陈燕丽
- 作品数：3 被引量：4H指数：1
- 供职机构：中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心传染病预防控制国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- HIV-1B'亚型毒株感染者Nef蛋白氨基酸序列变异分析被引量：3
- 2015年
- 目的分析HIV-1 B’亚型毒株Nef蛋白重要功能区及CTL表位氨基酸序列变异特征。方法从137例HIV-1感染者的血浆样本中提取病毒RNA,进行逆转录获得c DNA,再经巢式PCR扩增全长Nef基因并纯化测序。利用Bio Edit、Mega6.0软件分析所获得的Nef基因重要功能区的氨基酸变异,并比较所获得的Nef基因共享序列与我国B亚型Nef共享序列及国际B亚型Nef共享序列的CTL表位情况。结果 HIV-1 B’亚型毒株Nef蛋白N端豆蔻酰化信号区、蛋白酶加工区、酸性区、Pak结合区、Pxx P区等功能区氨基酸序列较为保守,但有3个功能区中存在变异率大于30%的氨基酸位点,其中长度可变区的21号密码子上的R被E/K/Q取代的变异率达56.21%(R21E 24.09%,R21K 19.71%,R21Q 12.41%),COPI结合区EE154-155的E154被K取代的变异率为32.85%,双亮氨酸基序Exxx LL160-165的S163被C取代率为30.66%。本研究所得的137条Nef蛋白的共享序列的CTL表位与我国HIV-1 B亚型的共享序列CTL表位一致,而与国际B亚型共享序列相比有两个肽段表位的氨基酸发生了变异。结论 HIV-1 B’亚型毒株Nef蛋白多数重要功能区及CTL表位的氨基酸序列较保守,但有3个功能区存在变异率大于30%的氨基酸位点,这种特性可能影响病毒致病作用。
- 陈燕丽胡园园郝金娟任莉邵一鸣洪坤学
- 关键词：HIV-1NEF蛋白功能区CTL表位
- 人类免疫缺陷病毒Ⅰ型B'亚型感染者人类白细胞抗原Ⅰ类基因对病毒载量的影响被引量：1
- 2014年
- 目的探讨人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-1)B′亚型感染者人类白细胞抗原(HLA)-A、-B、-C位点等位基因的分布及其对病毒载量的影响。方法对146例HIV-1B′亚型感染者采用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)扩增方法进行HLA-A、-B、-C位点等位基因检测,计算各位点等位基因的频率及其对感染者病毒载量的影响。结果在146例HIV-1B′亚型感染者中分别检出HLA-A位点14个等位基因,-B位点24个等位基因,-Cw位点12个等位基因,其中频率大于0.1的等位基因为HLA-A*02,-A*11,-A*24,-A*30,-B*13,-B*40,-B*51,-Cw*03,-Cw*06,-Cw*08;HLA-A、-B、-C等位基因纯合子携带者的病毒载量高于杂合子(P=0.0013);HLA-A*03(P=0.0314)、-A*30(P=0.0072)、-B*13(P=0.0087)、-Cw*06(P=0.0145)等位基因携带者具有较低病毒载量。结论 HIV-1B′亚型感染者HLA-A*03、-A*30、-B*13、-Cw*06等位基因与低病毒载量相关。
- 马永莉陈燕丽郝金娟阮玉华邵一鸣洪坤学
- 关键词：人类免疫缺陷病毒人类白细胞抗原病毒载量
- HIV-1 B’亚型感染者Nef蛋白CTL表位变异与病毒载量的相关性
- 2016年
- 目的探讨HIV-1 B’亚型毒株感染者Nef蛋白细胞毒性淋巴细胞(cytotoxic T lymphocyte,CTL)表位变异及其与病毒载量的相关性。方法从137例HIV-1 B’亚型毒株感染者的血浆样本中提取病毒RNA,经逆转录及巢式PCR扩增获得Nef基因并测序,将获得的Nef基因序列翻译为蛋白序列,然后与HIV免疫学数据库中经过实验证实的CTL表位进行比对,分析Nef蛋白CTL表位变异与感染者病毒载量的关系。结果与HIV免疫学数据库中CTL表位的比较发现,本研究137例HIV-1 B’亚型毒株感染者病毒Nef蛋白大部分CTL表位相对保守,只有5个表位的变异频率超过10%,CTL表位旁序列的变异程度较锚着位点变异大,表位旁上下游第一位氨基酸的突变频率较高,表位氨基酸总变异频率、锚着位点和表位旁序列的氨基酸变异频率与病毒载量呈正相关,非锚着位点氨基酸的变异与病毒载量无相关性。结论 HIV-1 B’亚型毒株感染者Nef蛋白大部分CTL表位较保守,CTL表位旁序列变异程度较锚着位点大,表位旁上下游第一位氨基酸的突变频率较高,推测表位旁序列氨基酸的变异可能是Nef蛋白CTL逃逸突变的主要方式,Nef蛋白CTL表位变异与病毒适应性损伤的关系还需进一步研究。
- 胡园园陈燕丽张岱邹森侯佳莉任莉郝彦玲
- 关键词：HIV-1NEF蛋白CTL表位病毒载量
