李道丰
- 作品数:2 被引量:3H指数:1
- 供职机构:中国农业大学生物学院农业生物技术国家重点实验室更多>>
- 发文基金:新疆维吾尔自治区高技术研究发展计划项目国家科技支撑计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 截形苜蓿生物数据分析平台的构建与应用被引量:3
- 2006年
- 为更有效地利用截形苜蓿(M.truncatula)的表达序列标签和其他公共数据,加快对截形苜蓿功能基因的研究步伐,构建了“M.trunca tula Home”生物数据分析平台,并以此为中心,整合了专门为截形苜蓿定制的电子克隆系统。该数据分析平台具有序列基本信息查询、电子克隆系统、试验一致性序列动态分类查询的功能。进一步利用“M.truncatula Home”生物数据分析平台大规模预测了截形苜蓿盐胁迫相关基因,从截形苜蓿的36878条试验一致性序列中预测出650条与耐盐相关的序列,为进一步克隆截形苜蓿耐盐相关功能基因奠定了基础。
- 刘云岩苏震董江丽申小叶李道丰王涛
- 关键词:电子克隆表达序列标签
- 盐胁迫条件下苦马豆幼苗根差异表达基因及功能注释
- 2011年
- 苦马豆(Swainsona salsula Taubert)是新疆重要的耐盐抗旱豆科植物,通过染色体压片技术确定供试材料为二倍体,采用截形苜蓿(Medicago truncatula)基因组芯片(61278个探针),对苦马豆幼苗根部在未经盐处理和在180 mM NaCl溶液中处理24 h后的表达水平进行了分析,找出控制盐胁迫的关键基因,为耐盐基因的筛选提供依据。结果表明:有4057个基因在不同处理条件下存在表达差异,其中155个上调基因和105个下调基因;利用Gene Ontology注释对差异表达的基因从分子功能、细胞组件、生物学过程3个水平进行功能分类,搜索NCBI数据库,在截形苜蓿和拟南芥(Arabidopsis thaliana)中找到有高相似性功能已知的部分基因,表明差异表达的基因涉及逆境胁迫、信号转导、电子传递、蛋白代谢等多个方面,这些基因是植物根部盐胁迫相关基因。
- 王玉祥贾广云李道丰张博王涛
- 关键词:苦马豆耐盐功能注释