韩东升
- 作品数：20 被引量：126H指数：8
- 供职机构：浙江大学医学院附属第一医院更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生文化科学生物学更多>>
- 病原体宏基因组高通量测序医院实验室本地化之路:现状和挑战被引量：16
- 2022年
- 病原体宏基因组高通量测序(mNGS)检测流程高度复杂,对环境、设备和人员技术能力要求高。如何在本地化有序发展、规范管理及合理使用mNGS技术,是从业者必须审慎对待的科学课题。本文对mNGS医院实验室本地化系统的建立模式,检测系统的分析性能确认,来自生物因子、检测流程、生物信息学分析及信息传输的风险管理,以及适用于临床的病原体数据库、生物信息学分析人才和诊断报告的需求等几个层面的问题进行了思考和讨论,以促进mNGS在医院内规范应用和健康发展。
- 韩东升马筱玲吴文娟
- 关键词：宏基因组病原体高通量测序技术
- 宏基因组高通量测序在支气管肺泡灌洗液中鉴定非结核分枝杆菌的临床价值
- 2025年
- 目的评估宏基因组高通量测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)在非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)鉴定中的价值。方法回顾性分析浙江大学医学院附属第一医院2021年2月至2024年1月358份NTM阳性的支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)mNGS结果,包括NTM菌种分布,混合病原体检出情况,以及常规分枝杆菌检测方法的检出情况。结果8份标本未能精确到物种水平,350份标本成功鉴定出15种NTM菌种,总计362株NTM,以胞内分枝杆菌(37.3%,135/362)、脓肿分枝杆菌(26.8%,97/362)和鸟分枝杆菌(11.0%,40/362)最常见,其次是堪萨斯分枝杆菌(8.0%,29/362)和龟分枝杆菌(7.7%,28/362)。339份样本仅检出1种NTM,11份样本同时检出2种或3种NTM。53.4%(191/358)的BALF样本同时检测到了NTM以外的微生物,包括铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌、烟曲霉等常见病原体,以及嗜肺军团菌、马尔尼菲蓝状菌等难以通过常规培养方法快速鉴定的病原体。83.2%(298/358)的mNGS阳性结果支持NTM感染的诊断,29.3%(105/358)的阳性结果促使启动抗NTM治疗,而16.8%(60/358)的NTM检出被认为是定植或与临床感染无关。在接受抗酸染色、分枝杆菌液体培养及DNA微阵列芯片法检测的样本中,NTM的阳性率分别为31.5%(73/232)、48.7%(57/117)和43.0%(46/107)。结论mNGS在NTM鉴定和混合感染检测方面具有优势,但其同时检出多种微生物的特性增加了确定主要病原体的难度,须结合临床和影像学资料完成结果解读。
- 郑杰媛张丹周杰挺王婧超袁凌军谢梦晓李滨潇韩东升
- 关键词：非结核分枝杆菌肺炎支气管肺泡灌洗液
- 2011～2014年某院CR-AB及MRSA菌株的临床分布及耐药分析被引量：4
- 2015年
- 目的了解该院医院感染致病原中耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌(CR-AB)和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的临床分布特征和耐药现状,合理指导临床使用抗菌药物。方法回顾性分析2011年1月至2014年3月该院住院患者CR-AB和MRSA的医院感染情况,利用纸片扩散法对收集的菌株进行药敏试验。结果共检出CR-AB 170株,主要分布在ICU病房,占61.17%(104/170);MRSA 168株,主要分布在神经外科,占27.98%(47/168)。痰液是CR-AB和MRSA最主要的标本来源,分别占67.06%和54.17%。CR-AB对多数抗菌药物的耐药率均达到50.00%以上,但对头孢派酮/舒巴坦(27.65%)、米诺环素(21.18%)、丁胺卡那霉素(19.41%)和妥布霉素(12.35%)耐药率低于30.00%,未发现耐多黏菌素的菌株;MRSA对利奈唑烷、万古霉素和替加环素100.00%敏感,对呋喃妥因和奎努普汀/达福普汀的耐药性也较低(<2.00%)。结论 CR-AB和MRSA的耐药性较为严重,应加强对重点感染病房的管理,合理选择抗菌药物,以防止CR-AB和MRSA等多重耐药菌株的传播。
- 王广洲韩东升汤惠周林
- 关键词：医院感染耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌耐甲氧西林金黄色葡萄球菌
- 院内感染中多重耐药菌的临床分布及耐药分析被引量：8
- 2014年
- 目的了解耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌(CR-AB)和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)在某院院内感染中的临床分布和耐药情况,指导临床合理选用抗菌药物。方法回顾性分析2011-2012年该院住院患者CR-AB和MRSA的感染情况,利用纸片扩散法对收集的菌株进行药敏试验。结果共检出CR-AB 60株,主要分布在ICU病房,占60.00%(36/60);MRSA 81株,主要分布在神经外科,占37.04%(30/81)。痰液是CR-AB和MRSA最主要的标本来源,分别占71.67%和56.79%。CR-AB对多数抗菌药物的耐药率均达到50.00%以上,但对米诺环素(26.67%)、丁胺卡那霉素(21.67%)、妥布霉素(16.67%)耐药率均低于30.00%,未发现耐多粘菌素的菌株;MRSA对利奈唑烷、万古霉素和替加环素100.00%敏感,对利福平、呋喃妥因和奎努普汀/达福普汀的耐药性较低(<30.00%)。结论CR-AB和MRSA的耐药性较为严重,应加强对重点感染科室的重点管理,根据药敏结果,合理选择抗菌药物,以控制CR-AB和MRSA等多重耐药菌株的传播。
- 韩东升韩崇旭薛小萍
- 关键词：耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌耐甲氧西林金黄色葡萄球菌
- 耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌目标性监测被引量：11
- 2017年
- 目的了解耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)的临床分布和耐药特征。方法回顾性分析某院2015年1—12月所有住院患者送检标本CRAB检出情况,分析其药敏试验结果。结果 721株AB中检出CRAB231株,CRAB检出率为32.04%。1—4季度中每季度CRAB的检出率分别为48.99%(73/149)、41.98%(68/162)、27.39%(63/230)、15.00%(27/180),呈下降趋势(P<0.001)。CRAB主要来源于痰标本(140株,60.61%),其次是创面分泌物(33株,14.28%)和尿标本(24株,10.39%)。CRAB主要来源科室为重症监护病房(101株,43.72%)、神经外科(37株,16.02%)及烧伤整形科(22株,9.52%)。CRAB对氨苄西林/舒巴坦、庆大霉素、左氧氟沙星、环丙沙星的耐药率为85.28%~90.48%,对妥布霉素的耐药率较低(19.48%),未发现对多粘菌素B耐药的菌株。结论 CRAB耐药性较为严重,应针对重点科室进行重点管理,采取科学防控举措,有效减少医院感染事件的发生。
- 刘红梅韩崇旭朱小平韩东升
- 关键词：鲍曼不动杆菌耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌CRAB耐药性
- 浙江省急性腹泻患儿中肠道病毒检测分析研究被引量：15
- 2013年
- 目的探讨浙江省急性腹泻患儿的常见病毒组成。方法采集5岁以下(≤5岁)急性腹泻患儿的811份粪便标本,采用ELISA方法检测A组轮状病毒(RV),应用多重PCR方法同时检测B/C组RV、诺如病毒(NoV)、札如病毒(SaV)、肠道腺病毒(AdV)、星状病毒(AstV),并利用RT-PCR对RV的阳性标本进行G、P分型。结果811份粪便样本中,RV、NoV、SaV、AdV及AstV总的阳性比例分别为25.52%、18.37%、4.44%、2.71%和1.23%;65份(8.01%)混合感染标本中以RV和NoV混合感染所占比例最大(56.92%);116份RV的G/P分型中,G3型(37.93%)、G1型(32.75%)和P[8]型(57.76%)是RV的优势型别,且G3/P[8](27.59%)是混合感染最主要的组合。结论浙江省五种常见腹泻病毒及其混合感染的流行状况,为临床治疗和疾病监测提供参考价值。
- 陈平许志良崔大伟谢国良杨先知韩东升郑书发余斐陈瑜
- 关键词：肠道病毒急性腹泻
- 2009-2012年医务人员职业暴露现状分析被引量：18
- 2015年
- 目的了解医院医务人员发生职业暴露的现状,提高医务人员安全防护意识,减少职业暴露事件的发生。方法对2009年1月1日-2012年12月31日发生的142起医务人员职业暴露事件发生人群、暴露源、暴露类型及处理措施等进行统计分析。结果护士是职业暴露最主要的人群,占50.70%,进修、实习生群体居次,占23.94%。锐器伤为导致暴露的主要原因,占到94.37%,暴露源主要为乙型肝炎、梅毒和丙肝,分别占51.41%(73起)、20.42%(29起)和5.63%(8起)。所有职业暴露相关医务人员在暴露发生后均能按规定流程紧急处理伤口,暂未发现因职业暴露而感染相关疾病。结论加强对医务人员,特别是进修生及实习生的岗前培训,增强医务人员职业暴露防护意识,严格执行标准预防原则,预防锐器伤,可有效预防或减少职业暴露的发生。
- 薛小萍韩崇旭韩东升
- 关键词：医务人员锐器伤
- 全自动血液分析仪在体液细胞计数中的应用被引量：5
- 2019年
- 目的:探讨希森美康XN-10[B4]全自动血液分析仪在体液细胞计数中的应用。方法:随机抽取住院患者体液标本100例,分别用仪器法(希森美康XN-10[B4])和手工法(牛鲍氏计数板)进行计数分类,对这两种方法的结果进行分析。结果:体液中白细胞个数在(9±5)×10~6/L时,细胞计数结果差异有统计学意义(P<0.05),体液中白细胞个数在(379±250)×10~6/L时,结果差异无统计学意义(P>0.05),体液中白细胞个数在>(1287±209)×10~6/L时,结果差异亦无统计学意义(P>0.05)。胸腹水和脑脊液分别根据标本颜色的不同以及有无血性进行结果检测分析,差异均无统计学意义(P>0.05)。两种方法结果具有良好的相关性。同时两种方法对体液白细胞单个核差异无统计意义(P>0.05)。结论:仪器法(Sysmex XN-10[B4])效率高,精密度高,适合大批量操作,可替代部分手工法检测,但有时仍需显微镜的辅助,具有非常好的社会应用价值。
- 王薇孙业富韩东升
- 关键词：全自动血液分析仪体液细胞计数
- 我国东南沿海地区儿童急性腹泻患者病毒学病原谱研究
- 目的了解我国东南沿海地区5岁以下门诊腹泻患儿中以上五种病毒以及混合感染情况的流行病学和临床学特征,为我国的病毒性腹泻的防控工作带提供当前有价值的数据支持。方法 2010年1月至12月期间,收集浙江、江苏和福建三省共七家哨...
- 韩东升陈瑜李中杰
- 关键词：急性腹泻病原谱病毒学
- 临床副溶血弧菌血清型及基因分型特征研究被引量：6
- 2016年
- 目的了解本地区腹泻患者中副溶血弧菌（VP）血清型及分子分型特征,为VP感染的防控提供科学参考。方法对2010~2014年收集到的62菌株进行血清型分型;采用PCR检测溶血素相关毒力基因（tdh和trh）;利用多位点序列分型（MLST）进行分子分型。结果 62株菌株分属7种不同的血清型,O3∶K6型居首,共46株,占74.19%,其次是O4∶K68（6株）。毒力相关基因检测发现tdh阳性株占95.16%（59株）,而trh阳性者仅3株。分子分型确定7种STs,其中ST3型占85.50%（53株）,其他ST型散在分布。结论 O3∶K6血清型VP是本地区最主要的分离株,大多携带tdh毒力基因,ST3型是优势流行型别。
- 印晓静徐薇韩东升
- 关键词：副溶血弧菌毒力基因血清型基因分型
