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袁永娜
作品数:
21
被引量:4
H指数:1
供职机构:
兰州大学
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
自动化与计算机技术
理学
医药卫生
生物学
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合作作者
刘振宇
兰州大学
张瑞生
兰州大学化学化工学院
胡荣静
兰州大学化学化工学院
王欣
兰州大学
阮晓芳
兰州大学化学化工学院
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作者
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袁永娜
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刘振宇
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胡荣静
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王欣
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张瑞生
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一种学习分子表征的自监督方法及系统
本发明公开了一种学习分子表征的自监督方法及系统,方法包括:S1、从PubChem中抽取分子的化学结构编码,生成预处理数据集;S2、基于transform er encoder构建用于预训练的初始深度学习模型InChINe...
袁永娜
康佳和
刘振宇
一种针对多靶标生成具有特定性质的分子的方法
本发明公开了一种针对多靶标生成具有特定性质的分子的方法,包括:获取分子数据、蛋白质靶点及其对应配体数据,其中蛋白质靶点数据为期望生成的分子可以靶向的两个蛋白质靶点;基于蛋白质靶点和对应蛋白质靶点的配体数据,构建化合物‑靶...
袁永娜
潘晓航
ARDGPR模型预测RNA中原子多极距的计算方法
本发明涉及基于ARDGPR模型预测RNA中原子高阶多极距的计算方法:通过量子力学计算软件Gaussian09优化所有RNA分子小片段的结构,并通过AIMALL软件积分计算分子中原子的高阶多极距;对每一种小分子片段,选择部...
袁永娜
刘振宇
文献传递
基于并行式深层细粒度模型预测药物靶标结合性的方法
本发明公开基于并行式深层细粒度模型预测药物靶标结合性的方法,包括:获取药物、蛋白质、疾病的数据集,基于数据集,通过并行计算训练预测模型,并对训练好的预测模型进行验证;获取药物靶标数据,通过验证后的预测模型对药物靶标数据进...
袁永娜
张宇豪
孟祥博
刘振宇
基于GECo模型预测化合物-蛋白质亲和力的计算方法
本申请公开了基于GECo模型预测化合物‑蛋白质亲和力的计算方法,包括以下步骤:获取数据集中的化合物‑蛋白质对数据;对所述化合物‑蛋白质对分别进行处理,分别得到化合物分子特征和蛋白质分子特征;将所述化合物分子特征和所述蛋白...
袁永娜
王欣
刘振宇
改进分子力场中静电能项的精确度:通过多极距计算RNA中原子间静电相互作用能
RNA性质的计算研究一般是通过分子力学方法来定义分子势能。用于RNA模拟的分子力场通常是通过点电荷来计算原子间静电作用能,而这并不符合原子的电子云分布的实际情况。事实上,原子的电子云分布是随着分子结构不同变化的,而并不是...
袁永娜
张壮壮
Matthew J.L. Mills
关键词:
RNA
文献传递
一种基于Wfold模型的RNA二级结构预测方法
本发明公开了一种基于Wfold模型的RNA二级结构预测方法,包括以下步骤:从数据库中选取已知的RNA二级结构数据并进行预处理和划分,获得训练数据集和测试数据集;构建Wfold神经网络模型,将训练数据集作为输入对模型进行训...
袁永娜
杨恩杰
基于人工智能的药物分子生成方法
本发明公开了一种基于人工智能的药物分子生成方法,涉及药物研发技术领域,包括以下步骤,收集已知药物分子的结构数据进行SMILES编码,使用生成对抗网络深度学习架构来构建药物分子生成模型;利用损失函数训练模型;从一个随机分布...
张展博
袁永娜
QSPR/QSAR在化学、药物化学和环境科学中的应用研究
定量结构-性质/活性关系(Quantitative Structure-Property/ActivityRelationship,QSPR/QSAR)方法是目前非常热门的研究领域之一,它主要应用各种统计学方法和分子结构...
袁永娜
关键词:
化学信息学
最小二乘支持向量机
药物化学
环境科学
文献传递
一种基于Transformer模型预测DNA G-四链体形成倾向的方法
本发明公开了一种基于Transformer模型预测DNA G‑四链体形成倾向的方法,包括:提取核酸序列信息和G‑四链体位点信息,构建数据集;构建用于预测DNA G‑四链体形成倾向的Transformer深度学习模型;基于...
袁永娜
刘振宇
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