倪琪
- 作品数:4 被引量:6H指数:1
- 供职机构:西南大学更多>>
- 发文基金:中央高校基本科研业务费专项资金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 快速检测家蚕微孢子虫的引物对及其试剂盒和检测方法
- 本发明涉及快速检测家蚕微孢子虫的引物对及其试剂盒和检测方法,其引物对的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.7和SEQ?ID?NO.8所示,利用该引物对在上、下游引物分别加入不同的核酸分子标记物,标记引物的PCR产物能够直接用...
- 潘国庆倪琪周泽扬孙滨宋跃
- 家蚕核型多角体病毒CQ1分离株与T3株的单核苷酸多态性分析(英文)
- 2016年
- 依据基因组中的单核苷酸多态性(SNPs)位点对不同来源家蚕核型多角体病毒(Bm NPV)进行地理株系溯源,有利于Bm NPV的分子流行病学研究以及对病害流行的预防性控制。采用霰弹法对Bm NPV重庆分离株CQ1进行全基因组测序,获得了1 052条reads序列,测序深度为3.5倍,覆盖基因组95%以上的区域。采用生物信息学方法,将这些序列与Bm NPV日本分离株T3的基因组序列进行比对分析,在2个株系间共鉴定获得400个候选SNPs。与T3株基因组唯一位点匹配的386个SNPs中,有77%的SNPs属于转换,23%的SNPs属于颠换;15个SNPs位于基因间区,其余都分布在基因编码区;115个非同义SNPs(c SNPs)分布于67个基因的编码序列中,其中11个基因有至少3个非同义SNPs,例如CQ1分离株的非必需基因orf74有5个非同义SNPs。结构预测显示,CQ1分离株的几丁质酶基因中3个非同义SNPs引起变化的氨基酸位点均位于几丁质酶的三维结构表面。研究结果表明,Bm NPV CQ1和Bm NPV T3株系之间存在丰富的单核苷酸多态性。
- 潘国庆李田许金山张永华倪琪周泽扬
- 关键词:家蚕核型多角体病毒BAC-TO-BAC系统病毒增殖
- 快速检测家蚕微孢子虫的引物对及其试剂盒和检测方法
- 本发明涉及快速检测家蚕微孢子虫的引物对及其试剂盒和检测方法,其引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示,利用该引物对在上、下游引物分别加入不同的核酸分子标记物,标记引物的PCR产物能够直接用...
- 潘国庆倪琪周泽扬孙滨宋跃
- 文献传递
- 家蚕微孢子虫核酸侧向层析试纸条检测方法的建立
- 家蚕微孢子虫(Nosema bombycis)是一种家蚕常见的致病真菌,其引发的家蚕微粒子病是蚕桑产业中毁灭性的病害,因此家蚕微孢子虫一直被各养蚕国家和地区列为法定的蚕业生产检疫对象。为有效控制蚕业生产中因家蚕微孢子虫引...
- 倪琪
- 关键词:家蚕微孢子虫