目的对5个Dysferlinopathy家系进行DYSF基因变异分析,明确其致病原因。方法应用高通量测序技术进行检测,确定可疑变异后应用Sanger测序进行变异位点验证,根据美国医学遗传学及基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)遗传变异分类标准与指南对变异的致病性进行评估。结果高通量靶向测序和Sanger测序结果显示,5个Dysferlinopathy家系中共检测出10个DYSF基因变异位点(5个移码变异、3个剪切区变异、1个错义变异和1个无义变异)。其中c.1375dupA(p.Met459Asnfs*15)、c.610C>T(p.Arg204X)、c.1180+5G>A和c.1284+2T>C为已报道过的致病性变异,而c.4008_4010delCCTinsAC(p.Leu1337Argfs*8)、c.1137_1169del(p.379_390del)、c.754 A>G(p.Thr252Ala)、c.1175_1176insGCAGAGTG(p.Met394Serfs*7)、c.3114_3115insCGGC(p.Arg1040 Profs*74)和c.1053+3G>C为未报道过的新变异,根据ACMG遗传变异分类标准与指南,c.1137_1169del、c.1175_1176 insGCAGAGTG和c.3114_3115insCGGC为致病性变异(PVS1+PM2+PM3),c.4008_4010delCCTinsAC变异为可能致病性变异(PVS1+PM2),c.754A>G和c.1053+3G>C为意义不明确的变异(PM2+PM3+PP3)。结论DYSF基因变异可能为这5个Dysferlinopathy家系患者的致病原因,新变异的检出丰富了DYSF基因变异谱。
目的探讨基因组拷贝数变异测序(copy number variation-sequencing,CNV-seq)的产前诊断指征分布及异常检出情况。方法回顾性纳入2019年1月至2022年12月于郑州大学第一附属医院行产前CNV-seq的17994例孕妇。根据CNV-seq产前诊断指征分为胎儿超声异常组、无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)高风险组、唐氏综合征血清学筛查(简称唐筛)高风险组、不良孕产史组和高龄妊娠组。总结CNV-seq的产前诊断指征、异常(染色体数目异常及结构异常中的致病和可能致病性拷贝数变异)检出率及异常分布情况。采用χ^(2)检验进行统计学分析。结果17994例孕妇中胎儿超声异常、NIPT高风险、唐筛高风险、不良孕产史、高龄妊娠的比例分别为32.65%(5875/17994)、11.90%(2142/17994)、31.62%(5690/17994)、11.70%(2105/17994)和12.13%(2182/17994),异常检出率分别为10.60%(623/5875)、34.64%(742/2142)、4.69%(267/5690)、2.99%(63/2105)和3.67%(80/2182)。总体异常检出率为9.86%(1775/17994),其中染色体数目异常占68.79%(1221/1775),以21-三体为主(49.30%,602/1221);染色体结构异常占31.21%(554/1775),其中致病和可能致病性拷贝数变异分别占57.76%(320/554)和42.24%(234/554),包括416个微缺失和255个微重复。在胎儿超声异常组、NIPT高风险组和高龄妊娠组,染色体数目异常检出率均高于结构异常检出率[6.81%(400/5875)与3.80%(223/5875),χ^(2)=53.10;27.96%(599/2142)与6.68%(143/2142),χ^(2)=338.40;2.43%(53/2182)与1.24%(27/2182),χ^(2)=8.61;P值均<0.01]。微缺失中频率最高的前3位依次为Xp22.31(12.74%,53/416)、22q11.21(7.93%,33/416)和17q12(5.77%,24/416);微重复中频率最高的前3位依次为22q11.21(14.90%,38/255)、17q12(3.53%,9/255)和7q11.23(3.53%,9/255)。结论CNV-seq产前诊断指征中胎儿超声异常占比最高。CNV-seq总体异常检出率较高,尤其是以NIPT高风险为产前诊断指征者的异常检出率最高。染色体结构异常中Xp22.31微缺失和22
