杨贵清
- 作品数：35 被引量：229H指数：8
- 供职机构：深圳市罗湖区疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：深圳市科技计划项目广东省医学科学技术研究基金深圳市罗湖区科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 深圳地区2014年柯萨奇病毒A组4型VP1区基因特征分析被引量：10
- 2015年
- 目的对2014年深圳市罗湖区一起疱疹性咽峡炎疫情的病原体进行鉴定,并对鉴定的柯萨奇A4病毒（CVA4）的VP1基因进行序列测定和遗传进化特征分析。方法采集疫情中患儿的咽拭子样本8份,提取病毒核酸,利用荧光RTPCR法检测样本总肠道病毒（EV）、人肠道病毒71型（EV71）、柯萨奇病毒A组16型（CVAl6）、CVA4、CVA6和CVAl0等,对CVA4阳性样本采用RT-PCR方法扩增其VP1区全长序列,并进行核苷酸序列测定和遗传进化分析。结果引起此次疱疹性咽峡炎暴发的病原体为GIB亚型的CVA4病毒。同源性分析显示,深圳2014年CVA4病毒株与云南2004年分离株（AB268278）、以及台湾2008年分离株（AB571570）核苷酸同源性达94.1%~94.8%,而与CVA4原型株HIGHPOINT同源性最低,为84.3%。在氨基酸序列上与台湾2006年分离株（AB571563）、吉林2006年分离株（JQ715709）同源性最高,达99.3%;而与山东省2006年分离株（GQ253375）同源性最低,为97.1%。相比深圳2009年分离株（HQ728260）,共有6个氨基酸突变位点：N22S,T34A,N63S,A165D,T200A和V126A;而进化树分析显示,深圳2014年CVA4病毒株虽属于CVA4的GIB亚型,但在进化走势上,已经不同于GIB亚型中其他地区早期的分离株。结论 2014年深圳地区CVA4病毒属于GIB亚型,但在VP1区变异较大。
- 姚相杰何雅青蔡春林卓菲杨贵清
- 关键词：疱疹性咽峡炎
- 食物中毒中分离的副溶血性弧菌的分子分型研究被引量：3
- 2012年
- 目的运用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术研究深圳市罗湖区2005-2007年食物中毒事件中分离获得的49株副溶血性弧菌的分子流行情况。方法样品采用荧光PCR与传统分离培养同时检测,对分离获得的副溶血性弧菌阳性菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE),BioNumerics软件对图谱进行聚类分析。结果 49株副溶血性弧菌中,有12株不能分型,其余36株副溶血性弧菌分离株大致可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ3个群,相同血清型的菌株其PFGE型大致相同,同一起食物中毒的菌株间有较高的相关性。结论罗湖区副溶血性弧菌食物中毒存在流行克隆株,PFGE分子分型技术在食物中毒追踪溯源方面有重要提示性作用。
- 卓菲赵洁玲文凤兰杨贵清龙冬玲
- 关键词：副溶血性弧菌食物中毒荧光PCR脉冲场电泳分子分型
- 深圳市罗湖区2018年1月-2021年10月诺如病毒流行病学分析被引量：1
- 2022年
- 目的 分析深圳市罗湖区2018年1月-2021年10月诺如病毒的病原学型别及流行状况,初步预测流行趋势,为诺如病毒防控提供有效依据。方法 采用real-time PCR技术对采集的标本进行病毒鉴定,利用基因测序对诺如病毒阳性样本进行序列分析。结果 2018年1月-2021年10月共监测散发病毒性腹泻440例,其中诺如病毒引发的占17.27%,同期聚集性腹泻疫情一共54宗,诺如病毒引发占比85.19%,主要流行的基因亚型为GⅡ.2、GⅡ.4、GⅡ.17。结论 诺如病毒是病毒性腹泻的主要病原体,聚集性腹泻基本由其引发。辖区流行的诺如病毒仍以GⅡ为主,但基因亚型中GⅡ.2占比增多,需加大对其监测,防止大规模疫情暴发。
- 杨贵清王礼法邓义州王艳梅张祥
- 关键词：诺如病毒腹泻基因型
- 深圳市某区幼儿手足口病患病危险因素分析被引量：5
- 2014年
- 目的探讨儿童手足口病患病的危险因素,为有效预防和控制幼儿手足口病的发生提供科学依据。方法根据"国家疾病监测信息报告管理系统",选取深圳市某区2013年1—9月全部经粪便检测为EV71或Cox A16阳性的103例手足口病确诊病例幼儿作为病例组,同时根据病例组选取年龄相差1岁以内、无手足口病症状和体征的幼儿作为对照组进行1∶1配对,对手足口病患病危险因素进行单因素与多因素非条件Logistic回归分析。结果单因素分析结果显示,散居儿童、早产儿、低收入家庭、不能独立排便、保姆育儿、过敏性体质、家长手足口病预防知识薄弱、发病前7 d与他人共用玩具、父母一方学历低于小学、饭前便后不洗或少洗手、发病前7 d因其他疾病就诊11个变量为手足口病发病的危险因素(B值分别为1.24,1.23,1.39,1.17,0.93,1.43,1.40,0.87,1.13,1.41,1.69,P值均<0.05);多因素分析结果显示,散居儿童、不能独立排便、过敏性体质、家长卫生防病意识薄弱、发病前7 d与他人共用玩具、饭前便后不洗或少洗手、发病前7 d因其他疾病就诊等7个因素可能提高发生手足口病的风险(B值分别为1.04,0.76,1.13,1.16,1.08,1.19,1.15,P值均<0.05)。结论儿童手足口病发病的主要危险因素是间接接触。通过强化幼儿及其护理人员的卫生防病知识,使易感人群养成良好的个人卫生习惯,对于有效防控手足口病有重要意义。
- 叶晓玲杨贵清黄敏
- 关键词：手足口病患病率
- 荧光定量RT-PCR定量检测诺如病毒方法的建立及其评价被引量：12
- 2010年
- 目的：建立荧光定量RT-PCR快速检测诺如病毒GⅠ、GⅡ的方法,以用于患者标本的检测、分型及绝对定量。方法：经过优化筛选出最佳反应体系及反应条件,建立荧光定量RT-PCR快速检测诺如病毒的方法;制作两种不同型号的荧光定量PCR仪的绝对定量标准曲线,并从灵敏度、特异性、重复性、对患者标本检测能力等方面对建立的方法进行综合评价。结果：该方法在两种不同型号的仪器上对108-101copy/μl范围内的病毒,具有良好的线性关系,最低灵敏度为101copy/μl。与容易引起腹泻症状的轮状病毒、腺病毒、星状病毒、肠道病毒均无交叉反应;诺如病毒GⅠ、GⅡ两种常见感染人类的亚型之间无交叉反应。批内及批间重复性实验的标准差在0.10～0.59、变异系数在0.43%-2.84%之间,显示该方法重复性较好。用该方法共检测腹泻患者粪便标本181份,其中33份诺如病毒阳性,随机抽取10份阳性标本测序分析,结果证实均为诺如病毒。结论：本研究建立的诺如病毒荧光定量RT-PCR检测方法,灵敏度、特异性、重复性、对患者标本的检测能力等均显示较好的结果,且能快速区分GⅠ、GⅡ两种感染人类的重要亚型,在诺如病毒的快速检测中有着实际推广意义。
- 陈传德周晓红莫艳玲李晖杨贵清卓菲
- 关键词：荧光定量RT-PCR诺如病毒灵敏度特异性
- 七种国产新型冠状病毒核酸检测试剂盒的一致性和检出能力评价研究被引量：25
- 2020年
- 目的比较7种国产新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒的一致性和检出能力,为临床实验室选择检测方法和新型冠状病毒肺炎的诊断提供参考依据。方法收集深圳市罗湖区人民医院2020年1月29日至2月5日2019-nCoV感染确诊患者核酸检测阳性和疑似患者核酸检测阴性的咽拭子标本各10例,采用7种试剂盒(编号a^g)分别进行核酸检测,评价7种试剂盒临床标本检测结果的一致性;选取1份阳性标本核酸用无RNA酶水梯度稀释得到5个浓度梯度盘(浓度1~浓度5),比较不同品牌试剂盒的阳性检出率及批内重复性。结果6种试剂盒检测20例临床标本的阴性和阳性符合率均为100%,仅1种试剂盒的阳性符合率为8/10,阴性符合率10/10;批内重复性显示7种试剂盒在浓度1水平重复检测病毒载量CV值均<5%;在浓度1~浓度3梯度区间,开放阅读框(ORF)1ab基因的检出能力比较显示b、d、f低于a、c、e、g,试剂盒e和g最高(14/15),a试剂盒对N基因检出能力可达15/15,优于其余5种试剂盒。ORF1ab和N基因检出能力综合分析显示d试剂盒检出能力最低(ORF1ab:40%;N:53%),a、b、c、e、f这5种试剂盒检出能力无明显差异。结论7种试剂盒对病毒载量较高的阳性标本检测的准确度和重复性无明显差异,检测性能良好;但部分试剂盒对弱阳性标本的检出能力欠佳,建议弱阳性标本应至少采取两个厂家的试剂盒复核检验,以保障结果的准确性。
- 熊丹阚丽娟王萌萌汤花梅武薇杨贵清卓菲豆小文陈大洋纪翔宗曾艳张秀明
- 关键词：新型冠状病毒核酸类试剂盒实时聚合酶链反应
- 深圳市儿童水痘疫苗免疫效果评价及病毒基因型流行特征研究被引量：5
- 2019年
- 目的了解深圳市儿童水痘-带状疱疹病毒基因型流行特征及Oka株疫苗免疫效果,为制定适宜的水痘疫苗免疫策略提供依据。方法收集水痘病例疱疹液并提取其DNA,采用PCR-RFLP技术鉴定毒株,采用测序比对分析其基因型,通过酶联免疫吸附试验检测不同年龄组已接种水痘疫苗的健康儿童血清水痘抗体水平;采用SPSS18.0软件对结果数据进行分析。结果共调查339名儿童,水痘抗体阳性率为59.00%,抗体含量均值为321.95mU/ml。不同接种年限组的抗体阳性率差异有统计学意义(x^2=9.526,P<0.01)。收集到的23例水痘病例均为野毒株,基因型大多为J型。结论深圳市水痘病例均为野毒株引发,其基因型别为J型;接种水痘疫苗的健康儿童血清水痘抗体阳性率不高,且抗体水平均随着接种年限的增大呈下降趋势,提示仅接种一针水痘疫苗无法达到预期效果,建议首剂接种3年内加强1剂,以提高疫苗的保护效果。
- 杨贵清黎嘉欣卓菲张振李媛
- 关键词：水痘抗体水平基因型别
- 引起深圳市一起疱疹性咽峡炎暴发的柯萨奇A4病毒的鉴定及其VP1区序列分析被引量：6
- 2015年
- 目的鉴定引起2012年深圳市罗湖区一起疱疹性咽峡炎暴发的病原体,并对鉴定的柯萨奇A4病毒(coxsackie virus A4,CVA4)的VP1基因进行全长的序列测定和遗传进化特征分析。方法采集罗湖区某幼儿园疱疹性咽峡炎暴发期间患儿的4份咽拭子样本和1份粪便标本,采用荧光RT-PCR法鉴定CVA4病毒,对阳性样本采用RT-PCR方法扩增CVA4病毒VP1区全长序列,并进行核苷酸序列测定和系统进化分析。结果病原学检测结果显示,引起此次疱疹性咽峡炎暴发的病原体为CVA4病毒。同源性分析显示,引起深圳疱疹性咽峡炎的CVA4病毒SZ-SK12030005、SZ-SK12030007与山东省2010株(KF150144)进化关系最近,核苷酸和氨基酸同源性分别为96.4%和99.5%;与2006年吉林株(JQ715708)的同源性最低,核苷酸和氨基酸同源性分别为87.9%和96.6%。VP1区亲缘进化树显示CVA4-SZ-SK12030005和CVA4-SZ-SK12030007属于GⅠB亚型。结论 GⅠB型CVA4病毒是引起此次深圳市疱疹性咽峡炎疫情的病原体。
- 蔡春林姚相杰卓菲何雅青杨贵清
- 关键词：疱疹性咽峡炎
- 柯萨奇病毒 A2型深圳株 SHZH13-01全基因组序列特征分析被引量：5
- 2014年
- 目的：了解深圳地区柯萨奇病毒A2型（ CVA2） SHZH13-01株的基因特征，研究CVA2的进化及变异状况。方法应用RT-PCR法扩增SHZH13-01株全基因组，PCR产物纯化后进行序列测定和基因进化分析。结果 CVA2-SHZH13-01株的全基因组由7400个核苷酸组成，编码2191个氨基酸。病毒的5′非编码区（UTR）、P1（VP1～VP4）、P2、P3、3′非编码区和全基因组的核苷酸与近年香港分离的新型重组CVA2-HK（431306）序列同源性最高，分别为98．3％、98．8％、99．0％、99．2％、98．8％，98．9％。而与其他肠道病毒相比，SHZH13-01在结构蛋白P1区与CVA2国际原型株Fleet-wood同源性最高，达81．6％，而在非结构蛋白区P2、P3与EV71病毒来自同一分支，同源性达82．8％～88．7％。根据系统进化分析，深圳SHZH13-01病毒株属于CVA2-HK（431306）病毒变异株。通过与CVA2-HK（431306）衣壳区氨基酸比对，CVA2-SHZH13-01的变异位点变化情况为： aa5L→F， aa666S→G， aa671T→I。结论柯萨奇病毒A2型深圳株SHZH13-01属于香港新型重组CVA2-HK（431306株）的变异株。
- 蔡春林姚相杰卓菲何雅青杨贵清
- 关键词：全基因组
- 罗湖区公共场所集中空调水系统中军团菌污染状况被引量：6
- 2013年
- 目的了解深圳市罗湖区公共场所集中空调水系统中军团菌污染状况。方法依据《公共场所集中空调通风系统卫生规范》附录A,随机抽取深圳市罗湖区32家各类公共场所,采集集中空调通风系统的冷却水、冷凝水,对其进行军团菌的分离培养,并通过生化鉴定和血清学试验进行确认和血清分型。结果 32家公共场所中有9家检出军团菌,检出率为28.1%;采集的81份水样中,有14份检出军团菌,检出率为17.3%;共检出16份军团菌,其中嗜肺军团菌有12株,占75%。结论罗湖区集中空调通风水系统中存在军团菌污染,应加强对公共场所集中空调的消毒和管理。
- 卓菲杨贵清赵洁玲龙冬玲沈静媛林奕嘉
- 关键词：公共场所集中空调军团菌
