庞小静
- 作品数：4 被引量：13H指数：2
- 供职机构：山西农业大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学轻工技术与工程更多>>
- 利用小RNA深度测序技术鉴定半夏病毒病病原被引量：6
- 2018年
- RNA沉默是真核生物体内由病毒来源的干扰小RNA(virus-derived small interfering RNA,vsiRNA)沉默复合物介导目标RNA特异降解的一种保守机制,通过对vsiRNA分析可进行植物病毒病原鉴定。本文利用小RNA深度测序技术对感病半夏叶片进行鉴定,结果发现,表现典型花叶症状的半夏叶片受到大豆花叶病毒(Soybean mosaic virus,SMV)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)、芋花叶病毒(Dasheen mosaic virus,Ds MV)、魔芋花叶病毒(Konjac mosaic virus,KoMV)、烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)等多种病毒的复合侵染。为明确SMV山西半夏分离物(SMV-SXBX)的进化关系,进行SMV-SXBX全基因组克隆与分析,获得SMV-SXBX全长为9735 nt,编码一个由3 105个氨基酸组成的多聚蛋白质。通过核苷酸与氨基酸序列比对发现,SMVSXBX与半夏分离物P同源性最高,分别为91. 1%和94. 1%,且系统发育分析表明,SMV-SXBX与半夏SMV分离物P聚为一簇。同时,也对vsiRNA进行了系统分析,研究结果有望为半夏SMV的有效防治提供一定科学依据。
- 崔丽艳庞小静齐永红王宝霞王德富牛颜冰
- 关键词：半夏大豆花叶病毒
- 烟草花叶病毒山西番茄分离物的全基因组序列测定及分析被引量：2
- 2017年
- 为明确山西省晋中市侵染番茄的病毒种类,采用双链RNA(double-stranded RNA,ds RNA)技术和非序列依赖PCR扩增(sequence-independent amplification,SIA)方法对感病番茄进行分子鉴定。序列测定及分析发现,具有花叶、卷曲症状的番茄为烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)所侵染。进一步克隆TMV番茄分离物(TMV-SXFQ)的全基因组序列,得到TMV-SXFQ(Gen Bank登录号为JX993906)全长为6 394 bp,含4个开放阅读框(open reading frame,ORF)。序列比对分析表明,TMV-SXFQ与烟草花叶病毒属其他分离物的同源性为86.3%~99.6%;系统进化分析表明,TMV-SXFQ与韩国分离物IM聚为一簇、亲缘关系最近。
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- 关键词：番茄病原鉴定烟草花叶病毒
- 丝瓜和西葫芦病毒病病原检测及基因组全序列测定与分析
- 本研究首先利用Dot-ELISA 对采集于山西省多个地区的150 份丝瓜和西葫芦疑似病样进行检测,发现CMV 是优势病毒种类,总检出率为71.4％;接着对CMV 呈阳性反应的样品进行dsRNA 和SIA 检测,在丝瓜上发...
- 牛二波杨锋寇丽莎庞小静牛颜冰
- 关键词：丝瓜西葫芦病原检测全基因组序列分析
- 山西西葫芦花叶病病原鉴定与部分序列分析被引量：5
- 2016年
- 利用双链RNA（double-stranded RNA,dsRNA）技术和非序列依赖PCR扩增（sequence-independent amplification,SIA）方法对感病西葫芦进行了分子鉴定。序列测定及分析发现,具有明显花叶和斑驳症状的西葫芦受到黄瓜花叶病毒（Cucumber mosaic virus,CMV）的侵染。为进一步明确黄瓜花叶病毒山西西葫芦分离物（CMV-XHL）的分类地位,克隆了CMV-XHL RNA3的外壳蛋白和移动蛋白基因全序列。通过序列比对分析,发现CMV-XHL CP核苷酸序列和氨基酸序列与CMV亚组ⅠB中CMV烟草分离物（CMV-SG）的相似性最高,分别为98.6%和99.5%;MP核苷酸序列和氨基酸序列与CMV亚组Ⅰ分离物的相似性最高,为93.2%~94.6%。MP和CP氨基酸序列系统进化分析表明,CMV-XHL与中国大多数CMV分离物聚为一类,属于CMV亚组Ⅰ中的成员。研究结果对西葫芦病毒病的防治提供一定的理论依据。
- 王德富时晓丽寇丽莎庞小静刘勇牛颜冰
- 关键词：西葫芦黄瓜花叶病毒病原鉴定
