林旋豪 作品数:10 被引量:6 H指数:2 供职机构: 汕头市中心医院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 广东省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
食管腺癌DNA拷贝变化相关基因的生物信息学分析 2015年 目的:探讨食管腺癌DNA拷贝变化相关基因所涉及的功能、信号通路,蛋白-蛋白相互作用及表达相关性。方法:从3篇利用全基因组关联分析(GWAS)技术大规模分析食管腺癌临床样本的文献,收集120个食管腺癌DNA拷贝变化相关基因,进行生物信息学分析,包括基因功能富集分析,蛋白-蛋白相互作用网络的构建,表达谱聚类及表达相关性。结果:基于基因本体论的功能富集分析显示食管腺癌DNA拷贝变化相关基因最显著的功能是转录调控。信号通路富集分析富集基因数量最多的KEGG信号通路为"Pathway in cancer"。DNA拷贝变化相关基因的蛋白-蛋白相互作用网络含3 356个蛋白节点和63 474条边。该网络具有无尺度特点。利用公共的食管腺癌表达谱分析显示食管腺癌DNA拷贝变化相关基因表达谱聚类几乎能够将食管腺癌组织与正常食管组织完全区分,而且DNA拷贝变化相关基因之间在该表达谱中有显著的表达相关性。结论:本研究利用生物信息学方法,对食管腺癌DNA拷贝变化相关基因进行深入的分析,为将来实验验证这些基因在食管腺癌发生发展中的生物学功能奠定基础。 杜则澎 邱晓阳 林旋豪 詹晓芬 王媛媛 王少洪 沈金辉关键词:食管腺癌 长期能量限制对成年雌性大鼠生殖寿命的影响 被引量:1 2011年 目的探讨长期能量限制对成年雌性大鼠生殖寿命的影响。方法 6月龄雌性SD大鼠30只,分为正常饮食组、能量限制(CR)20%组和CR40%组,记录正常饮食(NC)组每日摄食量,并将此摄食量的80%和60%分别喂养CR20%组和CR40%组大鼠,监测大鼠体重及动情周期变化,12个月后取大鼠卵巢。卵巢组织切片由苏木精-伊红染色,观察卵泡储备数量和不同发育阶段的卵泡比例。结果 NC组体重持续上升,而CR20%组体重小幅增加,CR40%组体重持续下降。CR40%组大鼠的卵泡储备数量(105.7±9.5)和原始卵泡数(55.0±6.8)与NC组(51.2±5.4,18.3±3.7)相比差异均有统计学意义(P<0.001,P<0.001),原始卵泡比例(52.1%±2.9%)与对照组(35.8%±5.5%)相比差异有统计学意义(P<0.001),而成熟卵泡比例(6.8%±1.9%)和发育卵泡比例(41.2%±3.0%)与NC组(15.6%±6.2%,48.9%±4.2%)相比差异亦有统计学意义(P<0.001,P<0.05)。CR20%组卵泡储备数量和不同发育阶段的卵泡比例与NC组相比差异无统计学意义。结论长期能量限制可能通过抑制卵泡发育启动、减少发育卵泡和成熟卵泡的数量,从而减少卵泡的消耗,有益于生殖寿命延长。 林旋豪 罗丽莉 许锦阶 陈晓纯 栗丽 陈振国 傅玉才关键词:卵巢 卵泡发育 离体时间和冻存时间对生物样本库乳腺癌和食管癌冰冻组织样本RNA质量的影响 2025年 目的探讨离体时间和冻存时间对乳腺癌和食管癌冰冻组织样本RNA质量影响,为生物样本库建立科学规范的样本处理流程和质量控制标准提供理论依据。方法采集6例乳腺癌患者和6例食管癌患者的肿瘤组织及其配对正常组织样本,冷冻保存于汕头市中心医院生物样本库。同时采集镜像组织制备石蜡切片进行形态学分析。根据样本离体时间分为<15 min组和15~30 min组,在冻存8~10个月(T_(1))、14~16个月(T_(2))、26~28个月(T_(3))和38~40个月(T_(4))4个时间点对样本进行RNA质量分析。结果共检测96份组织样本,RNA完整性指数(RNA integrity number,RIN)≥6的高质量样本占93.8%(90/96),乳腺癌组高质量样本占89.6%(43/48),食管癌组高质量样本占97.9%(47/48)。乳腺癌组与食管癌组样本RIN值的差异有显著统计学意义(8.050 vs.8.600,P=0.009)。在食管癌组样本中,RIN值与RNA产量显著负相关(P<0.001),且肿瘤组织与正常组织RIN值的差异有显著统计学意义(7.550 vs.9.000,P<0.001),而乳腺癌组样本中肿瘤组织与正常组织RIN值的差异无统计学意义(8.200 vs.7.700,P=0.348)。RIN值与28S/18S显著正相关(P<0.001),其与肿瘤细胞百分比(P=0.676)和坏死细胞百分比(P=0.055)不相关。离体时间(<15 min和15~30 min:8.200 vs.8.300,P=0.932)和冻存时间(T_(1)~T_(4):8.400、7.700、8.450和8.600,P=0.163)均不会对组织样本RIN值产生影响。结论不同器官来源和不同组织类型的冰冻组织样本RNA质量存在差异性,有限的离体时间(≤30 min)和中长期冻存(38~40个月)对乳腺癌和食管癌冰冻组织样本RNA质量不会产生不利影响。 郑仰思 林旋豪 李帆 肖坤胜 陈锡丰 刘春鹏 姚佩秀 王少洪关键词:生物样本库 离体时间 乳腺癌 食管癌 一种检测电极及其制备方法与在卵泡液中全氟化合物检测中的应用 本发明涉及化学检测电极以及医学检测技术领域,具体公开了一种检测电极及其制备方法与在卵泡液中全氟化合物检测中的应用。所述的检测电极的制备方法,其包含如下步骤:将电极材料涂覆在玻碳电极的表面,干燥后即得所述的检测电极;所述的... 郑相斌 黄晓帆 郑海琳 林旋豪 郑仰思 于雅璐 周欣业 吴孟青 姚佳娜 王丽蔓粤东地区乳腺癌专病生物样本库的建设 2025年 生物样本及其相关临床病理数据信息是医学科学研究的两大资源。在乳腺癌发病率不断上升的背景下,2021年,汕头市中心医院向中国人类遗传资源管理办公室提交了人类遗传资源保藏行政许可申请,并获得保藏批件,随后在国家法律法规的指导下开展了人类遗传资源保藏工作。在医院人类遗传资源管理委员会等管理部门的领导下,汕头市中心医院生物样本库遵循国家标准和行业最佳实践,探索了质量管理和数据库建设模式,建设了规范化、高质量、信息化和开放共享的地区性乳腺癌专病生物样本库,用于保藏乳腺癌生物样本及其相关临床病理数据信息,记录检验、检查、治疗和随访等样本相关信息,为项目研究提供高质量的样本,支持临床研究和转化医学研究的开展。 林旋豪 赵勇强 张泽淳 张艺敏 孟令英关键词:生物样本库 乳腺癌 知情同意书 长期能量限制对成年雌性大鼠生殖寿命的影响 研究目的:探讨长期不同强度的能量限制对成年雌性大鼠生殖寿命的影响,观察不同强度能量限制对卵泡发育、生育能力以及卵巢寿命的影响。 材料与方法:取6月龄雌性SD大鼠30只,分为对照(NC)组、能量限制(calorie re... 林旋豪关键词:原始卵泡 卵巢组织 体重指数 潮汕沿海地区食管癌样本库的建立及其应用 被引量:4 2015年 食管癌(esophageal cancer,EC)是全球常见八大恶性肿瘤之一,位居恶性肿瘤死亡率第六位[1-2]。依据组织病理类型分类,食管癌主要包括食管鳞癌和食管腺癌。食管鳞癌主要集中在亚洲的中东部和非洲等地区,而食管腺癌则在欧美等国家地区多发[3]。我国是世界上最主要的食管鳞癌高发国,食管鳞癌病例占全部食管癌病例的90%以上,并呈现明显的地理性分布差异,主要分布在河北、河南和山西三省交界的太行山地区,闽粤交界的潮汕沿海地区,鄂皖交界的大别山地区,四川北部地区,新疆哈萨克族居民居住地区和苏北地区等[4-5]。肿瘤流行病学调查结果表明,潮汕地区是我国唯一的沿海食管癌高发区,与我国其他内陆型食管癌高发区相比,其地理位置与气候条件,以及当地居民饮食生活习俗等均明显不同。1995–2004年的流行病学调查结果显示,该地区食管癌的标化发病率为74.47/105[6-7]。在潮汕当地,食管鳞癌的发病率一直高居各类恶性肿瘤之首。在此背景之下,毋庸置疑,建立潮汕沿海地区食管癌样本库是十分重要的工作,对揭示食管癌,尤其是食管鳞癌的病因,阐明这种特殊恶性肿瘤发病的分子机制,寻找其早期癌变特异性分子标志物,以利于早期发现、早期诊断和早期治疗,以及监测治疗后患者病情发展转归、预警预后等均有着十分重要的意义。 林旋豪 王少洪 吴智勇 蓝斌 李帆 肖坤胜 许秀娥 吴健谊 傅俊惠 傅俊惠 章克毅 姚晓冬 范扬航 郑海波 郑春鹏 李锐雄 黄建豪 张仕义 陈捷鑫 李卓毅 朱天翔 杨彦龙 张泽淳 杜泽森 黄崇植 许小超 许小超 赵麟 李恩民关键词:食管癌高发区 肿瘤流行病学 标化发病率 食管鳞癌 能量限制对化疗大鼠卵巢的形态结构与功能的保护作用 2012年 目的探讨能量限制对环磷酰胺处理大鼠卵巢的保护作用。方法将48只10周龄大鼠随机分为对照组、能量限制组、环磷酰胺组、能量限制加环磷酰胺组。观察各组动物的动情周期,实验结束时称取卵巢重量,并进行卵巢组织形态学观察及卵泡计数,测定血清雌二醇、促黄体生成素、促卵泡生成激素评估卵巢储备功能。结果经环磷酰胺处理的大鼠出现精神萎靡、体重下降、动情周期逐渐消失,卵巢体积缩小,颗粒细胞变性、坏死,各期卵泡数均明显减少,闭锁卵泡数增加(P<0.01)。能量限制组大鼠卵巢的原始卵泡数比对照组明显增多(P<0.01),窦状卵泡数减少(P<0.01)。能量限制加环磷酰胺组的原始卵泡和初级卵泡数比环磷酰胺组明显增多(P<0.01),且卵巢组织受损程度较单用环磷酰胺轻。环磷酰胺处理组大鼠血清雌二醇显著低于对照组和能量限制组,促黄体生成素和促卵泡生成素水平则显著高于对照组和能量限制组(P<0.01)。结论能量限制模型可以抑制原始卵泡的的转化使其数量明显增多,并可以适度减轻化疗造成的结构与功能损伤,使卵巢保留有一定储备功能。 向延芳 傅玉才 许锦阶 栗丽 林旋豪 陈晓纯 罗丽莉关键词:化疗药物 卵巢储备 卵巢功能 短期能量限制对成年雌性大鼠生殖寿命的影响 被引量:2 2011年 目的:探讨短期能量限制对雌性大鼠生殖寿命的影响。方法:21只8周龄雌性SD大鼠随机分为对照组和能量限制组,并监测大鼠体质量及动情周期变化,8周后取大鼠卵巢,其切片由苏木精-伊红染色,观察存活卵泡数和不同发育阶段的卵泡比例。结果:对照组体质量持续上升,能量限制组较平缓。能量限制组健康卵泡(135.3±11.7)比对照组(90.7±7.1)多(P<0.05),原始卵泡数(57.7±7.7)与对照组(19.4±4.0)比显著增多(P<0.001),原始卵泡比例(41.9±2.9)比对照组(20.5±3.5)要多(P<0.01),而发育和成熟卵泡比例与对照组比则降低。结论:短期能量限制可能通过抑制卵泡发育启动、减少每个周期成熟卵泡的个数来降低卵泡消耗,有益于生殖寿命延长。 陈晓纯 罗丽莉 许锦阶 傅玉才 栗丽 林旋豪关键词:卵巢 卵泡发育 一种检测电极及其制备方法与在卵泡液中全氟化合物检测中的应用 本发明涉及化学检测电极以及医学检测技术领域,具体公开了一种检测电极及其制备方法与在卵泡液中全氟化合物检测中的应用。所述的检测电极的制备方法,其包含如下步骤:将电极材料涂覆在玻碳电极的表面,干燥后即得所述的检测电极;所述的... 郑相斌 黄晓帆 郑海琳 林旋豪 郑仰思 于雅璐 周欣业 吴孟青 姚佳娜 王丽蔓