊断等层面对新生儿线粒体病进行论述,并形成诊疗专家共识。 逯军 王丹虹 钟柏茂 方方 王颖 杨传忠 黄涛生 安宇 彭镜 肖昕 冯琪 罗小平 杨艳玲 崔清洋关键词:线粒体病 新生儿 遗传代谢病 “数字化”人体的“可视化”:表型影像学 被引量:3 2022年 表型组作为生命体所有特征的组合,涉及整个生命过程中各种微观和宏观特征及其在时间维度上的变化。表型组学包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学,以及器官、体质、心理、影像等多种组学。表型影像学将研究对象的解剖结构、组织器官功能、细胞代谢与生物化学过程等从宏观到微观的各种特征,以二维或三维图像的方式展现出来。它既是表型组学中全面贯穿宏观与微观表型的重要线索和纽带,也是表型组学中将人体精密测量"数字化"后,实现"可视化"的重要方法和目标。 冯凯 魏铃 田梅关键词:表型 灵长类特异基因在男性生殖系统中的作用探究 2024年 男性不育是一类多因素的复杂疾病.作为导致男性不育的重要因素,弱畸精子症越来越受到人们的关注并且被发现与遗传因素有关.随着高通量测序技术的不断发展,多个弱畸精子症的致病基因被揭示.其中,对于在人和小鼠中进化保守的致病基因,利用传统的基因编辑小鼠模型即可完成表型或致病机理的探究.然而,随着研究的进行,人们陆续发现了与生殖疾病相关的一类灵长类特异基因(primate specific genes, PSGs),即存在人类基因组中、在灵长类和小鼠进化分支产生后出现的基因.对于此类基因,小鼠不再是疾病研究的理想模型,新的动物模型以及研究系统的探索尤为必要.本文在总结前期利用小鼠模型开展弱畸精子症遗传致病机理以及干预探究的基础上,重点介绍了新近发现的灵长类特异基因在男性生殖系统中的作用及研究系统构建.相关论述不仅为遗传咨询和临床诊断提供理论指导,也将为睾丸组织中富集的灵长类特异基因在生殖系统中的功能探索提供新的研究思路. 周大鹏 李阔阔 田世雄 周怡伶 张锋 贺小进 刘春雨关键词:男性不育 化解知情同意模式之争:从公平原则分析 被引量:2 2021年 当代就何种知情同意模式适用于公共层面的生物医学研究的争论中,不同模式的支持者都会援引尊重自主性原则批评彼此并辩护自身。文章表明产生这一悖反的根源在于"尊重自主性"有双重内涵。一是尊重"理性人"的自主性,二是尊重不同个人依据自己的取向进行选择的自主性。尊重"理性人"的自主性要求个人在科研人员每一次使用自己的样本或数据前进行同意授权,随着研究风险的降低以及参与者人群的急剧扩大,"理性人"的标准面临越来越大的困难。"尊重自主性"原则本身缺乏足够的理论资源化解上述困境,"公平"原则可以为此提供助益。 陈泓邑 庞聪