周海健 作品数:120 被引量:483 H指数:10 供职机构: 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 国家自然科学基金 中国煤炭工业协会科学技术研究指导性计划项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 环境科学与工程 建筑科学 更多>>
一种应用高分辨率熔解曲线法鉴别三种棒状杆菌的方法 本发明提供了一种使用高分辨率熔解曲线法鉴别棒状杆菌菌种的方法,以及用于该方法的基因扩增引物。所述方法包括如下步骤:(1)以待检测样本的DNA为模板,扩增棒状杆菌的ssrA基因的区间序列;(2)使用高分辨率熔解曲线法获取步... 李振军 侯雪新 徐帅 周海健脉冲场凝胶电泳病原胶块清洗装置 本实用新型涉及一种脉冲场凝胶电泳病原胶块清洗装置。本装置的弹簧夹安装在水浴摇床上;在管体内装有多个粘附有病原胶块的绿色的盖子,将管体内填充纯水或TE缓冲液,将管体放置在弹簧夹上,可以将多个管体并排安置于一个水浴摇床中使之... 韩辉 李海山 杨宇 胡孔新 周海健 王艳 李新文献传递 206株中国环境分离嗜肺军团菌1型菌株基因序列分型研究 被引量:2 2015年 目的对中国不同自然环境来源分离的嗜肺军团菌血清1型菌株进行分子分型和种群结构分析。方法应用7个基因(fla A、pil E、asd、mip、momp S、pro A、neu A)序列分型方法(Sequence based typing,SBT)对不同环境来源的206株嗜肺军团菌血清1型菌株进行分型研究,通过查询嗜肺军团菌SBT数据库(http://www.ewgli.org)和用Bio Numerics软件构建最小生成树揭示菌株的分子分型和种群结构特征。结果 206株菌分成54个ST型(IOD=0.7205)。其中49株温泉水分离株分成25个ST型(IOD=0.9498),各位点Nei指数0.7721~0.8563;130株冷却塔水分离株分成31个ST型(IOD=0.6453),各位点Nei指数为0.4227~0.4970;27株管道水分离株分成3个ST型(IOD=0.1453),各位点Nei指数为0.1425~0.1453。ST1型含108株菌,占52.4%,是优势带型。54个ST型形成5个克隆群。通过中国菌株和其他20个国家的菌株综合分析,共计1199株菌分成304个ST型,形成21个序列群。其中ST-1型为全球优势型别,其余型别和序列群呈地区性分布特征。结论中国环境分离的嗜肺军团菌1型菌株具有高度复杂的基因多态性和种群结构,其中ST1是我国也是全球环境菌株的优势型别。 任红宇 周海健 李马超 朱兵清 邵祝军 秦天关键词:嗜肺军团菌 干预艰难梭菌感染的非产毒艰难梭菌的筛选和表型特征研究 2025年 目的筛选出有潜力干预艰难梭菌感染(CDI)的非产毒艰难梭菌(NTCD)候选株并分析其表型特征。方法收集2015—2023年全国范围内收集的不同来源的713株艰难梭菌,其中包括分离于人类粪便样本的649株和分离于养殖动物粪便样本64株。通过毒力编码基因检测和抗生素敏感性实验初步筛选NTCD菌株,进行多位点序列分型(MLST),分析其芽孢形成、萌芽、黏附性、运动力及生物膜形成能力,筛选出有潜力干预CDI的NTCD候选株,并对候选株进行毒力基因和耐药基因分析,评估其安全性。结果从713株不同来源的艰难梭菌中,初步筛选出10株不产毒素的、对抗生素药物敏感NTCD菌株。MLST显示,7株来源于Clade1进化支,3株为新型别;芽孢形成和萌芽结果显示,SD59、SD178、SJZ17和WZ142芽孢形成和萌芽能力较强;10株菌的黏附性均较高,黏附率为72.93%~99.32%;各菌株的运动性差异较大,SD178、SD59和SJZ17运动能力较强;各菌株的生物膜形成能力均较弱;SD59、SD178、和SJZ17携带毒力基因和耐药基因数量较少且具有一定的安全性。结论成功筛选出3株芽孢形成、萌芽能力强,黏附力高,运动能力强,生物膜形成能力弱且具有一定安全性的有潜力干预CDI的NTCD菌株。 白璐璐 徐特龙 张文竹 姜亚军 周海健 吴媛关键词:梭菌属 表型 2013—2014年黑龙江省婴儿配方粉加工环节克罗诺杆菌污染状况及分子分型 被引量:2 2022年 目的了解婴儿配方粉加工环节克罗诺杆菌污染状况和分子分型特征。方法 2013—2014年采集黑龙江省婴儿配方粉生产企业加工环节的各类样品2405份,进行克罗诺杆菌检验,并通过脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis, PFGE)和多位点序列分型(multi-locus sequence typing, MLST)对分离菌株进行分子分型和种群结构分析。检索国家致病菌识别网克罗诺杆菌分子分型数据库和国际MLST数据库(https://pubmlst.org/cronobacter/)进行比对。结果 2405份样品中16份检出克罗诺杆菌,其中10株为阪崎克罗诺杆菌,6株为丙二酸盐阳性克罗诺杆菌。PFGE分型将16株克罗诺杆菌分为10个型别,存在同一生产线不同环节分离菌株带型相同的现象,其中2个带型与其他省份菌株带型相同或极其相似。MLST将16株菌分为5个ST型,分别为ST7(6株)、ST37(4株)、ST1(3株)、ST4(2株)、ST117(1株)。其中ST1、ST4、ST7型菌株是国际流行株。结论婴儿配方粉加工环节是克罗诺杆菌污染的重要环节之一,黑龙江省克罗诺杆菌分离株中存在国际流行株。 闫军 孙巍 遇晓杰 胡锦瑞 于艳玲 周海健 崔志刚 陈宝泽 刘祎婷 陈万春关键词:婴儿配方粉 分子分型 241株临床来源铜绿假单胞菌苯唑西林酶的遗传多样性分析 2025年 目的分析241株临床来源铜绿假单胞菌中苯唑西林酶(OXA酶)的携带状况、亚型分布和侧翼基因序列特征,评估其在铜绿假单胞菌耐药中的作用和跨种属横向转移的能力。方法从三亚、唐山、张家口和北京地区4家医院收集241株临床来源铜绿假单胞菌,采用全基因组二代测序、生物信息学分析方法分析临床来源铜绿假单胞菌中苯唑西林酶的携带情况及其侧翼基因序列。结果241株铜绿假单胞菌中,共筛查到252个bla OXA基因,涉及35个bla OXA亚型,分别属于bla OXA-50-like(241,95.6%),bla OXA-1-like(9,3.6%)和bla OXA-10-like(2,0.8%)3个亚家族。35个bla OXA亚型中,有11(31.4%)个亚型为新的bla OXA亚型,其中9个归属于bla OXA-50-like亚家族,分别为bla OXA-1244、bla OXA-1245、bla OXA-1246、bla OXA-1250、bla OXA-1252、bla OXA-1253、bla OXA-1254、bla OXA-1255和bla OXA-1256;2个归属于bla OXA-10-like亚家族,分别为bla OXA-1247和bla OXA-1248。与OXA-10的氨基酸序列相比,新亚型OXA-1247的第117位缬氨酸被亮氨酸替换,可能与OXA酶对碳青霉烯类药物的水解有关。对bla OXA侧翼基因序列分析发现,在4株菌中筛查到Ⅰ类整合子,其可变区携带的耐药基因簇有3种模式,分别为aac(6′)-Ib-bla OXA-1247-ant(3′′)-Ia、aac(6′)-Ib-bla OXA-1248和aac(6′)-Ib-bla IMP-45-bla OXA-1-catB3。其中,菌株BJ2326携带的Ⅰ类整合子与其下游存在的IS CR1元件相连接形成复合型Ⅰ类整合子结构,额外携带耐药基因bla PER-1。以药物敏感性流行病学界值对菌株进行药敏特征分析,223株铜绿假单胞菌对美罗培南(MEM)、头孢他啶(CAZ)、哌拉西林/他唑巴坦(TZP)和头孢吡肟(FEP)4种β-内酰胺类药物呈现非野生型,有10种非野生型药物谱,其中MEM+CAZ+FEP占比最高(127/223,57.0%)。结论241株临床来源铜绿假单胞菌携带的bla OXA基因具有多样性;部分bla OXA基因与金属β-内酰胺类耐药基因bla IMP-45具有共转移的风险;发现的11� 李跃龙 张静宜 付玉冰 孙梅青 苗贝贝 龚心怡 韩肖 邢欢 高鹏芳 李嘉琛 汤雅婷 范馨雅 戈艳蕾 周海健 李娟 董爱英关键词:铜绿假单胞菌 细菌耐药 奶牛乳房炎金黄色葡萄球菌脉冲场凝胶电泳分型研究 被引量:5 2009年 为探讨新疆北疆奶牛乳房炎致病菌的流行规律,本研究采用SmaⅠ酶切,脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型的方法对43株分离自新疆6个规模奶牛场隐性乳房炎奶样的金黄色葡萄球菌进行了分子分型比较研究。结果表明,所有菌株都能被PFGE法分型,43株金黄色葡萄球菌可分为A、B、C、D和E5个基因型。A型株(22株,51.2%)有13个亚型,相似度在81.8%~96.8%之间,在5个奶牛场均分离到,是主要的流行株;B型(25.6%)、C型(14.0%)、D型(7.0%)各型别内菌株间的相似度为100%,E型仅有1株。不同地区主要流行株有差别:乌鲁木齐主要流行A型菌株,昌吉以A型和B型菌株为主,而奎屯主要流行C型和B型。有2个奶牛场流行株只有1个基因型,也有2种基因型(3个牛场)或3种基因型(1个牛场)同时存在,但以1种为优势株。这些结果提示,不同地区主要流行株有差别,多数奶牛场以1种流行株感染为主,不同牛场可能流行相同的菌株,在较大地域范围内某些流行株具有侵染优势。 李建平 周海健 袁林 杨学云 王治才 胡松华关键词:奶牛乳房炎 金黄色葡萄球菌 脉冲场凝胶电泳 海口地区肺炎链球菌的耐药性分析及血清型研究 黄会 林昌炎 周海健 韩小胜 吴多荣一起霍乱疫情分离株的耐药性和分子流行病学分析 被引量:6 2019年 目的对2017年北京市房山区一起霍乱疫情的O1群霍乱弧菌的分子流行病学特征和耐药性进行分析。方法采集患者和有关人员及外环境(包括食物)样本109件,用实时荧光PCR检测碱性蛋白胨水增菌液中O1/O139群霍乱弧菌特异性基因;同时按常规法分离培养鉴定;对鉴定的阳性菌株用实时荧光PCR检测霍乱弧菌CTX基因,用微量肉汤稀释法进行20种药物敏感试验,用Not I和SfiⅠ限制性内切酶进行脉冲场凝胶电泳实验和聚类分析。结果109件样本增菌液O1群霍乱弧菌特异性基因阳性率19.27%(21/109,患者、密切接触者中家属和就餐地厨师肛拭子各1件阳性,就餐地后厨外环境样本18件阳性);常规培养鉴定O1群小川型霍乱弧菌阳性率5.50%(6/109,患者和就餐地厨师肛拭子各检出1株,就餐地后厨外环境涂抹检出4株);6株O1群小川型霍乱弧菌,霍乱CTX基因均阴性,对20种抗生素中12种100%敏感,对头孢唑林100%耐药,PFGE分子分型条带具有一致性。结论该起霍乱疫情的病原为O1群小川型非产毒株;PFGE分子分型溯源表明疫情与厨师有关;应关注霍乱疫情菌株的耐药监测。 王云霞 严寒秋 刘海波 史文凤 周海健 王斌关键词:霍乱弧菌 实时荧光PCR 脉冲场凝胶电泳 药物敏感实验 一例霍乱带菌者携带两株霍乱弧菌的生物学特性研究 被引量:1 2012年 目的:对同一霍乱带菌者中分离的2种血清型霍乱弧菌开展生物学特征研究。方法:应用噬菌体生物分型方法、药敏纸片法、PCR方法和脉冲场凝胶电泳试验对两株菌开展研究。结果:两株菌的血清型、噬菌体生物型均不同,耐药性、毒力基因结果相同,脉冲场凝胶电泳分型结果显示带型高度相似。结论:两株菌虽然存在一定差异,但差异非常小,应为同源菌株。 罗芸 叶菊莲 张政 金大智 程苏云 崔志刚 周海健关键词:霍乱弧菌 血清型