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CML患者骨髓单个核细胞基因表达谱分析被引量：5: 2005年; 目的探讨慢性髓细胞性白血病(CML)的基因表达变化。方法分别从正常人和CML患者骨髓样品中抽取骨髓单个核细胞,分离出cDNA片段,然后再逆转录成cRNA并标记后,与人的全基因组表达谱芯片杂交,ABI1700芯片分析系统进行分析基因表达谱的差异。结果总共发现差异表达的基因有6706个,其中与CML相关的差异基因有75个(上调19个,下调56个)。结论全基因组寡核苷酸基因芯片在分析基因表达谱差异研究中具有广泛的应用价值。; 王蜀燕郑文岭丁大鹏周珏宇徐秋林石嵘马文丽; 关键词：慢性髓细胞性白血病寡核苷酸基因芯片骨髓单个核细胞 CDNA片段表达谱芯片

微量核酸样品的双重限制性荧光标记技术: 2006年; 目的采用双重限制性荧光标记技术(doub le restriction fluorescent labeling,DRFL)标记微量核酸样品,提高基因芯片用于病原体检测的灵敏度。方法以限制性显示技术处理SARS-CoV核酸样品,分别采用传统限制性荧光标记技术(直接采用荧光标记的通用引物标记)和双重限制性荧光标记技术(荧光标记的通用引物和荧光标记的dNTP的双重荧光标记)标记,进一步在同等条件下与基因芯片进行杂交、清洗和芯片扫描检测。通过对杂交结果的分析,比较2种标记方法的标记效果。结果以DRFL方法标记SARS基因片段,其荧光强度均值比传统荧光标记方法提高了3.5835倍。结论DRFL技术有效地提高单位分子标记片段的荧光强度值,提高了检测的灵敏度,可用于微量病原体核酸样品的基因芯片检测。; 黄吉城马文丽石嵘欧阳谦陈秋霞周珏宇丁大鹏郑文岭; 关键词：限制性显示技术基因芯片

MiR-138对MCF-7细胞端粒酶活性及端粒稳定性的调控作用被引量：1: 2010年; 目的研究MiR-138通过人端粒酶反转录酶(hTERT)作为下游靶基因,对人乳腺癌MCF-7细胞端粒酶活性的调控作用及端粒稳定性的影响。方法在人乳腺癌MCF-7细胞中瞬时转染MiR-138模拟物,用MTT法检测细胞增殖活性,并于转染后48 h用实时定量RT-PCR检测端粒酶催化亚单位hTERT表达、TRAP assay检测端粒酶活性,同时对细胞进行53BP1抗体免疫荧光染色及端粒的FISH染色。结果转染后48 h,MiR-138模拟物处理的MCF-7细胞hTERT表达水平比对照细胞降低2.18倍(2-△△Ct),端粒酶活性比对照细胞降低2.69倍,53BP1聚集形成的凝集点(Foci)部分与端粒位点重合,比率达到20.62%±1.55%。结论 MiR-138以hTERT作为下游靶分子调控MCF-7细胞端粒酶活性,影响细胞端粒稳定性。; 石嵘姜立高洋周珏宇丁大鹏郑文岭马文丽; 关键词：端粒酶端粒人乳腺癌MCF-7细胞

基于研究的学习在基因表达调控教学中的应用被引量：1: 2013年; 开放式和自主式教学是当今教学改革的方向,对于提高学生自学能力和解决问题的能力具有重要作用。基因表达的调控是生物化学和分子生物学教学的重要内容,也是当今医学发展最快的学科之一。临床医学专业8年制和生物技术专业在此内容的教学中开展了基于研究的教学,取得了一定的成效。文章报道了具体实施方法以及一些实践的体会。; 殷志新丁大鹏吴捷莉欧阳鸿何肖娟马文丽; 关键词：基因表达调控自主性学习

干扰hTERT降低人乳腺癌MCF-7细胞对γ射线引起的DNA损伤反应被引量：1: 2010年; 目的研究hTERTRNA干扰对人乳腺癌MCF-7细胞γ射线照射引起的DNA损伤反应的影响。方法通过反转录病毒为载体的hTERT-siRNA,抑制人乳腺癌MCF-7细胞中端粒酶催化亚单位hTERT表达,实时定量RT-PCR及Western blot确认hTERT表达水平。用137Cs放射源以3 Gy剂量γ射线照射细胞,于照射前以及照射后1、2、4、8和12 h收集细胞,采用磷酸化53BP1抗体进行免疫荧光染色,并于照射前、照射后1、4和12 h收集细胞,Western blot检测53BP1蛋白磷酸化水平。结果 hTERT-siRNA处理的细胞hTERT表达水平比对照细胞降低3.20(2-△△Ct)倍,hTERT蛋白水平降低2.56倍。hTERT-siRNA处理的细胞对γ射线引起的DNA损伤反应显著降低。结论 RNA干扰hTERT表达水平,可以降低人乳腺癌MCF-7细胞对γ射线照射引起的DNA损伤反应。; 石嵘马文丽高洋周珏宇丁大鹏余海浪郑文岭; 关键词：端粒酶 Γ射线人乳腺癌MCF-7细胞

问题教学法在生物化学实验教学中的应用初探被引量：9: 2009年; 实验教学是生物化学课程的重要组成部分，为了更好地培养学生的实验动手能力以及激发学生对实验课的兴趣，在课程中适当地结合问题教学的思路与方法，提高学生的积极性和主动性，增强实践和科研能力的培养，从而为搞好实验教学，完善提高生物化学的教学质量提供新的模式。; 丁大鹏马文丽吴清华; 关键词：生物化学教学方法问题教学

一种MicroRNA duplex设计新技术研究: 2006年; 利用microRNA数据库,获取3种微RNAmir-181a、mir-124和mir-1的成熟序列信息.基于siRNAdu-plex在形成RNA诱导的沉默复合物(RNA-inducedsilencingcomplex,RISC)过程中的不对称性的特点,初步设计了针对上述3种微RNA的microRNAduplex.采用生物学软件Oligo6.0分别评价其热动力学特性,并通过改变反义链3'端个别碱基序列使其满足热动力学的需求,从而确定最终的设计序列.结果显示,利用RISC形成过程的不对称性,结合生物学软件Oligo6.0的热动力学分析来设计miRNAduplex,是一种简便可行、准确有效的方法.; 周珏宇马文丽丁大鹏石嵘郑文岭; 关键词：微RNA SIRNA 生物信息学分析热动力学性质

着色性干皮病基因A多态性与广东地区女性乳腺癌发病风险的关联: 2016年; 目的探讨着色性干皮病基因A（XPA）单核苷酸多态性与广东地区女性乳腺癌易感性的关系。方法采用病例-对照研究方法纳入乳腺癌患者130例（病例组）和健康对照者188例（对照组）,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析两组人群XPA-4G/A多态性的基因型。结果病例组与对照组中杂合子基因型A/G在两组样本中的基因型频率差异无统计学意义（P=0.857）,纯合子基因型G/G在病例组的分布频率与对照组比较差异无统计学意义（P=0.103）,但G/G基因型在乳腺癌患者中的基因型频率要低于在正常对照组中的分布频率。等位基因G和A在病例组和对照组中的分布频率差异接近有统计学意义的临界值（OR=0.782,95%CI=0.568-1.077）,对照组中G等位基因的基因型频率为病例组的1.28倍。结论 XPA-4G/A多态性与乳腺癌发病风险无相关性,但是等位基因G的携带者在健康人群中出现的频率更高,因此提示XPA-4G等位基因携带者发生乳腺癌的风险可能会降低。; 丁大鹏刘锦新余海浪郭云波; 关键词：XPA 乳腺癌多态性易感性

使用GeneSifter对小鼠肺钩虫感染基因表达谱的分析: 2008年; [目的]从基因水平探索肌萎缩侧索硬化(ALS)其发病机制并发现治疗ALS的新靶点。[方法]通过GeneSifter软件对野生型(WT)和重度联合免疫缺陷型(SCID)小鼠肺组织钩虫感染的微阵列表达谱进行分析,使用two-way ANOVA的统计学方法对数据聚类,并结合Gene Ontology和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)生物学通路,深入分析具有种系效应的517个差异基因(P﹤0.001)。[结果]显示ALS的信号转导通路在两组小鼠间差异有统计学意义(Z﹥2),与Th2反应相关的多个基因对ALS的代谢异常具有保护作用。[结论]筛选出的3个特异基因,可作为治疗肌萎缩侧索硬化的新候选基因。; 刘华马文丽柯杰兵丁大鹏郑文岭; 关键词：基因表达谱肌萎缩侧索硬化

青蒿素作用前后K562细胞基因表达谱的改变被引量：2: 2009年; 目的:利用基因表达谱芯片研究青蒿素对体外培养的人红白血病K562细胞基因表达谱的影响。方法:青蒿素处理K562细胞24h后,分别提取处理组和对照组细胞的总RNA,将两组RNA纯化为mRNA,逆转录成cDNA,用Cy3和Cy5两种不同的荧光染料进行线性扩增标记,与人全基因组基因表达谱芯片杂交,采用生物信息学方法分析青蒿素处理前后K562细胞基因表达谱的改变。结果:总共发现差异基因238个,其中上调基因136个,下调基因102个,并对其进行生物学功能分类。结论:应用全基因组表达谱芯片并结合Panther生物学软件分析差异表达基因,青蒿素作用K562细胞主要是通过细胞毒作用诱导细胞凋亡,而抑制细胞生长作用并不明显。; 丁大鹏马文丽吴清华周珏宇危敏郑文岭; 关键词：青蒿素基因芯片基因表达谱 K562

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丁大鹏

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