王晓雪
- 作品数：37 被引量：24H指数：2
- 供职机构：中国科学院南海海洋研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金基础研究重大项目前期研究专项广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学天文地球医药卫生环境科学与工程更多>>
- SXT/R391元件介导海洋细菌间互作的功能研究
- 海洋细菌在环境中主要以生物被膜的群落结构存在。可移动遗传元件介导基因片段的横向转移，使细菌可从近缘或远源物种中快速获得新基因以适应环境，是海洋细菌间互作的重要方式。
- 王鹏霞曾振顺王伟权王晓雪
- 关键词：生物被膜可移动遗传元件
- 细菌的毒素-抗毒素系统:定时炸弹还是免死金牌被引量：2
- 2017年
- 毒素-抗毒素系统(Toxin-antitoxin system,TA)在细菌和古菌的染色体和可移动遗传元件中广泛分布,目前分为六大类型(I型-VI型)。研究发现TA能够促进多重耐药菌群的形成,同时参与细菌的程序性死亡、调控生物被膜形成、介导细菌环境适应过程等多个重要的生命过程。TA的研究主要集中在肠道细菌和病原菌中,其中II型TA研究最为深入和广泛。本文综述了近年来新型TA的鉴定、毒素新型作用靶点、抗毒素的调控功能以及TA间的相互作用等进展,并对未来的TA领域的潜在发展趋势和应用前景也进行了评述。
- 郭云学李百元王晓雪
- 关键词：毒素-抗毒素系统生物被膜多重耐药菌环境胁迫
- 造礁珊瑚共附生微生物信号分子的研究进展被引量：3
- 2019年
- 珊瑚礁是海洋中最重要的生态系统之一,具有极高的初级生产力.然而在全球气候变化和人类活动的双重压力影响下,其健康和稳定性受到不断的挑战.造礁珊瑚及其共附生微生物共同组成"珊瑚-微生物"共生体,共附生微生物和珊瑚的健康密切相关.化学信号分子介导的微生物间及微生物和宿主间的相互作用是珊瑚共附生微生物群落演变的内在驱动力.文章总结了几类重要的造礁珊瑚共附生微生物的信号分子,包括N-酰基高丝氨酸内酯(N-acyl homoserine lactone, AHL)类的密度感应(quorum sensing, QS)信号分子、二甲基巯基丙酸内盐(dimethylsulfoniopropionate, DMSP)、一氧化氮(nitric oxide, NO)以及活性氧(reactive oxygen species, ROS)在微生物间以及微生物和珊瑚互作中媒介作用的研究进展,比如AHL信号分子介导的微生物间的协作和竞争、DMSP和NO介导的微生物和宿主的相互作用以及环境胁迫下珊瑚和微生物对ROS响应过程,并探讨了未来研究方向.珊瑚共附生微生物可影响珊瑚的环境适应能力,进一步深入研究信号分子传导通路的分子机制可从驯化珊瑚共附生微生物群落的角度为造礁珊瑚礁生态系统恢复和保护提供新思路.
- 汤开浩王嫣王晓雪
- 关键词：造礁珊瑚微生物信号分子密度感应DMSP
- 两种蓝细菌中7对毒素-抗毒素系统的分析和鉴定
- 2022年
- 蓝细菌(cyanobacteria)是一类能进行放氧光合作用的原核生物。蓝细菌生长速度较快,几乎存在于所有的陆地和水生环境中。毒素-抗毒素(toxin-antitoxin,TA)系统在原核生物中分布十分广泛,在细菌的生命活动中扮演了重要的角色如维持水平基因转移元件的稳定性以及应对环境胁迫压力等。已有的基因组分析表明,蓝细菌基因组中含有大量潜在的毒素-抗毒素系统,但是目前对蓝细菌毒素-抗毒素系统的实验鉴定仍较少。本文分别以淡水和海水代表菌株集胞藻PCC6803(Synechocystis sp.PCC6803)和聚球藻WH7803(Synechococcus sp.WH7803)为研究对象,对二者基因组上的毒素-抗毒素系统进行预测,并选取预测结果中的7对潜在的毒素-抗毒素系统进行实验验证。结果表明,集胞藻PCC6803的两对毒素-抗毒素系统BAD01932-1933和BAA18559-New ORF7中的毒素具有明显的细胞毒性。本文的研究结果有助于后续对蓝细菌毒素-抗毒素系统及其生态和生物学功能的研究。
- 林世团王晓雪陈冉
- 关键词：毒素-抗毒素系统蓝细菌集胞藻PCC6803
- Shewanella oneidensis内源性大质粒上ParE-ParD家族毒素-抗毒素系统(SO_A0088-A0087)的鉴定
- 2018年
- 毒素-抗毒素系统在原核生物中分布十分广泛,在细菌的生命活动中扮演了重要的角色,如维持水平基因转移元件的稳定性以及应对环境胁迫等。然而目前对于来自生态环境菌株中的毒素-抗毒素系统的研究仍较少。文章鉴定了自然水体环境来源的菌株ShewanellaoneidensisMR-1携带的内源性大质粒上的一对ParE-ParD家族Ⅱ型毒素-抗毒素系统SO_A0088-A0087。毒素SO_A0088在大肠杆菌以及原宿主S. oneidensis内均具有明显的细胞毒性,并导致细胞分裂存在缺陷。抗毒素SO_A0087能够完全拮抗毒素的毒性。同时,凝胶电泳迁移率实验(electrophoretic mobility shift assay,EMSA)证实抗毒素SO_A0087能够结合自身的启动子。另外,文章还通过易错突变的方法找到了毒素SO_A0088的3个毒性关键位点。
- 赵玄玉施斐王晓雪
- 关键词：毒素-抗毒素系统SHEWANELLA质粒
- 海洋假交替单胞菌SM9913中基因岛GIPspSM9913的鉴定和功能研究
- 2023年
- 海洋细菌由于所处环境的复杂性和多变性,进化出独特的环境适应机制。基因岛通常携带宿主细菌环境适应性有关的基因,在推动细菌环境适应性和基因组多样化中起重要作用。假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)在各种海洋生境中广泛分布,具有重要的工业应用价值和生态修复潜力。文章以深海沉积物中分离的假交替单胞菌SM9913为研究对象,通过与表层海水中分离的假交替单胞菌TAC125进行比较基因组学分析,发现SM9913基因组上yicC基因内部整合了一个18kb的基因岛,我们命名为GIPsp SM9913。该基因岛编码整合酶、切离酶以及多套限制修饰系统。数据库检索分析发现GIPsp SM9913同源的基因岛在假交替单胞菌、希瓦氏菌(Shewanella)、弧菌(Vibrio)和气单胞菌(Aeromonas)等细菌中广泛存在。定量PCR结果显示,当切离酶表达时,GIPsp SM9913会从基因组上大量切离,产生无基因岛的SM9913突变株。测序分析表明,GIPsp SM9913的切除不会影响整合位点侧翼基因的表达。比较切离突变株与野生菌的运动能力、电转化频率和接合转移效率等,发现GIPsp SM9913可以提高宿主细菌的泳动能力和对外源DNA入侵的抵御能力。
- 王鹏霞赵逸杜晓飞王伟权王晓雪
- 关键词：海洋细菌假交替单胞菌环境适应性
- 一种调控珊瑚菌群的温和噬菌体VneM1及其应用
- 本发明公开了一种调控珊瑚菌群的温和噬菌体VneM1及其应用。噬菌体<I>Vibrio </I><I>neocaledonicus bacteriophage</I> VneM1，保藏号：GDMCC NO.61215‑B1...
- 王晓雪王伟权王鹏霞汤开浩
- 文献传递
- 高效热稳定的核糖核酸酶SiRe_0902在特异性识别GG位点中的应用
- 本发明公开了高效热稳定的核糖核酸酶SiRe_0902在特异性识别GG位点中的应用。其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示，核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。核糖核酸酶SiRe_0902具有非常高效且专一的水解RN...
- 姚建云王晓雪冯旭佘群新
- 一种天然存在的融合蛋白形式的TA系统SO_1440基因及其在真核细胞病毒感染控制中的应用
- 本发明公开了一种天然存在的融合蛋白形式的TA系统SO_1440基因及其在真核细胞病毒感染控制中的应用。该融合蛋白SO_1440来自海洋希瓦氏菌Shewanella oneidensis。本发明发现：融合蛋白SO_1440...
- 王晓雪姚建云陈喆
- 海洋储碳机制及相关生物地球化学过程研究策略被引量：18
- 2022年
- 1碳中和国家战略需要海洋负排放支撑工业革命以来,人类活动导致大气CO_(2)激增,加剧了气候变化,引发一系列社会、经济和环境问题.第75届联合国大会以来,习近平总书记在一系列重大场合多次强调,我国二氧化碳排放力争于2030年前达到峰值,努力争取2060年前实现碳中和.这个重大举措不仅大大提升了我国的国际话语权,也吹响了我国科技-产业-政策联合攻关的“集结号”.
- 焦念志戴民汉翦知湣王晓雪张锐
- 关键词：二氧化碳排放生物地球化学过程国际话语权气候变化
