姚维
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 供职机构：广东海洋大学水产学院更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划湛江市科技攻关计划项目广东省科技计划工业攻关项目更多>>
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- 基于线粒体COⅠ及Cyt b基因的7种龙虾类分子系统关系
- 2012年
- 运用PCR法扩增湛江沿海海域7种龙虾的线粒体COⅠ和Cytb基因并对其序列进行分析,以分析7种龙虾的分子系统关系。从7种龙虾中扩增到的COⅠ基因片段长度均为650bp,共存在224个核苷酸位点变异,变异率为35.22%,简约信息位点161个;扩增到的Cytb基因片段长度均为536bp,共存在148个核苷酸位点变异,变异率为29.48%,简约信息位点66个。所有的扩增序列中,没有发现碱基的缺失以及插入,序列中的转换大于颠换,且碱基替换多发生于密码子的第3位。以帝加洛真龙虾(Palinurus delagoae)、普通真龙虾(Palinurus elephas)、吉氏真龙虾(Palinurus gilchristi)为外群,对COⅠ和Cytb两个基因序列采用最大简约法(maximum parsimony,MP)和贝叶斯推论法(bayesian inference,BI)构建龙虾类分子系统树。结果显示:日本龙虾和密毛龙虾亲缘关系比较近,而其它5种龙虾与真龙虾属的3种关系较近,与传统的分类存在一定分歧。
- 姚维刘楚吾刘丽
- 关键词：龙虾线粒体CYT分子系统树
- 波纹龙虾线粒体基因组全序列的测定与分析
- 采用常规PCR扩增法及保守引物步移法测定了波纹龙虾的线粒体基因组全序列.波纹龙虾的线粒体基因组全长15665bp,全序列有具有较高的AT偏向性,AT的含量为67％,其中A的含量最高,C的含量最低.9个编码蛋白基因(ATP...
- 姚维刘丽刘楚吾
- 关键词：编码蛋白TRNA
- 杂色龙虾线粒体基因组全序列的测定与分析被引量：2
- 2014年
- 为了解杂色龙虾(Panulirus versicolor)线粒体基因组多态位点及遗传变异,对龙虾类的分类研究奠定基础,作者通过常规PCR步移扩增法获得杂色龙虾线的线粒体基因组全序列,分析了其线粒体基因组的基本特征以及基因排列情况,并结合中国龙虾(Panulirus stimposni)、波纹龙虾(Panulirus homarus)线粒体基因组全序列,综合分析了龙虾属线粒体编码基因多态位点及基因变异状况。结果表明:杂色龙虾线粒体基因组全序列为15 700 bp,由13个蛋白质编码基因、22个t RNA基因、2个r RNA基因和D-loop区组成,保持了泛甲壳动物线粒体基因组的原始排列。杂色龙虾线粒体DNA的碱基组成具有AT偏好性,A+T含量为67%,4种碱基的含量分别为(A=34.6%,T=32.1%,C=20.5%,G=12.8%)。预测了杂色龙虾18个t RNA以及2个r RNA的二级结构。龙虾属线粒体基因组中的nad 2、nad 5基因以及D-loop区的多态位点比例较高,适合作为分子标记用于龙虾类系统进化关系、种内多态性以及遗传分化等方面的研究。
- 刘皓姚维刘海情刘楚吾刘丽
- 关键词：线粒体基因组RNA二级结构
