李晓萍
- 作品数：6 被引量：25H指数：3
- 供职机构：中国水产科学研究院黄海水产研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家科技部农业科技成果转化资金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 三疣梭子蟹微卫星富集文库的构建及五个野生地理群的多样性分析
- 本文采用富集文库-菌落原位杂交法构建了三疣梭子蟹微卫星富集文库,分离筛选出30对扩增条带清晰稳定,多态性较高的引物,选取其中8对引物对我国由南到北五个群体(舟山、海州湾、青岛即墨会场、莱州湾、鸭绿江口)的野生三疣梭子蟹的...
- 李晓萍
- 关键词：三疣梭子蟹富集文库微卫星野生群体多样性
- 三疣梭子蟹5个野生群体的遗传多样性分析
- 本研究采用微卫星标记对我国沿海5个的地方的三疣梭子蟹群体遗传结构进行分析，8个位点的平均等位基因数为9.0，平均期望杂合度He。为0.7508。表明三疣梭子蟹群体的遗传多样性较为丰富。
- 李晓萍刘萍
- 关键词：三疣梭子蟹野生群体微卫星标记
- 三疣梭子蟹微卫星多重PCR技术建立及条件的优化被引量：10
- 2011年
- 选择三疣梭子蟹22个多态性高的微卫星标记,经过引物间的搭配、组合测试以及反应条件的优化(退火温度、Mg2+含量、dNTPs的浓度等参数),构建了多重PCR扩增技术体系。本研究最终建立了47个二重PCR组合,并在47个二重引物的组合基础上建立15个三重PCR组合,3个四重PCR组合。该多重PCR技术体系的建立为三疣梭子蟹品种选育、种系评估提供快速、有效分子检测技术。
- 任宪云刘萍李健李晓萍韩智科刘磊
- 关键词：三疣梭子蟹SSR
- 三疣梭子蟹微卫星富集文库的构建与群体遗传分析被引量：8
- 2011年
- 采用富集文库–菌落原位杂交法分离了30个三疣梭子蟹（Portunus trituberculatus）的微卫星标记。三疣梭子蟹基因组DNA经HaeⅢ酶切连接后,用固定了（AC）15和（AG）15探针的尼龙膜（Hybond N＋）捕捉含有微卫星的片段,转化至大肠杆菌DH5α中,构建三疣梭子蟹微卫星富集文库。菌落原位杂交后,任意选取150个克隆进行测序,阳性克隆率为85.48%。利用软件设计了105对微卫星引物,筛选到稳定扩增标记56对,采用30个三疣梭子蟹个体进行多样性评价,30个位点均表现出多态性。观测杂合度（Ho）、期望杂合度（He）及多态性信息含量（PIC）的范围分别为0.222 2-1.000 0、0.436 7-0.909 9和0.350-0.892。本研究筛选的微卫星位点将为下一步三疣梭子蟹遗传多样性分析、家系分析、遗传图谱构建和QTL定位等研究提供基础依据。
- 李晓萍刘萍宋协法
- 关键词：三疣梭子蟹富集文库微卫星标记
- 应用SSR分析5个三疣梭子蟹野生群体的遗传多样性被引量：8
- 2011年
- 利用本实验室筛选的8个微卫星分子标记,对中国舟山(ZS)、海州湾(HZ)、青岛会场(HC)、莱州湾(LZ)和鸭绿江口(YL)5个三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)野生群体共计120个个体进行了遗传多样性分析。结果显示,8个位点共扩增到72个等位基因,平均等位基因数为9.0,平均有效等位基因数为5.467 7;平均多态信息含量为0.696 7;平均期望杂合度(He)为0.750 8。5个群体的期望杂合度由高到低依次为LZ(0.770 4)、HC(0.758 8)、YL(0.755 2)、HZ(0.741 5)、ZS(0.728 3)。卡方检验可知,34个群体位点组合符合Hardy-Weinberg平衡,占总数的85%。5个群体间的遗传距离在0.245 1～0.517 9之间,HC和HZ的遗传距离最小,LZ和ZS的遗传距离最大;通过构建UPGMA聚类树,发现5个群体聚为南北两大支,HC和HZ两个群体遗传距离最近先聚到一起,再与ZS群体相聚,形成南方群体;YL与LZ群体相聚形成北方群体,最后南北两大群体聚为一支。分析群体间的Fst值可知,两两群体间的Fst值在0.054 8～0.108 3(0.05
- 李晓萍刘萍李健高保全
- 关键词：三疣梭子蟹野生群体微卫星
- 三疣梭子蟹5个野生群体的遗传多样性分析
- 利用本实验室筛选的8个微卫星分子标记,对我国舟山、海州湾、青岛会场、莱州湾和鸭绿江口5个三疣梭子蟹野生群体共计120个个体进行了遗传多样性分析。结果显示,8个位点共扩增到72个等位基因,不同引物获得的等位基因数从6～12...
- 李晓萍刘萍李健高保全
- 关键词：野生群体三疣梭子蟹
- 文献传递
