吴欣 作品数:12 被引量:19 H指数:3 供职机构: 上海海洋大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 轻工技术与工程 生物学 更多>>
瘤背石磺表皮生长因子基因的克隆、结构及进化分析 被引量:2 2017年 首次在瘤背石磺(Onchidium struma)中克隆得到一种新的表皮生长因子(EGF)的cDNA序列全长。EGF基因cDNA的全长为1158bp,命名为Os-egf1,其中开放阅读框长度为846 bp,编码一条包含281个氨基酸残基的多肽链。根据氨基酸序列比对和结构域分析结果发现其含有2个保守的EGF结构域和1个EGF-like结构域,每个结构域中均包含至少6个半胱氨酸残基,且形成CX7 CX4-5 CX10-13CXCX8 C结构,其结构域由C1~C3、C2~C4和C5~C6之间形成的3个二硫键维持,符合表皮生长因子家族及其相关蛋白的特征结构域,但其余氨基酸序列与现有相关基因差异较大,推测可能是一种新的EGF-like基因。利用MEGA6.0软件构建Os-egf1与EGF家族相关蛋白的系统进化树,表明EGF家族蛋白具有一定的物种特异性。 杨铁柱 沈和定 史艳梅 刘欣 吴欣 李杰关键词:EGF 基于转录组测序的4种石磺SSR和SNP开发 石磺科(Onchidiidae)是软体动物门(Mollusca)、腹足纲(Gastropoda)、肺螺亚纲(Pulmonata),缩眼目(Systellommatophora)的贝类,主要分布于热带或亚热带地区的海岸、滩... 吴欣 沈和定 王冬凤 祝红钗关键词:石磺 转录组 基于Illumina HiseqTM 2000高通量转录组测序的里氏拟石磺SSR标记开发 被引量:2 2015年 为给石磺科贝类系统进化研究和资源保育工作提供更有效的分子标记,使用Illumina Hiseq TM2000高通量测序技术对里氏拟石磺进行转录组测序,以所得的拼接序列为基础,利用MISA和SSR Hunter1.3软件进行微卫星序列的查找,对选出的51个微卫星位点进行引物设计,经PCR扩增得到单一清晰扩增条带的位点24个,研究湛江里氏拟石磺群体扩增。结果表明,其中14个位点表现多态性。14个多态性位点得到的等位基因数为2~4,其中观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.031 3~0.714 3和0.031 3~0.708 4,多态性信息含量(PIC)为0.089 5~0.640 5,14个位点中的2个位点表现为高度多态性(PIC〉0.5),10个位点表现为中度多态性(0.5〉PIC〉0.25),另外2个位点表现为低度多态性(PIC〈0.25)。经Sequential Bonferroni校正的Hardy-Weinberg平衡检验,9个位点不偏离平衡(P〉0.05)。开发的SSR标记可用于里氏拟石磺群体遗传学和石磺科贝类间的系统发生研究,并为里氏拟石磺的群体种质保护提供数据支持。 吴欣 沈和定 王冬凤 刘宸 杨铁柱 刁亚关键词:转录组 微卫星标记 响应面法优化胃蛋白酶酶解瘤背石磺肌肉蛋白工艺参数 被引量:4 2015年 为了优化胃蛋白酶酶解瘤背石磺肌肉工艺参数,以温度、p H、时间和液固比为试验因子,以水解度为响应值,在单因素试验的基础上,根据Box-Behnken中心组合设计试验原理,采用4因素3水平的响应面试验设计确定最佳工艺条件。结果表明,最佳酶解工艺参数为温度35℃,p H 1.5,时间2 h,液固比93 m L·g-1。经过验证,实际水解度为11.38%,与理论值的RSD为0.26%。 刁亚 沈和定 程知庆 姚理想 吴欣 杜文俊关键词:瘤背石磺 胃蛋白酶 响应面 紫色疣石磺微卫星标记及筛选方法 本发明公开了一种紫色疣石磺微卫星标记及筛选方法;包括:构建紫色疣石磺转录组测序文库,进行Illumina HiseqTM2000双末端测序;基于测序获得的序列,经MISA对微卫星位点进行分析、筛选;利用SSRHunter... 史艳梅 顾冰宁 许国绿 吴欣 沈和定文献传递 瘤背石磺肌肉粗蛋白的提取方法 本发明公开了一种瘤背石磺肌肉粗蛋白的提取方法,具体如下:将瘤背石磺解剖后取出内脏,洗净剩余肌肉并搅碎,用石油醚去脂,并用无水乙醇去除石油醚,过滤后烘干至干粉状,称取一定量的干粉,按照一定的固液比加入蒸馏水,调整pH和温度... 刁亚 沈和定 朱敏 史艳梅 刘阿娜 李杰 刘欣 李柏航 杨铁柱 李炼星 程知庆 姚理想 吴欣 杜文俊瘤背石磺的转录组测序及石磺科四属种贝类间的差异表达分析 石磺科(Onchidiidae)属软体动物门(Mollusca)、腹足纲(Gastropoda)、有肺类(Pulmonata)、缩眼目(Systellommatophora),是一种裸露无贝壳、雌雄同体的两栖性贝类。广泛... 王冬凤 祝红钗 沈和定 吴欣 刘宸关键词:瘤背石磺 转录组 瘤背石磺肌肉粗蛋白的提取方法 本发明公开了一种瘤背石磺肌肉粗蛋白的提取方法,具体如下:将瘤背石磺解剖后取出内脏,洗净剩余肌肉并搅碎,用石油醚去脂,并用无水乙醇去除石油醚,过滤后烘干至干粉状,称取一定量的干粉,按照一定的固液比加入蒸馏水,调整pH和温度... 刁亚 沈和定 朱敏 史艳梅 刘阿娜 李杰 刘欣 李柏航 杨铁柱 李炼星 程知庆 姚理想 吴欣 杜文俊文献传递 EGFR相关基因的克隆及其在石磺科四属种贝类间的表达分析 石磺(Onchidiidae)是广泛分布于浅海、潮间带、潮上带、热带雨林和淡水区域的一种裸露无贝壳、雌雄同体的两栖性贝类,具有非常高的经济和食用价值,也被认为是研究海洋无脊椎动物向陆地及淡水进化的典型代表。实验室团队对四... 杨铁柱 沈和定 吴欣 王冬凤 刘宸关键词:表皮生长因子受体 石磺 转录组 EGFR 基于转录组测序的石磺科贝类SSR和SNP两种分子标记的开发 石磺科贝类属于软体动物门,肺螺亚纲,缩眼目,石磺超科。在我国主要有5属6种,目前研究比较多的主要有4种:紫色疣石磺(Peronia verruculata)、里氏拟石磺(Paraoncidium reevesii)、瘤背... 吴欣关键词:石磺 转录组 微卫星