刘玥
- 作品数：22 被引量：90H指数：7
- 供职机构：上海市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项上海市自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 幼儿非伤寒沙门菌混合感染一例的病原学调查
- 2024年
- 沙门菌是人类重要的感染性食源性疾病的病原,近年研究表明,沙门菌多个血清型已在全球五大洲养殖食用动物(畜禽类)与水产品中存在物种与优势菌型的差异化共存现象[1]。人一旦经粪口途径感染沙门菌后,因免疫水平不同产生不同的症状,低年龄幼儿易出现腹泻、腹痛、发烧等典型感染性腹泻症状,成人多可自限,罹患基础性疾病者易经肠系膜静脉系统入血形成菌血症、脓毒血症导致重症甚至死亡[2]。2020年10月,上海市杨浦区某三甲医院报告1例"乙型副伤寒"患儿,按乙类肠道传染病传报至国家大疫情网,属地公共卫生机构遂上门调查并采样复检,最终该患儿确诊为2种沙门菌血清型的混合感染。本案虽排除乙型副伤寒,但亦属罕见,现将病例及调查情况报告如下。
- 沈隽卿刘玥张旭牛娜张月娟许学斌
- 关键词：病原学沙门菌全基因组
- 确诊系统性硬化症病例合并感染密执安沙门菌ST2065
- 2024年
- 患者男,57岁,因系统性硬化症复发入院于2023年5月至上海华山医院治疗,问诊有轻度腹泻(2~3次/d)怀疑合并感染性腹泻,患者粪便经选择性增菌和分离鉴定为“非A—F群沙门菌”,经参比实验室血清分型、耐药表型、全基因组测序和中国沙门菌区域血清型数据库比对鉴定为密执安沙门菌ST2065,结合其耐药和毒力结果判断为高耐药、低肠毒素表型。医嘱患者口服替加环素7 d,患者症状改善出院。
- 朱旻刘玥许育陈瑜刘红许学斌
- 关键词：腹泻沙门菌基因组
- 自职业体检者检出和清除高水平耐药肯塔基沙门菌ST198.2-1被引量：1
- 2024年
- 体检者女,49岁,就职于广西贵港某纸业公司(从事餐纸生产),2023年6月11日至贵港市覃塘区人民医院申领健康证,体检筛查肠道病原菌(沙门菌、志贺菌)时分离到沙门菌,多次经验使用抗菌药物清除未果。参比实验室对前后2次分离菌株进行血清分型、耐药表型、全基因组测序均鉴定为肯塔基沙门菌ST198,基于中国沙门菌区域血清型数据库构建ST198耐药基因型系统进化树,定义2株菌均属高水平耐药ST198.2-1亚分支克隆。临床启动多学科会诊根据抗菌药物敏感性试验结果调整医嘱为阿莫西林/克拉维酸和阿奇霉素,8月19日复检3次阴性确认清除肯塔基沙门菌。
- 钟艳阮静芳覃夏婵韦蓓刘玥周敏许学斌
- 关键词：沙门菌属血清分型基因组
- 从感染者血液分离鉴定胎儿弯曲菌胎儿亚种ST20被引量：3
- 2024年
- 患者女,72岁,2023年8月因“畏寒发热,腹胀痛、腹泻伴咳嗽气促1 d”至贵港市覃塘区人民医院急诊入院。既往有慢性阻塞性与肺源性心脏病、高血压Ⅲ期及头孢他啶过敏史。临床诊断慢性阻塞性肺炎急性期细菌感染,予左氧氟沙星联合哌拉西林/他唑巴坦等对症治疗,4 d后血培养报告胎儿弯曲菌,7 d后患者复查血培养阴性治愈出院。菌株形态学、质谱鉴定符合胎儿弯曲菌定义;全基因组测序预测多位点序列型为胎儿弯曲菌胎儿亚种ST20,携带四环素类抗菌药物耐药基因tet(O/M/O)、鞭毛基因18个(其中rpoN基因来自空肠弯曲菌,未见另2个胎儿亚种的基因组)、毒力基因6个(包括类伤寒毒素和伤寒毒素基因)。本例胎儿弯曲菌ST20有寄生养殖动物的生态特征和高运动、高毒力的生物特征,易通过粪口途径入血,造成为侵袭性感染。
- 韦蓓高芬刘玥钟艳李燕芳覃德巨周锦成许学斌
- 关键词：菌血症弯曲菌基因组毒力因子
- 胎儿弯曲菌龟亚种ST80菌血症菌株基因组学特征
- 2025年
- 分析胎儿弯曲菌龟亚种(Cft)序列型(ST)80菌血症菌株基因组学特征。回顾性分析2023年10月16日上海新华医院收治1例57岁男性患者临床资料,临床诊断为主动脉夹层B型、胸腹主动脉感染及菌血症。菌株对萘啶酸、环丙沙星和四环素耐药。全基因组测序为ST80,预测耐药基因为氨基糖甙类aph(3′)-Ⅱa、四环素类tet(O)、糖肽类(blmt)和喹诺酮类,耐药决定区存在氨基酸位点突变gyrA(T86I),预测19种基因中存在9种异源菌基因,79个基因中鞭毛基因占41个;毒力基因包含侵袭因子ciaB和细胞致死膨胀毒素(类伤寒毒素)cdtA、cdtB、cdtC;共存Ⅳ型分泌系统和表面S层蛋白定殖基因(sapA)。给予哌拉西林/他唑巴坦钠联合阿奇霉素抗感染治疗20 d后行胸腹主动脉置换和分支动脉重建术,痊愈出院。本例Cft ST80感染源疑为家养甲鱼,具有融合重组生物学特征,甲鱼可能是Cft潜在新宿主或为食源性侵袭性病例的传播媒介。
- 陈峰李虎高芬王闻卿刘玥刘瑛王亚楠许学斌
- 关键词：菌血症新发传染病侵袭性基因组
- 高毒力高耐药空肠弯曲菌ST7268血流感染确诊1例被引量：3
- 2025年
- 患者女,51岁,因腹痛、呕吐和发热1 d入院。临床诊断急性盆腔炎、子宫腺肌病;予头孢哌酮/舒巴坦钠经验治疗;6 d后血培养报告空肠弯曲菌,9 d后复查血培养阴性治愈出院。菌株形态学结合质谱鉴定为空肠弯曲菌,全基因组测序预测多位点序列型(ST)为ST7268(ST464复合群),其具典型高活力、高毒力和多耐药分子特征,属于食源型空肠弯曲菌的侵袭性克隆。
- 王芳高芬刘玥王亚楠许学斌
- 关键词：空肠弯曲菌毒力因子多重耐药
- 阿拉丘沙门菌的遗传特征及耐药基因初步研究
- 2025年
- 目的 基于阿拉丘沙门菌分离株的全基因组分析,初步探讨其遗传特征及耐药基因分布。方法 收集并鉴定5株来自不同来源(人源与非人源)的阿拉丘沙门菌,对其进行表型和血清型验证、抗菌药物敏感性测定以及全基因组测序分析。利用全球公开数据库的阿拉丘沙门菌基因组数据,对这些菌株的毒力基因、耐药基因和质粒复制子进行预测,并构建系统发育树以探讨其遗传背景。结果 我国阿拉丘沙门菌的首例报告出现于2015年的上海,临床特征主要为腹泻,菌株主要集中在东部和南部沿海地区。本次研究的5株菌株中,4株归属于序列型ST2061,1株归属于ST1298。所有菌株对大多数临床常用抗菌药物敏感。全基因组分析结果显示,2株ST2061菌株携带bla KPC-2基因,1株ST1298菌株携带fosA7基因。在全球阿拉丘沙门菌群体的5个遗传进化群(C1~C5)中,本研究的ST2061克隆位于C1群,与英国菌株高度同源;而ST1298克隆位于C4群,为携带磷霉素耐药基因fosA7的全球流行克隆。结论 本研究初步呈现我国阿拉丘沙门菌分离株的遗传和耐药特征,提示存在携带bla_(KPC-2)和fosA7基因的菌株出现。为后续在更大范围内开展的分子流行病学监测与溯源分析提供参考,并强调加强阿拉丘沙门菌耐药性监测的重要性。
- 刘玥许学斌胡屹顾其芳刘诚袁政安陈敏
- 沙门菌分离、筛检和确认流程技术关键点分析被引量：5
- 2020年
- 目的基于标准方法构建多维组合流程,分析和评价沙门菌常规检测的技术关键点。方法构建沙门菌选择性增菌液和平板构成的检测流程,使用标准菌株检测4种选择性增菌液的回收率,验证3类5种沙门菌选择性平板的典型特征。通过实样比较不同选择性增菌液和平板组合在沙门菌检测过程中疑似菌落甄别、筛检效率和敏感性差异。结果罗伯特增菌液(RV)、四硫磺酸钠煌绿增菌液(TTB)和亚硒酸盐煌绿增菌液(SBG)回收效能与亚硒酸盐胱氨酸增菌液(SC)相差1个稀释度,前3种增菌液适合非伤寒沙门菌的增殖,SC适合伤寒和副伤寒沙门菌的增殖。双糖管筛选法符合预期参比菌株表型。除沙门菌显色平板(CAS)外,其他选择性平板的菌株验证均可能产生菌落小和硫化氢(H2S)阴性不典型菌落;84件肉制品和水产品样品中确认阳性25件(29.76%),检出42株沙门菌。RV、TTB、SBG、SC联合CAS和木糖赖氨酸脱氧胆酸盐平板(XLD)筛检沙门菌的敏感性分别为88%、84%、72%和0;RV和TTB、RV和SBG、TTB和SBG的组合敏感性分别为100%、92%和88%。3种增菌液与任一选择性平板组合的分离敏感性为48%~68%。双糖管筛检疑似菌落的特异性和阳性预测值较高。42株沙门菌经系统生化、质谱和血清学鉴定确认。结论经验证的双增菌液和双平板的组合能有效提高食品沙门菌检测的敏感性。梯度增菌、菌落识别和初筛效率是沙门菌检测技术的关键点。
- 刘玥张红芝顾其芳刘诚朱颖莹许学斌
- 关键词：沙门菌增菌液筛检
- 胃肠炎继发脓毒症感染创伤弧菌ST14514的病原学诊断与文献病例回顾分析
- 2024年
- 目的基于急性脓毒症病例解读创伤弧菌的表型、基因型和遗传特征,提升新发人兽共患病诊疗能力。方法2016年6月21日于上海交通大学医学院附属仁济医院急诊入院的急性肠胃炎继发脓毒症1例患者(男性、71岁)48 h血培养菌株经质谱、生化和耐药表型鉴定,及全基因组测序(WGS)预测多位点序列型(MLST)、注释耐药基因与可移动元件和毒力因子,菌株基于单核苷酸多态性(SNPs)构建进化树基因簇(C1~C4);查找文献分析2012至2023年我国(含港台)创伤弧菌病例特征、比对中国、美国以及韩国创伤弧菌感染病例特征。结果患者有食用海鲜史和慢性肾功能不全,临床诊断脓毒症、急性胃肠炎。医嘱左氧氟沙星与头孢吡肟抗感染及对症治疗14 d治愈。菌株经质谱和生化鉴定为创伤弧菌(生物1型),除多粘菌素耐药外对其他药物均敏感;WGS预测为新序列型ST14514,聚类分析属C1临床型菌株,携带高毒力基因wza、vvhA、rtxA、vvp、luxS;我国15个省报告的148例创伤弧菌病例前5位为广东省、浙江省、福建省、上海市和江苏省,集中在东南沿海且有向内地蔓延趋势,男女比值约4∶1,培养与mNGS各确诊132例和16例;死亡55例(37.16%),涉海水、鱼虾刺伤、食用海鲜等暴露病例99例(66.89%);我国创伤弧菌感染病死率低于美国、韩国,暴露史以伤口直接或间接接触海水(产品)为主要感染途径,高死亡特征为男性肝脏病(肝炎、酒精肝、肝硬化)。结论本例ST14514属新型、高毒力和低耐药的C1临床型菌株,创伤弧菌肠胃炎继发脓毒症病例罕见且有隐匿性,应加强专业机构和大众对创伤弧菌疾病诊断与生态型及暴露风险的宣传教育,以提升治疗能力降低病死率。
- 奚卫王闻卿刘玥王亚楠许学斌
- 关键词：创伤弧菌毒力因子基因组学
- 猪霍乱沙门菌在全球的流行和耐药特征被引量：7
- 2018年
- 根据公共卫生和临床实验室监测大数据及文献,综合研究猪霍乱沙门菌在国内外的临床疾病、分子流行病学和耐药特征。确证猪霍乱沙门菌属专一寄生猪肠道内、对免疫力低下人群具有较高侵袭力的人兽共患病原,可经养殖链获取抗生素多重耐药,在过去数十年间依次在泰国、中国台湾和大陆地区优势流行或隐匿分散的肠外感染病例构成的疫情。发达国家猪霍乱沙门菌的发病率和耐药率极低,其疾病特征和菌株较难从粪便中分离的特征亦和亚洲地区有高度一致性。防控猪霍乱疫病和耐药传播重点要依靠农业部门对生猪养殖的源头管控,其次要加强各级监管部门的实验室对非伤寒沙门菌诊断的能力建设。发达国家在预防食源性传染病暴发的污染、输入和暴发调查的成熟经验值得借鉴。
- 罗铭顾桂敏景春梅许云敏张平平张建民王传清刘玥王鸣柳许学斌
- 关键词：猪霍乱沙门菌侵袭性人畜共患病
