庞昕
- 作品数：34 被引量：128H指数：6
- 供职机构：山东大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金山东省自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生环境科学与工程理学更多>>
- 一种提取细菌mRNA的方法
- 本发明公开了一种新的提取细菌mRNA的方法，该方法是先设计针对5S、16S和23S rRNA的保守序列寡核苷酸探针，并进行生物素标记，标记的探针加入到包被链霉亲和素的顺磁颗粒中，再加入细菌总RNA提取液，5S、16S和2...
- 庞昕周冬生杨瑞馥
- 文献传递
- 嗜酸硫杆菌在工农业中的应用被引量：2
- 2022年
- 嗜酸硫杆菌(属)(Acidithiobacillus spp.)能够氧化亚铁、硫或还原性无机硫化合物(reduced inorganic sulfur compounds,RISCs)获得能量,固定二氧化碳,是一类典型的嗜酸性化能自养微生物。嗜酸硫杆菌广泛分布于酸性矿水、热泉等酸性环境中,是地球生态系统硫和铁元素循环的主要推动者。嗜酸硫杆菌独特的生理代谢特征和极端环境适应性,使其广泛应用于生物浸出领域。本文综述了嗜酸硫杆菌的生理代谢特征和极端环境下的适应机制,阐述了嗜酸硫杆菌在工农业中的应用,讨论了面向国家重大需求,嗜酸硫杆菌在今后的主要研究方向和需要解决的关键科学问题,为嗜酸硫杆菌在生理代谢、环境适应和工农业应用的研究提供重要的线索和启示。
- 高雪彦陈林旭陈显轲庞昕潘登林建群
- 关键词：极端环境生物浸出
- 鼠疫耶尔森菌生物型变异遗传基础的研究和新生物型——田鼠型的提出被引量：28
- 2004年
- 目的 探究鼠疫耶尔森菌生物型变异的遗传基础。方法 通过全基因组序列的比较分析 ,鉴定可能与生物型变异相关的基因突变 ,采用DNA测序和位点特异性PCR的方法 ,分析基因突变在鼠疫耶尔森菌自然分离株中的分布。结果 田鼠鼠疫自然疫源地菌株在毒力、生化表型和分子特征上与其他型别鼠疫耶尔森菌相差很大。所有脱氮阴性菌株的napA基因发生了突变 ,所有甘油利用阴性菌株的 glpD基因发生了突变 ,所有阿拉伯糖利用阴性菌株的araC基因发生了突变。结论 提出了一个新的生物型———田鼠型 ;相应糖醇代谢相关基因发生突变是 4个生物型变异的遗传基础。
- 周冬生童宗中宋亚军张玲裴德翠庞昕韩延平李敏崔百忠王津郭兆彪祁芝珍金丽霞翟俊辉杜宗敏王效义汪建黄培堂杨瑞馥
- 关键词：耶尔森氏菌鼠疫生物型突变
- 基于DNA芯片的细菌基因表达谱技术的建立与评价被引量：3
- 2006年
- 目的建立和优化基于全基因组DNA芯片的细菌基因表达谱技术,并用实时定量RT-PCR对此技术平台进行评价。方法提取并纯化鼠疫耶尔森菌总RNA,以六核苷酸随机引物(N6)和/或基因组特异引物(GDP)逆转录合成cDNA,用CY染料直接或间接标记后,与包括鼠疫耶尔森菌4005个ORF的全基因组芯片杂交,通过芯片扫描仪获得表达谱分析结果,归一化后进行分析。结果用实时定量PCR技术验证。结果采用N6+GDP混合引物以间接法标记获得了较为理想的结果,表达谱技术与实时定量PCR技术所得结果高度相关,证明了此技术的可靠性和实验设计与数据分析的合理性。结论合理的设计和归一化的分析方法是基于DNA芯片的细菌基因表达谱分析成功的关键,该技术的建立为细菌功能基因组研究奠定了基础。
- 庞昕韩延平周冬生宋亚军张玲翟俊辉王津郭兆彪杨瑞馥
- 关键词：DNA芯片细菌基因表达谱
- 鼠疫耶尔森氏菌荧光标记扩增片段长度多态性分型方法被引量：5
- 2004年
- 目的建立荧光标记扩增片段长度多态性(FAFLP)技术平台,探讨鼠疫菌基因分型。方法用5种核酸限制性内切酶消化鼠疫菌基因组DNA,选择最佳内切酶组合,酶切片段经接头连接后,用荧光素标记的5条EcoRⅠ引物和9条MseⅠ引物组成的引物配对扩增,选择最佳引物组合,进行系列PCR条件的优化。扩增产物经ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer(遗传分析仪)检测,GeneScan等软件进行分析。结果成功建立FAFLP技术平台。结论FAFLP具有快速、简便、廉价、分辨率高、重复性好和污染少的优点,可用于鼠疫菌的基因分型分析。
- 裴德翠庞昕宋亚军翟俊辉陈泽良刘海洪郭兆彪王津杨瑞馥
- 关键词：鼠疫耶尔森氏菌基因分型聚合酶链反应
- 极端嗜酸性氧化亚铁硫杆菌的无标记基因敲除方法
- 本发明公开了一种基于同源重组原理的极端嗜酸性氧化亚铁硫杆菌无标记基因敲除方法，步骤包括初始质粒、含有要敲除靶基因上下游同源片段的自杀质粒和含酵母核酸内切酶I-SceI基因的诱导质粒的构建，自杀质粒和诱导质粒向嗜酸性氧化亚...
- 刘相梅王慧妍于洋洋刘双双林建群林建强庞昕
- 文献传递
- BP神经网络优化微生物浸矿工艺被引量：1
- 2012年
- 以低品位黄铜矿溶液为原料,浸矿制备Cu2+能有效提高低品位黄铜矿的利用价值。基于浸矿过程中存在多因素影响的现象,通过正交试验与神经网络分析方法,对浸矿条件(接种量、矿石品位、Fe2+添加量及浸矿溶液pH)实行优化。结果表明:在正交试验组中最佳试验结果为浸矿产128.753 mg/L Cu2+;BP神经网络优化后的最佳实验组合为微生物接种量12%、矿石品位0.3%、添加Fe2+24 g/L及浸矿溶液pH 1.7,该条件下验证试验产Cu2+141.352 mg/L,通过正交试验及神经网络优化提高了微生物浸出低品位黄铜矿酸性溶液Cu2+的产量。
- 孙超庞昕
- 关键词：BP神经网络正交设计
- 一种有效提高嗜酸性氧化亚铁硫杆菌硫氧化能力的方法
- 本发明公开了一种有效提高嗜酸性氧化亚铁硫杆菌硫氧化能力的方法，是以如下方式实现：(1)构建重组菌A.ferrooxidans(pJRD215‑taq‑afeI)，实现增加酰基高丝氨酸内酯合成酶基因(afeI)的拷贝数，通...
- 林建群高雪彦陈林旭林建强刘相梅庞昕王瑞
- 文献传递
- 应用套式RT-PCR检测SARS患者血液样品中SARS冠状病毒被引量：1
- 2004年
- 建立了套式RT-PCR方法检测SARS患者血液样品中SARS冠状病毒的方法,并检测血液样品257份。同时将RT-PCR与ELISA检测IgG、IgM的方法进行了比较。结果RT-PCR方法的总检出率为72%,IgG总检出率为68%,IgM总检出率为43%。
- 王效义戴二黑杜宗敏刘海洪韩延平庞昕翟俊辉江凌晓陈泽良邱茂峰王津王宏霞郭兆彪杨瑞馥吴清发李京湘杨玲汪建
- 关键词：检出率SARS冠状病毒SARS患者套式RT-PCRRT-PCR方法ELISA检测
- L.ferriphilum和A.caldus在黄铜矿表面竞争性吸附模型研究
- [目的]建立浸矿微生物嗜铁钩端螺旋菌(Leptospirillum ferriphilum,L.ferriphilum)和嗜酸性喜温硫杆菌(Acidithiobacillus caldus,A.caldus)在黄铜矿表面...
- 庞昕孙超林建强林建群刘相梅
