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刘芳
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1
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供职机构:
内蒙古师范大学
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发文基金:
内蒙古自治区科技计划项目
内蒙古自治区自然科学基金
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相关领域:
生物学
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合作作者
王立东
兴安职业技术学院
徐行健
内蒙古师范大学
纪兆华
北京工业大学
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2017
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基于云计算的RNA-seq转录组数据分析流程初探
2017年
随着二代测序技术的不断发展,转录组学的研究有了新的工具RNA-seq。RNA-seq可以使用高通量测序技术快速对细胞某一个状态下完整的转录组进行测序,获得该转录组中所有的RNA序列。相比与以往利用芯片和PCR等技术来研究转录组,RNA-seq有着许多明显的优势,所以其应用的规模不断增加。但是RNA-seq测序结构文件非常大,每一个转录组样品都会产生几Gb到几十Gb的序列文件,传统的RNA-seq数据分析软件需要耗费大量的时间和系统资源来完成分析任务。采用云计算的方法和框架,开发一套完整的RNA-seq转录组大数据分析软件,用户只需输入RNA-seq测序的原始序列文件,即可得到最终的结果。
纪兆华
王立东
徐行健
刘芳
关键词:
云计算
转录组
数据分析
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