何杨
- 作品数：15 被引量：35H指数：4
- 供职机构：德阳市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 德阳市2010年手足口病监测结果分析被引量：3
- 2011年
- [目的]了解2010年德阳市手足口病患者中肠道病毒的主要血清型及EV71毒株的基因型别,为德阳市手足口病的预防控制提供科学依据。[方法]采用实时荧光PCR方法对四川省德阳市手足口病疑似病例的68份咽拭子或疱疹液标本进行肠道病毒通用型(EV)、肠道病毒71型(EV71)型和柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)的病毒核酸检测。并对2份EV71阳性标本进行VP1区核苷酸序列测序和进化树分析。[结果]68份标本中,CoxA16阳性率41.18%(28/68),EV71阳性率17.65%(12/68),其他肠道病毒阳性率为7.35%(5/68)。2份EV71毒株VP1区的核苷酸序列进化树分析,证实均属C4基因亚型。[结论]2010年德阳市手足口病以CoxA16感染为主,EV71及其他非CoxA16、非EV71肠道病毒并存。2份德阳EV71毒株经VP1区测序证实为C4基因亚型,与中国内地流行株基因亚型一致。
- 何杨许欣代泽伟杨成林李兰兰武慧玲
- 关键词：手足口病肠道病毒实时荧光PCR基因型
- 德阳市一起新冠本土疫情病毒基因特征分析
- 2025年
- 目的:对2022年10月德阳市一起由新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)引起本土疫情的病毒进行全基因组测序和特征分析,为疫情的精准防控提供参考。方法:收集此次本土疫情的新冠感染者阳性标本,使用高通量二代测序技术对新型冠状病毒进行全基因组测序,并利用“微未来”MicronCov基因组测序分析平台进行序列组装拼接。使用Nextclade与Pangolin在线平台分析病毒所属株系和具体型别,使用MAFFT(v.7.037b)进行多序列比对,应用进化分析软件MEGA 7构建病毒的系统进化树,结合流行病学调查信息进行溯源分析。结果:测序得到8份高质量序列(覆盖度>96%),Nextclade分型结果均为22B Omicron,Pangolin分型均为BA.5.2.48变异株。与武汉参考株(EPI_ISL_402124)比对显示,8条BA.5.2.48序列存在75-77个核苷酸変异位点。其中4条序列共享75个核苷酸变异位点。另外4条序列中,有序列分别新增NSP12区的A14960T、T15521A突变和A12160G回复突变;以及S蛋白NTD区的T22304A突变。进化树显示来源于德阳市2个不同区域的8份标本处在一个进化分支下,并与同时期广东、北京、天津的病例序列聚成一簇。结论:由omicron变异株BA.5.2.48导致此次本土疫情,病毒在本地隐匿传播且持续变异,需持续加强新冠病毒本土变异监测工作。
- 李晓莉何杨杨国庆吴晓宇唐宏宇
- 关键词：全基因组基因分析
- 2014—2022年德阳市结核分枝杆菌耐药情况分析被引量：5
- 2024年
- 目的了解德阳市结核分枝杆菌对一线、二线抗结核药物的耐药状况,分析德阳市结核病耐药趋势和特点,为结核病防控管理、临床合理用药提供参考依据。方法收集和统计2014—2022年德阳市结核病患者信息,采用比例法对2014—2022年德阳市疾病预防控制中心结核病实验室收集痰培养分离的分枝杆菌菌株,进行4种一线抗结核药物(异烟肼INH、利福平RFP、链霉素SM、乙胺丁醇EMB)和2种二线抗结核药物(卡那霉素KM、氧氟沙星OFX)敏感性试验,并同时进行菌种鉴定,分析实验结果,耐药率比较采用χ^(2)检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果2014—2022年德阳市收集菌株共1229株,其中结核分枝杆菌(MTB)1182株,非结核分枝杆菌(NTM)45株,NTM阳性率为3.66%(45/1229)。MTB药物敏感性试验结果显示总耐药率为21.66%(256/1182),其中初诊患者耐药率为18.91%(198/1047),复诊患者耐药率为42.96%(58/135);总耐多药率为5.16%(61/1182),其中初诊患者耐多药率为3.92%(41/1047),复诊患者耐多药率为14.81%(20/135);历年耐药率依次为51.75%、27.33%、22.52%、13.38%、13.46%、14.14%、15.00%、17.12%和24.44%;历年耐多药率依次为11.40%、5.23%、7.95%、3.82%、3.85%、2.02%、2.50%、3.60%和5.56%;对4种一线抗结核药物INH、RFP、SM、EMB的耐药率分别为13.03%(154/1182)、6.26%(74/1182)、13.37%(158/1182)和2.62%(31/1182),对2种二线抗结核药物KM、OFX的耐药率分别为1.18%(14/1182)和4.23%(50/1182);单耐药率为12.27(145/1182),多耐药率为5.84%(69/1182),准广泛耐药率为1.10%(13/1182)。结论德阳市结核分枝杆菌耐药率较高,耐多药率高于四川省和广东省平均水平,近年来结核病耐药情况呈现回升的趋势,应继续加强结核病耐药筛查和监测,加强患者管理,科学用药,以控制耐药结核病的蔓延。
- 杨国庆何杨杨曦霞吴晓宇伍剑黄文静
- 关键词：肺结核结核分枝杆菌药物敏感性试验耐药率耐药监测
- 四川省德阳市柯萨奇病毒A组5型基因特征分析被引量：3
- 2023年
- 目的分析四川省德阳市手足口病病例中的柯萨奇病毒A组5型(coxsackievirus A5,CVA5)的基因特征,为防控CVA5提供科学依据。方法对德阳市2013—2021年手足口病监测中收集到的疑似病例咽拭子标本,采用实时荧光聚合酶链反应(real-time fluorogenic quantitative polymerase chain reaction,Q-PCR)进行肠道病毒核酸检测,选择Q-PCR检测结果CT值<30的非肠道病毒71型(EV-A71)/柯萨奇病毒A组16型(CVA16)的其他肠道病毒核酸阳性标本,分别进行VP4/VP2区和VP1区基因扩增和核苷酸测序,再用MEGA 7.0.26软件构建CVA5系统进化树,分析其基因特征。结果2013—2021年德阳市共收集手足口病疑似病例标本3115份,经Q-PCR检测非EV-A71/CVA16的其他肠道病毒核酸阳性标本为1314份;选择其中的353份标本进行VP4/VP2区和VP1区核苷酸测序,在280份标本中检测出8种肠道病毒型别,其中10份为CVA5。德阳市10份CVA5标本之间,VP1区核苷酸序列相似性为91.4%~99.8%,推导氨基酸序列同源性96.6%~99.6%;同CVA5原型株比较,核苷酸相似性和推导氨基酸同源性分别为81.3%~82.5%和94.9%~96.6%,有19个位点发生了氨基酸变异。进化树分析显示,德阳市CVA5与绝大多数中国CVA5聚集在一起,均为C1基因亚型3谱系,但分布在3个不同的进化分支中,分支间平均遗传距离为6.2%~6.4%。结论德阳市10株CVA5均为C1基因亚型3谱系,分布在3个不同的进化分支。CVA5不但能引起手足口病和疱疹性咽峡炎,还会引起急性脑病、急性弛缓性脊髓炎、胃肠炎等疾病,今后应加强CVA5的检测,并开展基因组测序,更全面了解其基因特征。
- 吴晓宇何杨杨国庆曾德军刘泉童文彬
- 关键词：手足口病基因特征
- 德阳市乙型肝炎病毒基因型、血清亚型和变异分析
- 2013年
- 目的了解德阳市乙型肝炎病毒基因型、血清亚型和变异。方法从HBsAg阳性的血清标本提取病毒DNA,S基因全序列多聚酶链反应和测序后,根据进化树和推导氨基酸确定基因型、血清亚型及"α"抗原决定簇氨基酸变异。结果 41份标本中,33份标本为B基因型/adw2血清亚型,7份标本为C基因型/adrq+血清亚型,另1份标本为B基因型/ayw1血清亚型;6份标本"α"抗原决定簇内氨基酸发生变异,分别为Thr126Ser,Thr126Ala,Gln129His,Met133Leu和Thr143Met,且变异集中在第1环内氨基酸(6/7,85.7%)。1份标本在114位和115位氨基酸间插入额外1个氨基酸,1份标本的216位氨基酸变异为终止码。结论德阳市HBV以B基因型/adw2为主,自发的"α"决定簇氨基酸变异集中在第一环氨基酸。
- 何杨刘朝红李超代泽伟杨成林
- 关键词：乙型肝炎病毒基因型血清亚型
- 四川省德阳市柯萨奇病毒A组4型基因特征分析
- 2017年
- 目的分析四川省德阳市柯萨奇病毒A组4型(coxsackievirus A4,CV-A4)的基因特征。方法对2014-2015年德阳市手足口病咽拭子标本进行病毒分离和核苷酸测序,VP1区序列与世界各地的CV-A4参考株序列构建进化树并分析基因特征。结果德阳市5株CV-A4分离株之间,VP1区核苷酸序列一致性91.5%~96.8%(推导氨基酸序列一致性97.7%~99.3%);同CV-A4原型株(High Point)比较,核苷酸序列一致性≥84.0%(推导氨基酸序列一致性≥97.0%);进化树分析显示,德阳市CV-A4分离株均为G1B基因亚型,分别与云南、上海和浙江分离株有较近的亲缘关系。G1B基因亚型内的平均核苷酸遗传距离为10.4%。结论德阳市CV-A4为G1B基因亚型,为中国大陆的优势基因亚型;VP1区核苷酸变异较大,形成不同的进化分支并在德阳市循环传播。
- 何杨吴晓宇代泽伟吉华贵高燕
- 关键词：手足口病VP1基因基因特征
- 流感标本的采集和保存条件对分离率的影响被引量：3
- 2007年
- 刘华利刘泉何杨谢贤建
- 关键词：分离率
- 2018年德阳市胃肠炎暴发中诺如病毒分子病原学特征研究被引量：3
- 2020年
- 目的了解2018年德阳市急性胃肠炎(acute gastroenteritis,AGE)暴发疫情中诺如病毒(Norovirus,NoV)感染情况及其分子病原学特征,为NoV预防控制和疫苗研发提供参考。方法收集德阳市2018年3起AGE暴发疫情的疑似病例及健康人标本共63份。采用实时荧光RT-PCR检测NoV核酸,阳性标本用RT-PCR扩增聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)区和衣壳蛋白(capsid protein)VP1区并测序分析。结果NoV实时荧光RT-PCR结果显示3起AGE暴发疫情均由GII组NoV感染引起,检测阳性率为33.3%(21/63),其中病例标本检出率为95%(19/20),健康人标本检出率为4.7%(2/43)。测序分析表明,2起疫情由GII.17[P17]型NoV引起,与2014年以来流行的GII.17变异株高度同源;1起疫情由GII.2[P16]型NoV引起,与2016年以来流行的GII.2[P16]重组株高度同源。结论2018年德阳市至少存在2种以上不同型别的NoV同时流行。
- 曹冉冉曹冉冉何杨马小珍马小珍
- 关键词：诺如病毒胃肠炎系统进化分析
- 四川省德阳市埃柯病毒6型的基因特征分析被引量：1
- 2015年
- 目的了解四川省德阳市埃柯病毒6型(echovirus 6,E6)的基因特征。方法对2013年德阳市手足口病咽拭子标本的病毒分离阳性株进行核苷酸测序,获取的E6毒株序列与世界各地的E6参考株序列构建进化树并分析基因特征。结果4株E6分离株中,3株VP1区核苷酸序列一致,与另1株仅有1个核苷酸差异。同E6原型株(D'Amori)比较,核苷酸一致性≥77.0%。进化树分析显示,德阳市E6分离株为C2基因亚型,与部分山东分离株聚集在同一进化分支上。结论德阳市E6为C2基因亚型。其中3份标本来自同一地区的不同月份,提示E6在此地持续传播。
- 何杨伍剑代泽伟杨成林刘泉刘灵韵童文彬
- 关键词：基因特征
- 德阳市MSM人群HIV、HCV和梅毒感染现状及性行为特征研究被引量：5
- 2011年
- [目的]了解四川省德阳市男男性行为人群(MSM)的艾滋病病毒(HIV/AIDS)、丙型肝炎病毒(HCV)和梅毒螺旋体(梅毒)感染状况及性行为特征。[方法]2010年4～8月,对德阳市251名MSM进行问卷调查及血液样品收集,分别用联免疫吸附试验、蛋白印迹实验、快速血浆反应素环状卡片试验检测HIV、HCV梅毒感染情况。[结果]被调查对象中,HIV,HCV和梅毒的阳性率分别为16.33%(41/251),0.8%(2/251),14.34%(36/251);HIV和梅毒均阳性人员占4.4%(11/251),占感染HIV人数的25%(11/41);HCV和梅毒均阳性的人员占0.4%(1/251);距调查结束前6个月,与男性、女性均发生过性行为的MSM较多,在与女性发生性行为时安全套使用率为76.08%(35/46),低于其同男性发生性行为时安全套使用率91.3%(42/46)(χ2=3.903,P﹤0.05)。[结论]该市MSM人群3种病原体感染不容忽视,其高危性行为普遍存在,需要进一步加强艾滋病/性病宣传教育,预防二代传染。
- 代泽伟裴晓方何杨杨成林李晓莉马建英尹燕平王锦
- 关键词：男男性行为人群艾滋病病毒梅毒丙型肝炎病毒性行为
