李丽 作品数:24 被引量:93 H指数:6 供职机构: 同济大学医学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 黑龙江省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 交通运输工程 机械工程 文化科学 更多>>
基于分配算法和支持向量机杂交法的疾病候选基因的快速筛选法 微阵列数据具有高维、高噪音和小样本的特点,因此从微阵列数据中识别疾病候选基因是个挑战。本文中我们构建了一种将估计分布算法和支持向量机的相结合的筛选疾病关键基因的方法。我们将此方法应用于弥漫性大B淋巴瘤和肠癌表达谱数据,以... 李丽 陈红梅 刘畅 王芳 张芳芳 白丽华 陈义汉 彭鲁英关键词:支持向量机 关键基因 文献传递 决策树特征基因选择方法对SVM有效性的研究 被引量:22 2004年 基因芯片新兴生物技术为从分子水平上研究疾病的发病机理和临床疾病诊断提供了强有力的手段。其中特征基因选择是疾病模式识别诊断最重要的一个环节 ,但不同的特征基因选择方法往往影响疾病模式分类方法的效能。本研究针对这一问题 ,结合结肠癌基因表达谱数据分析 ,研究了递归决策树特征基因选择集成方法EFST ,对支持向量机 (SVM )模式分类器能力的影响。主要从特征基因选择前后分类器的性能、支持向量的吻合度、错分样本标识的吻合度、对样本均匀翻倍模式分类器的稳定性的影响等四个方面研究EFST特征选择算法对支持向量机模式分类方法的影响 ,同时考察了支持向量机模式分类器的泛化能力。结果表明 :基于决策树特征基因选择算法EFST明显地提高了支持向量机模式分类的效能 ,且支持向量机模式分类器具有很强的泛化能力。 李霞 张田文 李丽 郭政关键词:特征基因 支持向量机 支持向量 生命科学整合课程的实践 被引量:13 2012年 同济大学医学院再生医学系在临床医学专业基础阶段实施了生命科学相关课程的整合并建立了相应的实施体系。结果表明,学生和教师对整合课程是欢迎的;在基础阶段开展"问题导向的学习"(Problem-Based Learning,PBL)是可行的;形成性考试方式的引入显著降低不及格率。生命科学整合课程的初步实践是成功的。 吕立夏 李姣 邵志华 李丽 徐磊 李思光 彭鲁英 徐国彤关键词:生命科学 整合课程 教学改革 DOCC方案治疗小细胞肺癌的近期疗效 被引量:1 1989年 小细胞肺癌(SCLC)是肺癌中易于早期和广泛转移而预后恶劣的一种癌瘤。近年来,随着新的化疗药物联合化疗和综合治疗的进展,小细胞肺癌的近期疗效和长期无病生存率有了显著改善。本文报道我们在1983~1986年间应用DOCC方案治疗SCLC 40例的近期疗效。材料和方法一、病例选择:全部病例均为我院收治的经细胞学及/或病理学检查证实的SCLC病人。年龄在27~61岁之间。男性31例,女性9例。既往曾经化疗及/或手术、放疗的5例,初次治疗的35例。 李丽 白玉贤 汪振源 李乐静关键词:小细胞肺癌 肺肿瘤 基于免疫细胞微环境分析不同心肌病的异质性 2025年 目的通过心脏免疫细胞的单细胞转录组测序(single cell RNA-sequencing,scRNA-seq)和批量转录组测序(bulk RNA-sequencing,RNA-seq)数据联合分析,探究不同类型心肌病的细胞异质性和免疫细胞微环境变化,为心脏免疫治疗提供一定的依据。方法从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)获取人类扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy,DCM)、肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)、缺血性心肌病(ischemic cardiomyopathy,ICM)和健康对照心脏样本的免疫细胞scRNA-seq和RNA-seq数据,使用Seurat、Monocle和clusterProfiler等R包进行单细胞数据分析:数据整合、差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)筛选、细胞类型鉴定、通路富集和拟时序分析等,利用CIBERSORT进行RNA-seq数据的免疫浸润分析。结果整合了健康对照和3种心肌病的心脏免疫细胞scRNA-seq数据,优化筛选后获得19348个细胞,并分为7种免疫细胞类型。分析发现自然杀伤细胞(natural killer cell,NK)在ICM中占比较高,说明NK细胞与心脏炎症高度相关。通过对胸腺依赖淋巴细胞(thymus dependent lymphocyte,T)进行亚型鉴定和拟时序分析,识别了10种T细胞亚型,发现应激反应状态的T细胞仅在ICM中形成拟时序轨迹,并进一步筛选到12个在T细胞各亚型间差异表达并且随拟时序变化的特异性的基因,主要在炎症和免疫调节过程中发挥作用。RNA-seq数据的免疫浸润分析发现,单核细胞(monocyte,MO)在DCM和ICM患者中浸润率较低,CD4+T细胞和M2巨噬细胞(macrophage,Mφ)在HCM患者中浸润率较低,肥大细胞(mast cell,MC)则在HCM患者中浸润率较高。结论发现了3种心肌病的免疫细胞异质性和免疫微环境变化,为探索不同心肌病的机制提供了一定的参考依据。 李春雨 李春雨 胡桑宇 彭鲁英 彭鲁英关键词:免疫细胞 免疫微环境 心肌病 基于Web of Science围生期创伤知情护理文献计量学分析 2025年 目的:探讨围生期创伤知情护理领域的研究热点与趋势。方法:计算机检索Web of Science核心合集中的科学引文索引(SCI)和社会科学引文索引(SSCI)数据库2008年1月1日—2023年10月25日发表有关围生期创伤知情护理相关文献,通过bibliometrix对文献年度发文量、国家和机构、高被引期刊、论文及作者进行统计分析,使用Cite Space 6.2.R4软件对关键词进行共现分析。结果:共纳入278篇文献,年度发文量呈上升趋势,美国是发文量最多的国家,Aparicio E M是该领域最具影响力的作者,高频关键词包括亲密关系暴力、创伤后应激障碍、童年逆境、分娩等,共包含14个关键词聚类和9个关键词突现,演化路径由女性创伤史的识别到围生期的分娩体验。结论:围生期创伤知情护理集中于创伤史的识别与方案构建,随着研究深入,其热点将为围生期护理人员对于创伤知情护理的看法及干预实践。 王梅园 陈新 顾红 李丽关键词:文献计量学 丁酸盐激活CaMKK促进紧密连接重组装的研究 被引量:2 2015年 目的探讨丁酸盐激活AMPK从而调节紧密连接的重组装的途径。方法使用丁酸盐、Ca MKK特异抑制剂(STO-609)处理上皮屏障模型Caco-2细胞,在转钙过程中检测电阻(TER)值、细胞内ATP水平以及Ca MKK和AMPK的磷酸化状况,从而判断丁酸盐促进紧密连接重组装的上游信号通路。结果丁酸盐处理Caco-2细胞后,其TER值显著增高(P<0.05),Ca MKK和AMPK均被磷酸化激活,而上述作用可被STO-609部分减弱。结论丁酸盐可通过钙离子途径磷酸化激活Ca MKK,继而活化AMPK促进紧密连接的重组。 张洁 苗伟 刘畅 康志骞 李丽 彭鲁英关键词:丁酸盐 CACO-2细胞 特征基因挖掘的决策森林方法 被引量:6 2004年 基于决策树的基因芯片数据分析方法以追求样本最大分类正确率为目标,造成大量的部分相关基因被排除,不适用于挖掘复杂疾病的相关基因.为此,提出了特征基因挖掘的决策森林方法:从多组特征子集中识别重要疾病相关基因,每个子集根据自身对目标的分类能力被识别;通过抽样技术产生大量不同结构的训练样本,可以挖掘出高相关或部分相关基因.数值分析结果表明,该方法是生物类型分类和疾病相关基因挖掘的有效工具. 李霞 张田文 饶绍奇 李丽关键词:基因表达谱 基因树 特征基因 基因挖掘 DNA芯片 疾病 G蛋白β3亚单位C825T多态性与房颤的关系 2005年 目的 探讨在中国人群中,G蛋白β3亚单位基因C825T多态位点与家族性房颤及散发性房颤之间的关系。方 法 利用PCR-RFLP技术对20例家族性房颤患者(无亲缘关系的20个家系,每个家系中随机抽取1例患者),93例散 发性房颤患者及284例正常对照组进行基因型分析。结果 (1)家族性房颤组TT基因型频率和T等位基因频率 (40%和60%)均明显高于正常对照组(15.8%和42%)(P0.05)。结论 G蛋白β3亚单 位基因C825T多态性与中国人群家族性房颤相关,825T等位基因可能是家族性房颤的遗传危险因素。 朱茜 杨奕清 刘懿 李丽 周秦蜀 陈义汉关键词:G蛋白 多态性 房颤 结肠癌术后辅助化疗的临床疗效(附127例分析) 被引量:2 1989年 结肠癌是胃肠道中常见的恶性肿瘤,尽管类癌与肉瘤也可在结肠部位发生,但远不如结肠癌发病率高,其发病率在胃肠道恶性肿瘤中仅次于胃癌,直肠癌,居第三位,近年来有逐渐增高的趋势。本文总结了我院一九七五年至一九八五年施行手术治疗并经病理检查证实的结肠癌病人,术后辅助化疗50例(简称辅化组) 李乐静 李丽 刘晓民 贾素文 魏志仁 白玉贤 李永学 汪振源关键词:结肠癌 辅助化疗 手术 疗效