杨彦杰 作品数:14 被引量:69 H指数:4 供职机构: 大连大学生命科学与技术学院辽宁省生物有机化学重点实验室 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 辽宁省高校创新团队支持计划 辽宁省教育厅高等学校科学研究项目 更多>> 相关领域: 理学 医药卫生 文化科学 农业科学 更多>>
NiSOD天然酶活性中心量子化学研究 被引量:2 2008年 通过密度泛函理论计算了天然NiSOD氧化态(ox)/NiSOD还原态(red)的活性中心的电子结构.采用INDO/S方法计算了电子光谱,并与实验值进行了比较.从前线分子轨道及自然键轨道布居等方面揭示了S原子在催化超氧阴离子的活性中的作用,以及NiSOD具有较高结构稳定性的原因.结果表明:NiSODox/NiSODred分别以低自旋态为最稳定状态,计算值与实验结果一致. 刘文丛 杨彦杰 郑学仿 迟乃玉 张庆芳关键词:SOD 密度泛函方法 自然键轨道 FeSOD天然酶活性中心的理论研究 被引量:2 2007年 通过密度泛函理论计算,探讨FeSOD天然酶氧化态、还原态和失活态的活性中心的电子结构,揭示具有较高的结构稳定性和催化超氧阴离子的活性的原因.为FeSOD模拟化合物的分子设计提供了重要的信息. 杨彦杰 郑学仿 蒋革 唐乾 曹洪玉关键词:密度泛函理论 SOD 菇渣再利用生产微生态生物活性有机肥技术及其应用 迟乃玉 张庆芳 窦少华 王晓辉 王延平 孙洪英 郝连菊 于晓娜 王圆 郑艳 唐乾 杨彦杰 于吉科 利用微生物工程和酶工程技术将菇渣再生利用、转化为“微生态生物活性有机肥”,促进了食用菌产业的良性发展,解决了食用菌采收后产生大量菇渣出路,避免了环境污染。 目前绿色或有机食品生产标准的廉价生物肥主要是畜禽粪便,但其供应...关键词:关键词:生物活性 有机肥 菇渣 微生态 分子对接探究Semen Vaccariae的有效成分与乳腺癌关键靶点的作用机制 2025年 乳腺癌一度位列癌症死亡率第一,因其进展快、死亡率高等特点,对其治疗方法和药物开发迫在眉睫。本文利用分子对接等技术探究依据网络药理学从王不留行(Semen Vaccariae)筛出的有效成分治疗乳腺癌的作用机理。结果表明:基于网络药理学从Semen Vaccariae中筛选出5个最强的活性成分(异牡荆素、豆甾醇、王不留行环肽B、槲皮素、王不留行环肽A)和潜在抗乳腺癌的45个核心靶点。通过分子对接得出他们之间主要依靠氢键、疏水相互作用、范德华力等作用力结合,其中多种氨基酸可与药物分子形成氢键、碳氢键和范德华力;脂肪族氨基酸、赖氨酸和精氨酸易与药物分子形成疏水相互作用;酸性和碱性氨基酸易与药物分子形成静电相互作用。分析核心靶点治疗乳腺癌的可能通路包括癌症通路、癌症蛋白多糖、PI3K-AKT信号通路、化学致癌-受体激活通路等在内的148条通路,并根据“成分-核心靶点-显著通路”构建网络,结果符合中药治疗疾病的多途径、多靶点理念。以上研究结果为深入探究王不留行治疗乳腺癌的分子机制提供研究思路和理论基础。 唐乾 唐钰 吴凤娇 先正平 薛亚琦 曹洪玉 王立皓 杨彦杰 郑学仿关键词:王不留行 乳腺癌 分子对接 氮混杂金属卟啉吸收光谱性质的理论研究 被引量:6 2014年 采用密度泛函理论在B3LYP/6-31+G(d)水平上研究了4种金属Mg,Ni,Cu,Zn配位的自由卟啉(FBP)及氮混杂卟啉(NECP)的几何结构及分子轨道能级.采用含时密度泛函理论(TD-DFT)方法计算了金属与2种卟啉配位后在气体条件下的电子吸收光谱,包括激发能、吸收波长、跃迁组成和振子强度.计算结果表明,与金属配位的FBP(M-FBP)具有D4h对称性,分子轨道能级HOMO/HOMO-1和LUMO/LUMO+1因能级相近发生简并,HOMO-LUMO轨道能级差大约3.0 eV,在Soret带出现较强吸收峰.由于C/N原子位置的改变,非对称性结构的M-NECP前线轨道组成发生改变,轨道能级差(HOMO-LUMO)减小至2.6 eV左右,且能级发生分裂,Soret带出现多个电子吸收谱峰,Q带也出现吸收峰.本文研究了水、氯仿和苯3种不同极性溶剂对M-FBP和M-NECP的分子轨道及电子吸收光谱的影响,结果表明,随溶剂极性减弱金属配合物的电子吸收光谱发生红移,并且吸收峰强度增强. 宫健 曹洪玉 李慎敏 唐乾 杨彦杰 郑学仿关键词:金属卟啉 密度泛函理论 含时密度泛函理论 电子吸收光谱 利用废弃菌块(菇渣)生产微生态生物活性有机肥 迟乃玉 张庆芳 李晓艳 王延平 陈辉远 窦少华 于晓娜 邢福友 王仁军 唐乾 杨彦杰 王晓辉 经2003-2006三年的试验研究,以废弃菇渣为主要原料,利用微生物工程和酶工程技术,将废弃菇渣转化为具有微生物活性和酶活性的微生态生物活性有机肥,即解决了废物二次利用、又避免了环境污染,更重要的是为绿色食品和有机食品生...关键词:关键词:生物活性有机肥 微生态 菇渣 “酶工程”课程思政元素的提取与思考 被引量:1 2022年 文章以生物学专业核心课程“酶工程”为例,通过课程知识点提取出相应的思政元素并融入课堂教学中,以激发学生们的学习兴趣,提高学生对专业课程的学习热情和对知识点的理解能力,更为重要的是提升当代大学生的世界观、人生观和价值观,进而传承和创新中华优秀传统文化,达到为社会培养更多德智体美劳全面发展的人才的目的。 唐乾 冯宝民 曹洪玉 杨彦杰关键词:立德树人 酶工程 利用废弃菇渣生产反刍动物饲用复合微生态酶制剂 迟乃玉 张庆芳 李晓艳 窦少华 陈辉远 王彦平 于晓娜 邢福友 王仁军 唐乾 杨彦杰 王晓辉 经2003-2006三年的试验研究,以废弃菇渣为主要原料,利用微生物工程和酶工程技术,将废弃菇渣转化为具有微生物活性和酶活性的反刍动物饲用复合微生态酶制剂,即解决了废物二次利用、又避免了环境污染,更重要的是为畜牧业生产提...关键词:关键词:酶制剂 反刍动物 微生态 饲用 生物信息学课程项目法教学方法探讨 被引量:3 2018年 生物信息学是一门多学科的交叉学科。该课程教学质量与学生的专业基础有着密切的关系。本论文依据本学科的特点,以及教授对象为生物技术和生物工程专业的本科生,于当前应用型人才培养的背景模式下,提出了项目教学法改革。改革后的教学效果显著,学生的学习兴趣和创新能力有了较大的提高,培养了应用型人才。 杨彦杰 牛进林 王东梅关键词:生物信息学 项目教学法 氢卟啉,N-/Neo-混杂卟啉结构和吸收光谱性质的密度泛函理论研究 被引量:5 2014年 卟啉类化合物是一类重要的光化学材料,其衍生物特殊的光电特性在各个领域中得到了广泛的应用。利用密度泛函理论(DFT)研究了(free base porphyrin,FBP)及其异构体(neo-confused porphyrin,NECP)和(n-confused porphyrin,NCP)三种卟啉环的几何结构和分子轨道能级。采用TDDFT方法计算真空和溶剂场极化连续模型下三者的吸收光谱。计算表明由于N原子位置变化,FBP,NECP和NCP在Soret带和Q带两个特征吸收峰也有不同。按FBP,NECP和NCP顺序,分子轨道能级LUMO依次降低,HOMO轨道依次升高,从而造成吸收光谱红移。HOMO和HOMO-1轨道能级的分裂造成了FBP和NECP的Soret带的多个吸收峰,而NCP的LUMO和LUMO+1的能级差与其HOMO和HOMO-1能级差几乎相等造成Soret带只有一个最高吸收峰。计算结果表明不同溶剂(苯、氯仿、乙腈和水)条件下三者的Soret带和Q带特征吸收峰均有显著变化。为此重点讨论了N原子位置的变化及在不同性质溶剂下FBP,NCP和NECP三类化合物Soret带/Q带吸收光谱性质的变化规律和机理。 刘国魁 曹洪玉 李慎敏 唐乾 杨彦杰 郑学仿关键词:含时密度泛函