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徐晓明

作品数：14 被引量：2H指数：1
供职机构：山东大学更多>>
相关领域：自动化与计算机技术语言文字生物学电子电信更多>>

合作作者

文献类型

  • 11篇专利
  • 3篇学位论文

领域

  • 8篇自动化与计算...
  • 1篇生物学
  • 1篇电子电信
  • 1篇语言文字

主题

  • 9篇基因
  • 5篇聚类
  • 4篇生物基因
  • 4篇数组
  • 4篇后缀数组
  • 4篇基因序列
  • 4篇哈希
  • 4篇哈希函数
  • 3篇生物数据
  • 3篇相似度
  • 3篇相似度计算
  • 3篇矩阵
  • 3篇基因组
  • 2篇增强型
  • 2篇生成树
  • 2篇数据库
  • 2篇双缓冲
  • 2篇碰撞检测
  • 2篇转置
  • 2篇子序列

机构

  • 14篇山东大学

作者

  • 14篇徐晓明
  • 11篇刘卫国

年份

  • 2篇2024
  • 2篇2023
  • 3篇2022
  • 1篇2021
  • 3篇2020
  • 1篇2019
  • 1篇2017
  • 1篇2014
共 14 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
一种生物基因序列的概要数据生成方法及系统
本公开提供了一种生物基因序列的概要数据生成方法及系统，获取待处理的基因序列；将待处理的基因序列利用滑动窗口进行K‑mer分解，将M个K‑mer及其对应的M个反向互补链的K‑mer进行对比，对每对正向、反向K‑mer，选取...
刘卫国林浩然徐晓明殷泽坤
基于多核平台的二阶盲源分离并行优化方法及系统
本发明公开了一种基于多核平台的二阶盲源分离并行优化方法及系统，包括以下步骤：接收环境变量参数，设置CPU线程亲核性；接收待处理信号，对待处理信号进行多线程并行预处理；合并多个可并行计算区域，进行联合近似对角化；输出分离矩...
刘卫国刘美洋殷泽坤徐晓明
文献传递
超长基因序列的相似性快速比对方法及系统
本公开公开了超长基因序列的相似性快速比对方法及系统，获取超长参考基因序列；对超长参考基因序列构建增强型系数后缀数组ESSA；获取超长待查询基因序列；对超长待查询基因序列构建增强型系数后缀数组ESSA；将超长参考基因序列的...
刘卫国秦梓恒殷泽坤徐晓明刘美洋
文献传递
一种生物基因序列的概要数据生成方法及系统
本公开提供了一种生物基因序列的概要数据生成方法及系统，获取待处理的基因序列；将待处理的基因序列利用滑动窗口进行K‑mer分解，将M个K‑mer及其对应的M个反向互补链的K‑mer进行对比，对每对正向、反向K‑mer，选取...
刘卫国林浩然徐晓明殷泽坤
文献传递
基于高效相似度算法的大规模生物数据分析与处理研究
随着新一代测序技术的发展,在最近的十多年中,生物数据的规模正在以远超摩尔定律的速度增长。在这个过程中积累了大量的生物基因数据,这些数据为生物学的研究提供了宝贵的实验依据的同时也带来了巨大的挑战。在多数的基因数据分析流程尤...
徐晓明
关键词：相似度计算
基于生成树的大规模生物数据聚类方法及系统
本发明提出了基于生成树的大规模生物数据聚类方法及系统，属于大规模基因组数据的数据处理技术领域，解决目前计算效率低的问题，包括：估计基因组序列之间的相似度；基于估计基因组序列之间的相似度流式计算基因组序列之间的距离矩阵和构...
刘卫国徐晓明殷泽坤
双缓冲模型实现大规模数据库聚类方法及系统
本发明公开了双缓冲模型实现大规模数据库聚类方法及系统，针对基因序列数据库进行长度递减排序；构建匹配字典：稀疏后缀数组，将一条基因序列构建稀疏后缀数组，作为字典，其它基因序列与字典后缀数组进行匹配，匹配过程中在查询序列的某...
刘卫国徐晓明
文献传递
超长基因序列的相似性快速比对方法及系统
本公开公开了超长基因序列的相似性快速比对方法及系统，获取超长参考基因序列；对超长参考基因序列构建增强型系数后缀数组ESSA；获取超长待查询基因序列；对超长待查询基因序列构建增强型系数后缀数组ESSA；将超长参考基因序列的...
刘卫国秦梓恒殷泽坤徐晓明刘美洋
基于生成树的大规模生物数据聚类方法及系统
本发明提出了基于生成树的大规模生物数据聚类方法及系统，属于大规模基因组数据的数据处理技术领域，解决目前计算效率低的问题，包括：估计基因组序列之间的相似度；基于估计基因组序列之间的相似度流式计算基因组序列之间的距离矩阵和构...
刘卫国徐晓明殷泽坤
文献传递
基于SIMD的哈希函数的基因序列快速分类方法及系统
本公开公开了基于SIMD的哈希函数的基因序列快速分类方法及系统，包括：基于单指令多数据流SIMD改进的哈希函数，构建已知基因序列的哈希值列表；基于单指令多数据流SIMD改进的哈希函数，构建待分类序列的哈希列表；基于已构建...
刘卫国徐晓明殷泽坤
文献传递
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