齐晓艳
- 作品数：5 被引量：20H指数：3
- 供职机构：宁波大学更多>>
- 发文基金：宁波市科技创新团队项目国家自然科学基金浙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 泥蚶(Tegillarca granosa)基因组SSR和EST-SSR的开发及比较研究被引量：11
- 2013年
- 采用SSPHunter软件在泥蚶(Tegillarca granosa)磁珠富集文库和454转录组文库中搜索核心序列长度12bp以上的2—6核苷酸重复序列,根据富集文库所得基因组SSR侧翼序列设计47对引物,可成功扩增17对且均为多态性引物,多态率100%,平均等位基因数(Na)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态性信息含量(PIC)分别为6.8、0.468、0.785、0.733。11344条EST序列中得到1683个SSR位点,检出率14.83%,平均每3.85kb出现1个位点。根据部分EST序列设计120对引物,62对可扩增出目的片段,其中29个位点具有多态性,多态率为46.77%,平均Na、Ho、He、PIC分别为4.2、0.372、0.554、0.500,均低于基因组SSR。双变量相关性分析的结果表明,46个多态性SSR位点的核心序列长度与其Na、Ho、He、PIC极显著正相关,Spearman相关系数分别为0.632、0.387、0.657、0.
- 周小龙朱靖华董迎辉林志华富凯立姚韩韩齐晓艳
- 关键词：泥蚶基因组SSREST-SSR
- 文蛤30个微卫星标记的开发及在斧文蛤和帘文蛤中的通用性检测被引量：11
- 2013年
- 为开展文蛤多态性微卫星标记及其在斧文蛤和帘文蛤中的通用性研究,实验从磁珠富集法构建的基因组文库和EST文库中开发了30个文蛤多态性微卫星标记,包括8个G-SSR和22个EST-SSR多态性位点。共获得140个等位基因,平均等位基因数为4.67;多态性信息含量、观测杂合度、期望杂合度分别为0.172～0.744、0.040～0.720、0.187～0.793;G-SSRs的平均等位基因数、平均多态性信息含量、平均观测杂合度和平均期望杂合度都较EST-SSRs高;Hardy-Weinberg平衡检测发现,24个位点偏离了平衡状态;利用BLASTx对含多态性SSR位点的EST进行功能注释,11个位点来自注释基因序列。将30对文蛤多态性SSR引物分别在斧文蛤和帘文蛤中进行了通用性检测,通用率分别为40%和30%。这些微卫星多态性位点的获得,为进一步开展文蛤遗传多样性分析、种质资源评价、分子标记辅助选育等奠定了基础,并且可用于文蛤、斧文蛤和帘文蛤的比较作图、基因发掘和QTL定位等研究。
- 齐晓艳董迎辉姚韩韩周小龙林志华
- 关键词：文蛤EST-SSRS多态性
- 文蛤（Meretrix meretrix）壳色花纹性状的分子遗传基础研究
- 文蛤（Meretrix.meretrix）是我国沿海水产养殖的重要经济贝类，其丰富多彩的壳色花纹可以遗传给后代，并且与生长、抗逆等经济性状密切相关，一些色泽鲜艳的文蛤商业价值显著提高。许多水生动物体色、壳色多态性的产生是...
- 齐晓艳
- 关键词：文蛤壳色QRT-PCR类胡萝卜素MSAP
- 文献传递
- 24个泥蚶EST-SSR标记的开发与分析被引量：4
- 2013年
- 摘要：利用3000条泥蚶（Tegillarca granosa）单拷贝序列，筛选到132条含有SSR候选位点序列，成功设计引物50条。群体多态性检测结果显示，24个SSR位点为多态性，各位点的等位基因介于2-5个，平均等位基因数3．5个；观测杂合度舶、期望杂合度He、多态信息含量Ⅳc范围分别为0．000-0．591、0．045～0．727、0．043～0．696；多态位点中有11个高度多态、4个中度多态、9个低度多态；进行哈迪一温伯格平衡检测后，用Bonferronicorrection法进行校正，结果有17个位点显著偏离平衡。
- 史松富姚韩韩林志华周小龙齐晓艳董迎辉
- 关键词：EST-SSR
- 文蛤GGPS和crtO基因的克隆及其与壳色的相关性研究
- 文蛤(Meretrix.meretrix)是我国沿海滩涂养殖的重要经济贝类,其多彩精美、变异丰富的壳色花纹可以遗传给后代,且与生长、抗逆等经济性状显著相关,一些色泽鲜艳的文蛤商业价值显著提高。许多水产动物体色、壳色的多态...
- 齐晓艳董迎辉姚韩韩史松富顾向飞林志华
- 关键词：文蛤壳色QRT-PCR
