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粟绒
作品数:
2
被引量:1
H指数:1
供职机构:
苏州大学医学部基础医学与生物科学学院
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相关领域:
生物学
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合作作者
张青
苏州大学医学部基础医学与生物科...
史全良
苏州大学医学部基础医学与生物科...
焦淑静
苏州大学医学部基础医学与生物科...
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苏铁珊瑚根共生念珠藻ITS序列多拷贝研究
2014年
目的:研究苏铁珊瑚根共生念珠藻16SrDNA-23SrDNA基因间隔序列(ITS)拷贝数。方法:提取苏铁珊瑚根共生念珠藻全DNA,PCR扩增其16SrDNA-23SrDNA基因间隔序列(ITS)克隆并测序;采用Cluster X 1.83对所得序列进行比对,用DNAman软件对比对结果进行人工校正;采用割胶回收电泳检测、菌液PCR及混合模板PCR扩增三种方法验证ITS-L2。结果:ITS-S(420 bp)不含任何氨基酸编码序列,ITS-L1(676 bp)包含一个异亮氨酸和一个丙氨酸编码序列;ITS-L1和ITS-L2在琼脂糖凝胶电泳检测时长度分别为676 bp和1000 bp,而谱带经克隆测序后结果表明ITS-L1和ITS-L2碱基序列和长度几乎相同,仅有两个碱基发生变异。结论:ITS-L2为假阳性,可能是由ITS-S和ITS-L1形成的异源双链;苏铁珊瑚根共生念珠藻含有两种类型的ITS拷贝,一种是含有tRNAIle和tRNAAla编码序列的ITS,另一种是不含tRNAIle和tRNAAla编码序列的ITS。
粟绒
焦淑静
黄现恩
张青
史全良
关键词:
ITS序列
假阳性
协同进化
蓝藻16S rRNA-23S rRNA基因间隔区序列(ITS)多拷贝分析
提取12个蓝藻样品(实验室编号为S1-S12)全DNA,PCR扩增16S rRNA-23S rRNA基因间隔序列(ITS)并测序;采用Cluster X1.83对所得序列进行比对,并对比对结果进行人工校正;采用割胶回收电...
粟绒
关键词:
蓝藻
ITS序列
基因表达
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