杨阳 作品数:6 被引量:49 H指数:4 供职机构: 山西农业大学农学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 山西省自然科学基金 山西省高等学校科技创新项目 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
基于SSR的中国糜子遗传多样性分析 被引量:9 2015年 以40份来自中国的糜子种质资源为材料,利用5对糜子特异性SSR引物研究上述试材的遗传多样性,以期为糜子育种提供一定的理论数据。结果表明,40份试材中共检测出14个等位基因位点,每对引物的等位位点数在2~5之间,平均为3.5。PIC值在0.42~0.69之间,平均为0.52。相似性系数分析表明,遗传相似系数在0.61~0.99之间,平均为0.8;聚类分析结果发现,在相似系数0.68处将40个品种分为5大类群,第一类群共12个品种,属于北方春糜子区;第二类群共7个品种,属于西北春夏糜子区;第三类群共16个品种,大多属于华北夏糜子区;第四类群的4个品种来自不同的生态区,包括东北春糜子区、北方春糜子区、黄北高原春夏糜子区和华北夏糜子区;第五类群只有来自山东的1个品种,来源于华北夏糜子生态区。该结果可为中国糜子的分类以及育种提供参考依据。 季煦 王瑞云 曳水瑛 刘晓欢 杨阳 刘笑瑜 连帅关键词:糜子 SSR 聚类分析 谷子HMA基因家族的全基因组表征及其功能预测 2025年 [目的]Heavy metal ATPase(HMA)蛋白参与了植物对多种金属离子的吸收和转运。本研究通过对谷子HMA进行全基因组表征、表达及同源分析以解析其功能。[方法]通过蛋白同源比对和保守结构域筛选谷子HMA基因家族成员;采用生物信息学手段系统分析了谷子HMA的理化性质、家族扩张、保守基序、系统发育关系及蛋白质分子对接;基于不同浓度Cd、Fe胁迫下的转录组和荧光定量PCR分析了其对不同金属离子的响应;基于模式物种水稻的同源比对预测了部分SiHMA的功能。[结果]在谷子基因组中共鉴定到12个HMA基因,并将其分为2个亚组,有6个HMA基因参与到2次串联重复(4个基因,占比33.3%)和1次片段复制事件(2个基因,占比16.7%)中。SiHMA基因在不同组织中对Cd、Fe胁迫表现出不同的响应模式。预测了SiHMA可能的功能,SiHMA5参与细胞中Zn、Cu、Pb和Cd等金属离子的外排过程,SiHMA10可能参与植物体内Cu的装载和运输。[结论]重复事件和片段复制在谷子HMA基因家族扩张和SiHMA功能进化中发挥作用。植物激素、应激胁迫等多种顺式作用元件参与到SiHMA响应非生物胁迫途径中,我们根据同源比较、组织表达特征和前人研究,预测了SiHMA1、SiHMA5、SiHMA6和SiHMA10等基因可能的功能,以上结果可为进一步研究HMA基因家族及其在谷子中的生物学功能提供理论基础。 王心悦 陈畅 李康平 黄绒 王君 侯思宇 杨阳 韩渊怀关键词:谷子 谷子功能基因发掘现状及展望 被引量:15 2022年 谷子是起源于我国的古老粮食作物,在约1万年前由青狗尾草驯化而来,是人类最早驯化栽培的禾谷类作物。作为北方旱作生态农业建设的主体作物和应对未来极端气候条件的战略储备作物,谷子抗旱、耐贫瘠、适应性广等特性使其在当前的种植业结构调整中起着重要作用。谷子也因其具有自花授粉、单穗结实多、染色体倍性简单(二倍体)、基因组小、属于C_(4)作物等特征,已被认为是最适合的C_(4)光合作用及耐逆分子遗传学研究的禾谷类模式作物。此外,我国拥有最丰富的谷子种质资源及领先的谷子遗传育种研究,因此对这些种质及基因资源的充分发掘及合理利用,对我国谷子产业的发展具有深远意义及重要影响。本文综述了近年来谷子农艺及产量性状、品质性状、氮磷吸收转运及抗逆等方面的研究进展,并对存在的问题及未来的发展趋势进行了讨论和展望,以期推动我国谷子的科研创新水平及产业发展。 禾璐 杨阳 王宇珅 张义茹 赵耀飞 唐娇艳 韩渊怀关键词:谷子 功能基因 糜子PmNCED1的克隆及其对PEG胁迫的响应 被引量:15 2018年 为了解糜子9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶基因在抗旱中的作用,本研究从黄糜子中克隆了1个9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶基因,命名为PmNCED1,利用生物信息学软件预测PmNCED1编码蛋白的理化特性和结构特征。结果表明,PmNCED1基因开放阅读框全长1 284 bp,编码428个氨基酸。预测PmNCED1蛋白属于类胡萝卜素双加氧酶家族成员,保守结构为N-端双亲性α-螺旋和4个组氨酸残基,无跨膜结构,AA23-29(-ARLRQER-)和AA284-290(-TGRSTRR-)为核定位信号,AA400为核输出信号,三级结构包括4个α-螺旋和25个β-延伸链;10种植物NCED1的氨基酸一致性为77%~96%。实时荧光定量PCR显示,PmNCED1的表达量随着PEG胁迫时间增加而升高,PEG处理组与对照组生理指标和解剖结构差异极显著(P<0.01),表明PmNCED1与PEG胁迫有关。本研究结果为小麦等作物抗旱性改良提供了理论依据。 王瑞云 杨阳 王海岗 陈凌 王纶 陆平 刘敏轩 乔治军关键词:克隆 糜子 抗旱相关基因及其遗传工程 被引量:2 2014年 干旱是影响全球生态的重要因子,文章综述了转录调控因子和转录后RNA/蛋白修饰因子两类抗旱相关基因及其在耐旱性遗传改良中的应用。其中,胁迫应答的转录调控因子包括脱水响应因子(DRE)、锌指蛋白(ZFP)、核因子(NF-Y)和WRKY转录因子;转录后RNA/蛋白修饰因子包括蛋白的法尼基化、蛋白磷酸化和蛋白的聚ADP核糖基化作用。这些基因中有的已克隆并通过生物技术手段转入作物中,靶基因的表达提高了作物的抗旱性及产量。 王瑞云 杨阳 李润植 郭红媛关键词:抗旱性 转录调控因子 不同生态区糜子种质间叶片及光合特性的多样性分析 被引量:12 2014年 气孔大小和密度是植物体对水分胁迫耐受程度、光合作用强度的相关特征,在种间和基因型间存在较大差异,在植物遗传和生态方面均具有重要意义.气孔密度在物种间和品种间具有特异性.选取来自6个糜子栽培生态区的18个糜子种质资源,在叶片成熟期调查其光合生理特性及叶脉、气孔密度等叶片性状特征.结果表明:(1)净光合速率(Pn)与气孔导度(Gs)、蒸腾速率(Tr)存在极显著的正相关,与胞间CO2浓度(Ci)存在显著的负相关,不同糜子种质旗叶叶绿素含量(CF)和倒二叶叶绿素含量(CS)呈极显著正相关,上表皮气孔密度(USD)和下表皮气孔密度(LSD)呈显著正相关.(2)18个糜子种质的叶片特征中,叶脉密度介于4.36±0.0752~6.10±0.0578条·mm^-1;气孔属于双面型,上表皮气孔密度介于55.73±6.6789~146.53±8.0087个·mm^-2,下表皮气孔密度介于49.10±2.2984~120.83±3.6084个·mm^-2.(3)18个糜子种质中,来自宁夏的1号材料(八升半)上、下表皮的气孔密度均为最小,蒸腾小,Tr最小、水分利用率(WUE)最大,Pn较高,是较耐旱的种质;来自山西的16号材料(黄粮黍)上、下表皮气孔密度最大,蒸腾大,Pn最小、WUE最低,是较不耐旱的种质. 王瑞云 季煦 刘晓欢 杨阳 徐凤杰 程冀南关键词:糜子 不同生态区 叶片性状 光合特性