魏大勇
- 作品数:22 被引量:28H指数:4
- 供职机构:西南大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 与甘蓝叶片表皮毛有无紧密相关的分子标记及其应用
- 本发明属于分子生物学技术领域,具体涉及与甘蓝叶片表皮毛有无紧密相关的分子标记及其应用。本发明的目的是为甘蓝品种选育提供一种新选择。本发明的技术方案是甘蓝叶片表皮毛有无紧密相关的分子标记Boltrichome‑caps01...
- 梅家琴钱伟魏大勇李月华
- 文献传递
- 鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记及其开发方法和应用
- 本发明属于分子生物学技术领域,具体涉及一种鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记及其开发方法和应用,本发明公开一种鉴定甘蓝表皮毛有无的分子标记Bol.trichome‑CAPS.02,具有如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列,...
- 魏大勇汤青林 李晟男王志敏钱伟
- 文献传递
- 一种植物离体茎杆接种鉴定菌核病抗性的方法
- 本发明涉及一种植物离体茎杆接种鉴定菌核病抗性的方法,即将植物主茎或者分枝砍下,放置在温度和湿度恒定的密闭环境,进行核盘菌接种。通过记录菌斑扩展长度,衡量材料的抗病性强弱。与传统的菌核病茎杆抗性鉴定方法相比较,本发明在可控...
- 钱伟梅家琴丁一娟魏大勇
- 芥菜BjuVAL1基因及其延迟抽薹开花与抗逆性应用
- 本发明公开了芥菜BjuVAL1基因及其延迟抽薹开花与抗逆性应用,涉及植物生物技术领域。本发明通过同源克隆法得到芥菜BjuVAL1基因,通过农杆菌介导法,将BjuVAL1基因过表达载体、RNA干扰载体遗传转化野生型芥菜,结...
- 汤青林刘大坤邓琴霖黄一芳魏大勇王志敏
- 用全基因组关联作图和共表达网络分析鉴定油菜种子硫苷含量的候选基因被引量:4
- 2018年
- 油菜籽饼粕是畜禽养殖中重要的蛋白原料,但饼粕中的硫苷是一种抗营养物质,食用过多会对禽畜产生毒害,因此挖掘油菜籽粒硫苷含量的候选基因对油菜种子低硫苷育种具有重要现实意义。本研究连续4年种植1个含157份材料的油菜自然群体,结合重测序数据对种子硫苷含量进行全基因组关联分析(GWAS),并对15份低硫苷和15份高硫苷材料进行种子发育早期的转录组测序,通过权重基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定种子硫苷含量的候选基因。用GWAS共检测到45个与种子硫苷含量显著相关的SNP,单个位点解释的表型变异为13.5%~23.3%,主要分布在A09、C02和C09染色体的3个区间中,覆盖5个已知的硫苷代谢基因。用WGCNA分析发现高、低硫苷材料之间的2275个差异表达基因,可分为12个基因模块,其中1个模块的基因显著富集在已知的硫苷生物合成途径,对该模块内163个基因的权重分析得到13个候选基因。经检测,GWAS和WGCNA共得到的18个候选基因中,有14个候选基因的表达量与种子硫苷含量显著相关(r=0.376~0.638,P<0.05)。用两种方法鉴定到1个共同的候选基因Bna C02g41790D(基因名MAM1),与该基因连锁的5个SNP构成5种单体型,等位基因效应分析发现,自然群体中63%的材料(99/157)为Hap 5,平均硫苷含量为50.79μmol g^(-1),与另外4种单体型(95.04~110.28μmol g^(-1))存在极显著差异(P<0.01)。本研究结合GWAS和WGCNA两种方法鉴定了油菜种子硫苷含量的候选基因,可为复杂性状候选基因的筛选提供参考。
- 魏大勇魏大勇熊清熊清汤青林李加纳梅家琴
- 关键词:甘蓝型油菜全基因组关联分析转录组测序
- 一种褪黑素在调节芥菜现蕾抽薹中的应用
- 本发明公开了一种褪黑素在调节芥菜现蕾抽薹中的应用,涉及植物培育技术领域。本发明应用方法包括:配制不同高浓度褪黑素溶液;选取饱满的芥菜种子,消毒后,放置在恒温培养箱中催芽;待芥菜种子露白后,放入春化;挑选出芽整齐的种子播种...
- 汤青林刘炼邓琴霖魏大勇王志敏
- 文献传递
- 茎瘤芥BjuDA1<Sup>R356K</Sup>基因及其编码的蛋白与应用
- 本发明涉及植物分子生物学领域,公开了一种含单突变位点的茎瘤芥(榨菜)BjuDA1基因及其克隆方法和应用。本发明通过同源克隆法得到茎瘤芥BjuDA1基因cDNA的编码区,通过将该cDNA第1067位碱基由G变为A,得到单突...
- 魏大勇 赵飒吴杰 管婧汝汤青林王志敏
- 芥菜BjuTPR2基因在调控植物开花期中的应用
- 本发明公开了芥菜BjuTPR2基因在调控植物开花期中的应用,涉及植物生物技术领域,其技术要点为:本发明利用同源克隆法在芥菜中克隆BjuTPR2基因,通过将BjuTPR2基因连接到植物表达载体或干扰载体上,经农杆菌介导转化...
- 汤青林黄一芳刘大坤邓琴霖魏大勇王志敏
- 茄子调控植物根系生长发育的基因及其应用
- 本发明属于生物技术领域,具体涉及一个调控植物根系生长发育的基因开发及其应用。该基因的CDS全长序列为1569bp,具有高度保守的结构域。以茄子“三月茄”生长期叶片的cDNA为模板,利用特异性引物序列进行PCR扩增,扩增产...
- 王志敏胡垚李杭春牛义张欣欣魏大勇汤青林
- 甘蓝型油菜polCMS育性恢复位点的全基因组关联分析被引量:9
- 2017年
- 【目的】甘蓝型油菜波里马细胞质雄性不育(pol CMS)在中国已被广泛应用于杂交种育种,其育性恢复程度表现出受1对主效基因的控制,并受微效修饰基因的影响。通过全基因组关联分析方法挖掘育性恢复位点,并对候选基因进行比较分析。【方法】通过芸薹属60K SNP芯片对308份甘蓝型油菜自然群体进行基因型分型,并用pol CMS系301A作母本,与上述材料分别进行杂交得到308份F1,每份F-_1分别于2013年和2014年进行种植,每年2次重复,于始花期根据花粉育性和花蕊发育情况调查F1植株的育性等级,同时对测交父本自然群体进行群体结构分析和亲缘关系评估,并结合测交父本的基因型分型结果和F_1的育性等级进行全基因组关联分析(GWAS)。从GWAS分析中显著的SNP左右100 kb区间或与显著SNP处于同一单体型块(R^2>0.5)的区间内预测候选基因,并对候选基因进行QTL比较分析和单体型或等位基因的效应分析。【结果】方差分析结果显示,两年F_1的育性等级存在显著差异(P<0.01),但相关分析发现,两年的育性等级存在显著的正相关(r=0.52,P<0.001)。群体结构分析显示,所有测交父本被分为3个亚群(冬性、春性和半冬性),亲缘关系分析发现,任何2个材料之间平均亲缘关系值为0.072,73%的任意材料间亲缘关系值小于0.1,其中,约53%的材料亲缘关系值为0。GWAS分析共检测到13个与育性恢复程度显著关联的SNP,构成了6个候选区间,分别位于A01、A09、C03、C06和C08 5条染色体上,单个SNP解释的表型变异介于2.53%—9.96%。从中共预测到6个与育性恢复位点相关的候选基因,其中4个编码的蛋白含有恢复基因特有的PPR保守基序。共线性分析发现,4个候选基因中的2个(Bna A09g46700D和Bna C08g40710D)位于A09和C08染色体部分同源区间,且与已克隆的pol CMS育性恢复位点ORF2同源。另外2个新鉴定到的候选基因(Bna C03g45840D和Bna C06g13000D)连�
- 魏大勇谭传东崔艺馨吴道明李加纳梅家琴钱伟
- 关键词:甘蓝型油菜育性恢复基因全基因组关联分析SNP