李珍
- 作品数：1 被引量：6H指数：1
- 供职机构：北京市农林科学院蔬菜研究中心更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 辣椒EST-SSR信息分析及标记开发被引量：6
- 2010年
- 利用SSRIT软件从NCBI数据库中19 173条辣椒EST序列中筛选到612个SSR,检出率为3.19%。共观察到51种重复基元,其中三核苷酸基序是主导类型,占总SSR的60.46%;AG/GA/CT/TC,AAG/AGA/GAA/CTT/TTC/TCT,TAAT,ATATA和CTGCTC分别是二、三、四、五和六核苷酸基序的优势重复基序,在所有SSR中的出现频率各自为13.40%、16.18%、1.80%、3.27%及2.12%。辣椒EST-SSR以5~10次重复为主,基序长度集中在15~20 bp范围内。利用含SSR的576条EST序列共设计357对引物,在合适的PCR条件下337（94.40%）对引物显示出清晰条带,75对（21.01%）引物表现多态性,表明EST-SSR标记在辣椒遗传分析与应用中是有价值且可行的。
- 张宇张晓芬陈斌耿三省李焕秀李珍
- 关键词：辣椒ESTSSR
