胡燕 作品数:11 被引量:11 H指数:2 供职机构: 遵义师范学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 博士科研启动基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 一般工业技术 更多>>
基于BSA-seq法的油菜野芥胞质雄性不育恢复基因的分析 被引量:5 2020年 细胞质雄性不育是利用杂种优势创制油菜杂交种的重要途径之一。而恢复系的选育及恢复基因的研究有利于提高细胞质雄性不育系的应用价值。该研究以甘蓝型油菜细胞质雄性不育系1193A和恢复系15-R1为亲本,以F2群体构建了2个极端性状混池,采用BSA-seq技术方法,对恢复基因进行定位分析。结果表明:(1)不育系1193A与恢复系15-R1之间共获得非同义突变的SNPs共33883个,混池间共有7996个非同义编码突变。(2)InDel检测与注释结果表明,亲本间引起移码突变的有2918个,混池间引起移码突变的有840个。(3)综合SNP和InDel的关联分析结果,将恢复基因定位于C09染色体上的0~880000区域,总长度为880 kb。(4)对候选区域的SNP和InDel注释发现,亲本间存在非同义突变的SNP共40个,混池间存在非同义突变的SNP共65个,亲本间存在移码突变的InDel共7个,混池间存在移码突变的InDel共11个;对候选区间内的编码基因进行注释,结果共注释到162个基因,其中存在非同义突变基因11个,移码突变基因5个,这些基因可能与育性恢复有关。 尹明智 胡燕关键词:油菜 恢复基因 基因组测序 一种易辨识界限的96孔PCR板 一种易辨识界限的96孔PCR板,包括PCR板体(1),该96孔PCR板还包括有设置于PCR板体(1)面上的细胶条(2);所述的细胶条(2)设置于96孔PCR板上的孔与孔之间的间隙;所述的细胶条(2)数量为三‑六根;所述的... 尹明智 金星 胡燕 颜雄 曾庆雨 冯韬文献传递 油菜菌核病相关的WRKY转录因子研究进展 被引量:2 2016年 介绍了WRKY转录因子的结构特点,综述了WRKY转录因子在植物防卫反应中的作用以及在油菜菌核病防卫调控机制中的研究,在此基础上,提出了研究WRKY转录因子可能为油菜菌核病防治及抗病育种提供新的思路。 尹明智 胡燕关键词:油菜 菌核病 WRKY转录因子 十字花科植物DFR蛋白的生物信息学分析 2019年 采用生物信息学的方法分析已经在GenBank上注册十字花科植物的DFR基因序列及相应氨基酸序列,并对其理化性质、结构特征、系统进化关系等进行预测。结果表明,十字花科植物的DFR蛋白大部分都有6个外显子,分子质量36481.89~43129.21Da,大多数蛋白亚细胞定位于叶绿体中;除了BnaDFRA402,其他的DFR蛋白均具有酶活性部位、NADP结合位点和底物特异结合位点,这些保守区域形成了5个motifs;每个DFR蛋白均有多个磷酸化位点,以Ser为主,以Thr和Tyr磷酸化为辅;二级结构均由α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲组成,其中α-螺旋为主要结构元件。 胡燕 尹明智 匡光炼 黄杰 严秋香关键词:十字花科 花青素 生物信息学 油菜细胞质雄性不育恢复基因分子标记的研究进展 被引量:1 2020年 利用杂种优势是育种家们获得强优势油菜杂交组合、改良油菜品种的重要途径。油菜杂种优势利用的主要途径是细胞质雄性不育系统(Cytoplasmic Male Sterility,CMS),而选育恢复系是CMS系统能够应用于生产的重要前提。随着生物技术的发展,分子标记技术在恢复系的选育及恢复基因的研究中发挥着越来越大的作用。基于此,对目前应用较广的油菜CMS系统的恢复基因的分子标记研究进行了综述,以期为建立恢复基因的分子标记辅助育种技术体系提供参考。 尹明智 胡燕 张瑜 杨胜洁 杨露关键词:油菜 细胞质雄性不育 恢复基因 分子标记 一种琼脂糖凝胶电泳制胶用三角瓶 一种琼脂糖凝胶电泳制胶用三角瓶,包括瓶体(1),该三角瓶还包括有套环(2),手柄(3)和绝热套(4);所述瓶体(1),套环(2)和手柄(3)三者连为一体;所述绝热套(4)设于手柄(3)上。本实用新型将瓶体,套环和手柄三者... 尹明智 胡燕 金星 曾庆雨 颜雄 冯韬外源蔗糖对甘蓝型油菜种子萌发与幼苗发育的影响 2024年 萌发调控是促进甘蓝型油菜快速出苗、齐苗的重要基础,为探索外源蔗糖对甘蓝型油菜种子萌发与幼苗发育的影响,选用早熟油菜品种湘油420进行了不同条件下萌发试验,检测了水分、脱落酸、内源糖及关键基因的表达变化。结果表明:外源蔗糖延缓湘油420种子萌发启动过程,提高萌发整齐度,在子叶展开后促进子叶转绿、真叶形成,抑制主根过度伸长同时促进侧根发育。外源蔗糖对湘油420种子萌发过程中水分吸收表现先抑制后促进,播种后3 h内抑制水分吸收,并在播种后6 h内解除吸水抑制;萌发过程中种子内ABA含量持续降低,外源蔗糖促进播种后3 h内ABA含量的下降;播种后15~18 h内可溶性总糖含量迅速降低,还原性糖含量在萌发初期随萌发进程增加,外源蔗糖对可溶性总糖含量变化无明显影响,但抑制播种后9 h还原糖的增加、促进播种15 h后还原糖含量增加;萌发过程中2个蔗糖磷酸合酶(BnaSPS)基因BnaC09g37470D和BnaA10g15120D相对表达量在胚根萌出阶段显著降低、子叶转绿后表达回升,外源蔗糖抑制胚根萌出前2个BnaSPS基因表达,在子叶转绿后显著诱导其中BnaC09g37470D基因表达。综上,研究初步揭示了外源蔗糖通过渗透性作用调节吸涨起始阶段水分吸收,通过糖代谢调节萌发阶段种子内源糖利用和幼苗发育初期糖类转化而延缓甘蓝型油菜种子萌发启动、促进吸涨后种子萌发进程而提高种子萌发整齐度、促进幼苗发育的多重作用。 冯韬 陈勤勤 杨佳 谭晖 尹明智 胡燕关键词:甘蓝型油菜 种子萌发 幼苗发育 基因表达 甘蓝型油菜DOF蛋白基因的克隆与生物信息学分析 被引量:1 2017年 Dof转录因子是植物特有的一类转录因子,含有一个独特的单锌指结构域,在植物的生长发育中起重要的调控作用。以甘蓝型油菜为试材,采用电子克隆和RT-PCR技术,以期克隆一个具有Zf-Dof结构域的蛋白基因cDNA序列。结果表明:该基因含有1284bp的开放阅读框,编码427个氨基酸,蛋白分子量为46.9kDa,等电点为8.86,为亲水性蛋白。经序列比对分析表明其与拟南芥CDF3基因有较高同源性,可能具有相似的功能。 尹明智 胡燕关键词:甘蓝型油菜 电子克隆 生物信息学 甘蓝型油菜BnaWRKY30-like基因cDNA序列克隆及生物信息学分析 被引量:1 2020年 WRKY转录因子是植物所特有的一个超级基因家族,能调控植物生长发育过程及逆境反应。根据转录组测序获得的EST序列设计引物,利用RT-PCR及RACE技术克隆了甘蓝型油菜WRKY30基因cDNA全长序列,并运用生物信息学手段对序列进行了分析及预测。结果表明:BnaWRKY30-like基因全长cDNA序列中包含102 bp的5′-UTR序列,188 bp的3′-UTR序列以及942 bp的完整ORF,编码313个氨基酸。该转录因子蛋白相对分子量为35319.85D,等电点为6.22,基本氨基酸中含量最高的丝氨酸(Ser),313个氨基酸中含有41个酸性氨基酸,34个碱性氨基酸,在121~182区域含有一个典型的WRKY结构域。亚细胞定位预测发现该转录因子定位于细胞核的可能性最高。蛋白质的二级结构预测表明共有α-螺旋占26.20%,延伸链占10.54%,β-转角占4.47%,无规则卷曲占58.79%。BnaWRKY30-like基因编码的蛋白具有典型的WRKY转录因子特征,与拟南芥WRKY30基因亲缘关系近,可能在油菜早期生长发育过程及盐胁迫中的发挥调控作用。 尹明智 胡燕关键词:甘蓝型油菜 WRKY转录因子 基因克隆 RACE技术 生物信息学分析 油菜细胞质雄性不育系1193A恢复基因SNP位点的TSP分析 2020年 油菜细胞质雄性不育杂种是当前油菜杂种优势利用的主要途径,而恢复基因的连锁标记研究对于恢复系的选育和改良至关重要。本研究基于前期研究结果设计引物对与油菜细胞质雄性不育系1193A恢复基因连锁的2个SNP位点进行TSP标记分析,以期建立一种简单高效易行的油菜雄性不育系1193A恢复基因的SNP分析方法。结果表明,设计的2对TSP标记引物扩增效果较好,可用来进行后续的研究分析。 胡燕 尹明智 冶飞碟 詹启文 张桂兰关键词:油菜 不育系 恢复基因 TSP