李超
- 作品数:24 被引量:74H指数:6
- 供职机构:西北农林科技大学动物科技学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中国博士后科学基金陕西省科学技术研究发展计划项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 陕西榆林市7县(区)绒山羊疾病调查被引量:2
- 2016年
- 为了掌握陕西省榆林市绒山羊疾病的发生、流行和防控情况,以便于为绒山羊疾病防控措施的制定提供参考,于2015年8月深入榆林市重点县区,通过走访当地管理部门、实地调查和调查问卷的方式对绒山羊疾病进行专题调研。结果表明,榆林市7县(区)绒山羊疾病种类无明显地域性差别,传染性疾病引起的痢疾、呼吸道疾病和羔羊流产发病率较高,危害较大;普通性疾病中,因饲养管理因素导致的营养代谢性疾病所占比重最大,表现为一定的季节性,冬春季发病较多;寄生虫病发病率较低,调查过程中仅发现个别羊只患有疥藓。因此,榆林市7县(区)绒山羊疾病种类多且复杂,以传染性疾病和普通性疾病为主,多数疾病的发生与不科学的饲养管理有很大关系,大部分养殖场(户)"以防为主"的理念和意识依然薄弱。
- 李超代少华武召珍冯翠霞陆江一赵宝玉陈玉林董强
- 关键词:绒山羊疾病
- 奶牛CRY 1基因真核表达载体构建、生物信息学分析及组织表达谱研究
- 2023年
- 【目的】扩增奶牛隐花色素昼夜节律调节因子1(cryptochrome circadian regulator 1,CRY1)基因全长编码区(coding sequence,CDS),构建该基因的真核表达载体并对其进行生物信息学分析,检测奶牛CRY 1基因的表达谱,为后续探究CRY1蛋白的生物学功能提供参考。【方法】以奶牛肝脏组织cDNA为模板,PCR扩增CRY 1基因CDS区,将其与酶切线性化的pcDNA3.1-3HA空质粒以同源重组法连接,重组质粒命名为pcDNA3.1-3HA-cCRY1;利用在线软件对奶牛CRY 1基因进行生物信息学分析。将空质粒pcDNA3.1-3HA和重组质粒pcDNA3.1-3HA-cCRY1转染至HEK293T细胞,利用Western blotting技术检测奶牛CRY 1基因在蛋白水平的表达;利用实时荧光定量PCR检测CRY 1基因在奶牛不同组织中的表达量。【结果】试验成功获得1764 bp的奶牛CRY 1基因CDS区序列,且成功构建pcDNA3.1-3HA-cCRY1真核表达载体。奶牛CRY 1基因与牦牛、山羊、绵羊相似性在98%以上,且遗传距离较近。生物信息学分析表明,CRY1蛋白为碱性、亲水性蛋白,无跨膜结构与信号肽,存在45个潜在磷酸化位点,与CLOCK、ARNTL、FBXL3等多个蛋白存在互作。Western blotting结果表明,pcDNA3.1-3HA-cCRY1转染组在72 ku处出现明显的条带,而pcDNA3.1-3HA转染组在相应位置处无条带。实时荧光定量PCR结果表明,CRY 1基因在奶牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏等10个组织中均有表达,其中在心脏中的表达量最高,在颈斜方肌中的表达量最低。【结论】本研究成功构建了CRY 1基因的真核表达载体,且在HEK293T细胞中实现了CRY1蛋白的过表达。CRY1蛋白是一种不稳定的胞内蛋白,可与多种蛋白互作,并参与昼夜节律调控、细胞代谢、糖异生等过程。CRY 1基因在牛、羊等反刍动物间较为保守,在奶牛多种组织中均有表达。研究结果为深入探究CRY1蛋白在奶牛生物钟系统中的转录调控机制提供参考依据。
- 李丹张海森王逸群高登科赵泓淙李超李超靳亚平
- 关键词:奶牛生物信息学组织表达谱
- DHA通过Wnt/β-catenin信号通路调控草鱼脂肪细胞分化的转录组学研究
- 为深入探究DHA(Docosahexaenoic acid)对草鱼脂肪细胞分化的影响及机制,分别用BSA(对照组)和100 μ M DHA(处理组)处理汇合后的草鱼前体脂肪细胞,在第2天和第7天收集细胞,提取mRNA,进...
- 田晶晶刘品吉红孙健李超黄吉芹
- 关键词:二十二碳六烯酸草鱼脂肪细胞脂质蓄积
- 奶牛生物钟基因CLOCK的真核表达载体构建、生物信息学分析及其组织表达谱
- 2023年
- 旨在克隆奶牛昼夜运动输出周期(circadian locomotor output cycles kaput,CLOCK)基因的蛋白编码区序列(coding sequence,CDS),构建该基因的真核表达载体,检测CLOCK基因在奶牛不同组织的相对表达丰度,并预测分析奶牛CLOCK蛋白的高级结构、理化性质及其功能特征。以奶牛肝脏组织cDNA为模板,通过PCR扩增奶牛CLOCK基因CDS区片段,利用同源重组法将其连接至pcDNA3.1-Puro-N-3HA载体;经酶切与测序鉴定后,将鉴定正确的质粒命名为pcDNA3.1-Puro-N-3HA-bCLOCK;将pcDNA3.1-Puro-N-3HA空质粒和pcDNA3.1-Puro-N-3HA-bCLOCK重组质粒分别转染至HEK293T细胞,通过蛋白质免疫印迹(Western blot)检测CLOCK蛋白的过表达效率;提取奶牛的心、肝、脾、肺等10个组织的总RNA并反转录为cDNA,以此为模板通过实时定量PCR(real-time quantitative PCR,qPCR)检测CLOCK基因在奶牛不同组织的表达变化;同时,利用生物信息学软件对奶牛CLOCK基因及其编码蛋白进行功能预测分析。琼脂糖凝胶电泳结果显示,成功克隆了奶牛CLOCK基因全长CDS区片段。酶切与测序结果显示,pcDNA3.1-Puro-N-3HA-bCLOCK真核表达载体构建成功。Western blot结果表明,该真核表达载体在HEK293T细胞中成功表达HA-CLOCK融合蛋白。qPCR结果表明,CLOCK基因在心、肝、脾、肺等10个组织中均有表达,其中在心脏表达最高,在小肠表达最低。生物信息学分析结果表明,奶牛CLOCK基因的CDS区与绵羊、山羊、骆驼的相似性较高;奶牛CLOCK蛋白由845个氨基酸组成,分子质量为95.12 kDa,无跨膜结构域与信号肽,为亲水性蛋白,二级结构中富含α-螺旋;奶牛CLOCK蛋白的三级结构与绵羊、人和小鼠的差异极小。结论:本研究成功克隆了奶牛CLOCK基因全长CDS区片段并构建了其真核表达载体,qPCR检测CLOCK基因在奶牛不同组织的表达谱,通过生物信息学预测分析CLOCK蛋白的结构与功能特性,为进一步探究奶牛CLOCK基因的生物学功能提�
- 杨王浩王博刘薇刘薇董浩张粉丽张粉丽李超李超刘祖培靳亚平陈华涛
- 关键词:奶牛真核表达载体生物信息学分析
- 不同贮藏方式对桃果实品质的影响被引量:6
- 2009年
- 采用不同方式对桃果实进行贮藏试验结果表明,采后果实有机酸是一个先迅速下降,然后逐步回升再逐渐下降的过程,在贮藏20 d左右,糖含量最大,而有机酸含量却最低;贮藏20 d后,糖含量急速下降,而有机酸含量却缓慢回升,在贮藏30 d后,CA和CA+C2H4处理桃果实有机酸含量显著地高于MA处理果实,达到了较高品质的贮藏保鲜目的。
- 李超
- 关键词:贮藏
- 草鱼LXRα基因的克隆及表达研究被引量:4
- 2014年
- 【目的】克隆草鱼肝X受体α亚型(Liver X Receptor α,LXRα)cDNA序列,分析其在草鱼不同组织中的表达情况及n-3 HUFA对草鱼肝胰脏LXRα基因表达的影响。【方法】以草鱼肝胰脏组织为材料,采用RT-PCR技术对其LXRα基因cDNA进行克隆分析,运用生物信息学的方法分析该基因序列同源性。检测LXRα基因在草鱼10种组织中的表达情况。以含0.52% n-3 HUFA的饲料饲喂草鱼95 d后,用实时定量PCR法检测n-3 HUFA对肝胰脏LXRα表达的影响。【结果】克隆得到了草鱼LXRα cDNA序列(GenBank注册号为:FJ965309),其ORF序列长度为1 230 bp,编码409个氨基酸,预测该蛋白分子式为C2083H3343N581O611S30,分子质量为47 263.7 u,等电点pI为7.91,半衰期为30 h。该蛋白质具有哺乳动物的LXRS特征:包括DNA结合位点(DBD)、p-box,配体结合域 (LBD)、激活功能-2(AF-2)区域、D-box、D区域(D region) 和属于2个锌指结构的8个半胱氨酸;与其他物种LXRα的同源性为70.7%~100%,其中与鲤鱼和斑马鱼的同源性分别达100%和94.6%。LXRα基因在草鱼肝胰脏、肌肉、心脏、鳃、精巢、肾脏、脑、脾脏、肠、腹腔脂肪等10种组织中均有表达,其中在精巢中表达水平最高(P<0.05),在肌肉中表达水平最低 (P<0.05);饲喂n-3 HUFA可显著抑制草鱼肝胰脏LXRα基因的表达水平(P<0.01)。【结论】克隆获得了草鱼LXRα基因cDNA序列,该基因在多种组织中均可表达,其编码的氨基酸序列与其他物种相似性较高,在动物进化中比较保守;n-3 HUFA可通过影响草鱼肝胰脏LXRα基因的表达,调控草鱼的脂质代谢。
- 李超刘品曹艳姿吉红林亚秋
- 关键词:草鱼
- 奶牛RORα基因的生物信息学分析与组织表达谱检测
- 2023年
- 本研究旨在克隆奶牛(Bos taurus)维甲酸相关孤儿受体α(retinoic acid-related orphan receptor alpha,RORα)的蛋白编码序列(coding sequence,CDS),预测分析其结构与功能特征并验证其真核表达载体在HEK293T细胞中的过表达效果,进一步检测RORα基因在奶牛不同组织的表达谱。本研究提取了奶牛肝脏组织的总RNA,反转录得到cDNA,经过PCR扩增后获得奶牛RORα基因的CDS区片段,随后将其与pcDNA3.1-Puro-N-3HA线性化载体进行同源重组连接。转化感受态细胞DH5α后,对初步鉴定为阳性克隆的重组质粒进行测序。结合测序结果,利用ExPASy、Protscale和DNAstar等生物信息学软件,对奶牛RORα蛋白的理化性质和功能特性进行预测分析。将对照组空质粒pcDNA3.1-Puro-N-3HA和试验组重组质粒pcDNA-3.1-3HA-RORα分别转染至HEK293T细胞,借助实时定量PCR和蛋白质印迹法检测奶牛RORα基因的过表达效果。借助半定量RT-PCR技术检测奶牛RORα基因在肝脏、脾脏和肌肉等7个组织的相对表达量。PCR结果显示,成功克隆了奶牛RORα基因的CDS区片段;酶切及测序结果表明重组质粒pcDNA3.1-3HA-RORα构建成功;生物信息学软件预测分析结果表明,奶牛RORα蛋白三级结构与山羊(Capra hircus)、小鼠(Mus musculus)的高度相似;不同物种间同源性比对显示,奶牛RORα基因与山羊的相似性最高;实时定量PCR和蛋白印迹法结果表明,与对照组相比,试验组HEK293T细胞中奶牛RORα基因的mRNA和蛋白表达水平均显著升高;半定量RT-PCR结果表明,在所检测的7个组织中,奶牛RORα基因在肝脏表达量最高,在脾脏表达量最低。本研究成功克隆了奶牛RORα基因的CDS区片段,在HEK293T细胞中验证了其真核表达载体在mRNA和蛋白水平的表达效果,并分析了其结构与功能特征,检测了其在不同组织的表达谱,为深入探究其在奶牛生殖与代谢调控中的作用机制提供了前期基础。
- 刘薇刘薇王逢博王博杨王浩张粉丽高登科张海森李超靳亚平李超
- 关键词:奶牛表达谱生物钟生物信息学分析
- 喹诺酮类药物耐药机制研究进展被引量:7
- 2022年
- 喹诺酮类属于合成的广谱抗菌药,用于治疗与肠杆菌科相关的各种感染性疾病。近几十年来,喹诺酮类药物的广泛使用和过度使用导致了喹诺酮耐药菌株的出现。喹诺酮类药物耐药的产生是一个复杂的多因素过程,主要的耐药机制包括染色体介导的一个或多个靶点基因突变改变靶点酶的药物结合力;AcrAB-tolC多耐药外排泵的过表达和孔蛋白的改变导致药物摄取减少,外排增加;以及质粒介导的喹诺酮类耐药基因(qnr,aac(6′)-Ib-cr和crpP)、外排泵(如OqxAB和QepA)的存在。论文通过对喹诺酮类药物耐药机制进行综述,以期为探索抗耐药菌株的新药提供参考。
- 李超王明琼赵永攀魏淑娟董强
- 关键词:喹诺酮耐药机制质粒耐药基因
- EPA对草鱼前体脂肪细胞增殖分化的影响被引量:5
- 2013年
- 体外培养草鱼前体脂肪细胞,并用不同浓度(0—100μmol/L)二十碳五烯酸(Eicosapentaenoic acid,EPA)进行处理,噻唑兰比色法(Methyl thiazolte trazoliu,MTT)和油红O染色提取法检测EPA对细胞增殖及分化的影响,Real-time qPCR检测过氧化物酶增殖激活受体家族(Peroxidase proliferation activated receptor,PPARs)、脂蛋白酯酶(Lipoprotein lipase,LPL)、过氧化物酶体增殖激活受体γ辅助活化因子1α(Peroxisome prolifera-toractivated receptor gamma coactivator-1α,PGC-1α)等基因的表达情况。结果显示,不同浓度EPA在2d内均显著促进草鱼前体脂肪细胞增殖(P<0.05);不同浓度EPA处理1d后均显著抑制草鱼前体脂肪细胞分化(P<0.05),且100μmol/L EPA处理细胞2d可显著促进LPL和PGC-1α基因的表达(P<0.05)。研究表明,EPA可促进草鱼前体脂肪细胞增殖,抑制其分化,该抑制作用与其调控PGC-1α、LPL等脂代谢基因的表达有关。
- 刘品吉红李超黄吉芹Marijana Todorcevic
- 关键词:草鱼前体脂肪细胞EPA增殖分化
- 山羊隐花色素2基因真核表达载体的构建及生物信息学分析
- 2022年
- 为了构建山羊隐花色素2(CRY 2)基因的真核表达载体,分析CRY2蛋白的基本特性,本试验采用逆转录PCR扩增山羊CRY 2基因的编码序列(CDS),并以同源重组的方式将其连接至pcDNA3.1-Puro-N-3HA载体,获得pcDNA3.1-3HA-gCRY2重组质粒。酶切和测序鉴定后将重组质粒转染至HEK293T细胞,采用实时荧光定量PCR和蛋白免疫印迹技术检测山羊CRY 2基因在mRNA和蛋白水平的表达变化;同时利用生物信息学软件对CRY2蛋白的基本理化性质和功能进行预测和分析。结果显示:pcDNA3.1-3HA-gCRY2重组质粒的酶切和测序结果与预期一致;转染HEK293T细胞后,pcDNA3.1-3HA-gCRY2转染组CRY 2 mRNA的相对表达量比pcDNA3.1-Puro-N-3HA转染组高600倍左右(P<0.001),CRY2蛋白成功表达;山羊、小鼠和人等哺乳动物CRY 2基因CDS区具有较高的相似性;CRY2蛋白不存在信号肽和跨膜区,预测显示其可能与ARNTL、CLOCK、PER1和PER2等蛋白互作。结果表明,本试验成功构建了山羊CRY 2基因的真核表达载体,并预测分析了山羊CRY2蛋白的基本理化特性,为探究山羊CRY 2基因及其编码蛋白的生物学功能提供了科学依据。
- 马白荣张海森高登科李超靳亚平靳亚平
- 关键词:山羊昼夜节律生物信息学