杨茹
- 作品数:4 被引量:0H指数:0
- 供职机构:上海交通大学医学院附属仁济医院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 髓母细胞瘤动物模型及其建立与应用
- 本发明提供了一种髓母细胞瘤动物模型及其建立与应用。本发明的动物模型细胞中Patched蛋白的表达或活性下降且Trim32蛋白的表达或活性下降。本发明还提供了所述非人哺乳动物模型的构建方法,以及同时携带小脑前体细胞标记物和...
- 高维强王明磊杨茹
- 髓母细胞瘤动物模型及其建立与应用
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- 高维强王明磊杨茹
- 文献传递
- 单细胞分析微环境与髓母细胞瘤预后的关系
- 2021年
- 目的:利用单细胞测序数据分析微环境与髓母细胞瘤预后的关系,探讨微环境细胞对髓母细胞瘤发生和发展的影响。方法:收集Patched^(+/-)转基因小鼠髓母细胞瘤肿瘤组织和正常小鼠的小脑组织进行单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq);从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中下载M-Smo基因髓母细胞瘤小鼠模型的单细胞RNA数据。对所有单细胞RNA数据中的微环境细胞进行整合分析,并使用特异性标志基因识别细胞类型。采用χ^(2)检验比较正常小鼠和肿瘤小鼠,以及肿瘤小鼠维莫德吉(vismodegib)治疗组和对照组(vector)之间的微环境细胞数量差异。通过对微环境细胞群进行差异表达基因分析(differential gene expression analysis,DEG)获取细胞类型的相关基因集,对GEO数据库中髓母细胞瘤患者的RNA表达数据进行基因集变异分析(gene set variation analysis,GSVA),获取微环境细胞相关基因的GSVA得分,以GSVA得分表示微环境细胞相关基因的表达水平和微环境细胞的富集程度。基于微环境细胞相关基因得分,采用Kaplan-Meier法分析微环境细胞相关基因表达水平与髓母细胞瘤患者预后的关系,随后采用热图聚类分析探讨患者微环境细胞富集程度与临床特征的关系。最后采用多因素COX比例风险模型分析可能成为患者总生存期影响因素的微环境细胞类型,从而探讨微环境细胞对髓母细胞瘤发生和发展的影响。结果:髓母细胞瘤小鼠模型中共检测到6种微环境细胞类型:T细胞、成纤维细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和内皮细胞。其中,T细胞和内皮细胞只在髓母细胞瘤小鼠模型中出现。与正常小鼠相比,髓母细胞瘤小鼠模型中少突胶质细胞和小胶质细胞所占百分比更高(P均<0.001),而星型胶质细胞所占百分比更低(P<0.001);髓母细胞瘤小鼠模型的vismodegib治疗组与对照组相比,T细�
- 罗文钦杨茹
- 关键词:髓母细胞瘤微环境小胶质细胞成纤维细胞少突胶质细胞
- 毒蕈碱受体3在前列腺癌治疗中的应用
- 本发明提供毒蕈碱受体3作为药物靶标在前列腺癌治疗中的应用。本发明优点在于:本发明首次发现CHRM3在前列腺肿瘤中高表达,CHRM3的激活能够促进前列腺肿瘤的增殖和迁移,抑制CHRM3能够用作为药物靶标来抑制前列腺肿瘤的生...
- 高维强王乃涛杨茹
- 文献传递