陈学峰
- 作品数:14 被引量:99H指数:5
- 供职机构:武汉大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学水利工程更多>>
- 红莲优6号杂交水稻与亲本三系不同发育时期幼苗叶片基因表达差异分析被引量:4
- 2003年
- 运用 DDRT- PCR对红莲型杂交稻组合红莲优 6号及其亲本、保持系 (粤泰 A、粤泰 B、9311)的一叶期、三叶期叶片基因表达状况进行分析。结果表明 :杂种与亲本之间在同一发育时期基因表达既有质量上又有数量上的差异 ,但差异表达基因所占比例较小 ;而对于同一材料 ,一叶期、三叶期的叶片 c DNA扩增带型相似 ,没有发现基因质上的差异表达 ,说明一叶期与三叶期幼苗叶片基因表达差异很小。实验也证明 DDRT- PCR技术结合银染方法是一种简单快速分析差异表达基因的有效方法。
- 张义平陈学峰熊建华朱英国
- 关键词:红莲优6号杂种优势幼苗
- 运用银染mRNA差异显示方法分析杂交水稻红莲优6号基因表达差异被引量:12
- 2003年
- 运用非同位素银染mRNA差异显示方法 ,分析红莲型杂交水稻组合基因表达差异。以杂交水稻及其亲本三系 (YTA、YTB、93 1 1 )三叶一心期叶片RNA为模板采用锚定引物 5′dT1 2MN 3′和随机引物组合 ,进行反转录差异显示PCR。经 5 .6%测序胶电泳分离后用银染方法显示差异DNA条带 ,在直观下 ,从凝胶中回收差异条带并进行再扩增 ,2 %琼脂糖电泳得到了DNA的单一带型。
- 张义平陈学峰熊建华
- 关键词:杂交水稻基因表达
- 红莲型杂交水稻红莲优6号及其亲本苗期与分蘖期根系基因表达差异分析
- 运用 mRNA 差异显示技术(DDRT-PCR)对红莲型杂交稻组合红莲优6号及其亲本(粤泰 A、扬稻6号)、保持系 (粤泰 B)苗期、分蘖期根系的基因表达状况进行了分析。结果显示,不同发育时期之间差异表达基因远少于同一时...
- 熊建华陈学峰张义平朱英国李阳生
- 关键词:MRNA差异显示杂种优势
- 文献传递
- 水稻冷胁迫诱导的甲基化差异片段CIDM7的分离和分析被引量:51
- 2005年
- 采用基于AFLP的甲基化敏感扩增多态性的方法对5℃冷处理48h的水稻9311叶片DNA胞嘧啶甲基化模式进行了初步研究,发现冷处理48h后9311基因组中一些CCGG位点发生了重新甲基化或去甲基化,并获得一些与水稻cDNA高度同源的甲基化差异片段,其中CIDM7(coldinducingdifferentialmethylation)片段在冷胁迫后去甲基化。Northern杂交证明CIDM7在冷胁迫后增强表达。通过在日本晴全长cDNA数据库中的同源搜索获得其全长cDNA序列,该cDNA序列全长1422bp,编码425个氨基酸,经氨基酸序列分析为一个具有Fbox结构的假定蛋白。CIDM7为单拷贝,定位于日本晴10号染色体12.56~12.57Mb。
- 华扬陈学峰熊建华张义平朱英国
- 关键词:水稻AFLP冷胁迫
- 水稻杂种超亲表达26S蛋白酶体亚基基因OsHL1的克隆和分析被引量:7
- 2004年
- 运用DDRT PCR分离获得水稻杂种一代超亲表达的cDNA片段。以此序列在日本晴cDNA全长数据库进行同源搜索 ,检索到一个功能未知的全长cDNA ,有 16 90bp,命名为OsHL1,进一步分析发现它位于 3号染色体上R2 393和MRG4 5 4 8之间。序列分析表明 ,该基因与日本晴编码 2 6Sproteasomeregulatoryparticlenon ATPasesubunit5基因片段的序列同源性为97%。其中包含一个完整的开放阅读框 (ORF) ,编码 4 4 3个氨基酸 ,氨基酸序列同源性分析发现高度保守区。RT PCR显示OsHL1基因的表达受到ABA和MeJA处理下调。推测杂种的表现可能与 2 6S蛋白酶体亚基参与的信号调控相关。
- 张义平陈学峰熊建华华扬李阳生
- 关键词:水稻杂种优势基因克隆
- 水稻杂种与亲本间差异表达cDNA片段S600的分离克隆被引量:4
- 2005年
- 采用cDNA-AFLP技术分离克隆了水稻杂种与亲本间差异表达基因片段S600。Northern杂交结果表明:在分蘖期和始穗期,S600在杂种和父本中表达丰度均较高,而在母本中表达丰度相对较低。S600在分蘖期和始穗期表达量不同,暗示了该基因的表达还受到发育时期的调节。同源搜索结果表明S600片段是水稻SBPase的部分编码序列。为了获得完整编码序列,以S600序列检索粳稻日本晴cDNA数据库,获得了两个高度同源(99%)且功能未知的全长cDNA克隆(AK062089和AK065773)。序列分析表明它们均包含一个相同的1179bp的开放阅读框,编码392个氨基酸组成的水稻SBPase前体,其中包含有与底物结合、氧化还原调节有关的保守氨基酸残基。检索发现该基因在水稻日本晴基因组中只有单个座位。
- 陈学峰熊建华张义平华扬李阳生朱英国
- 关键词:水稻杂种
- ATP依赖型染色质重塑复合物在DNA双链断裂修复中的作用被引量:2
- 2016年
- DNA双链断裂修复缺陷易导致细胞基因组稳定性失衡、细胞发生癌变或死亡。真核生物主要通过同源重组和非同源末端连接两条途径来修复双链断裂。近年来发现多种ATP依赖型的染色质重塑蛋白复合物,包括RSC、INO80、Fun30、SWI/SNF和SWR1,直接参与了DNA双链断裂修复过程。它们主要通过调控DNA损伤检查点激活、断裂末端剪切及组蛋白H2AZ-H2B/H2A-H2B置换等重要步骤发挥功能。现以酿酒酵母中的研究为重点,综述主要ATP依赖型染色质重塑复合物在DNA双链断裂修复中的功能及作用机制。
- 周建杰陈学峰
- 关键词:DNA双链断裂检查点同源重组
- 水稻杂种与亲本之间差异表达基因的分离克隆及表达研究
- 随着世界人口的不断增长,对粮食总量的需求也不断增加.目前,主要通过杂种优势的利用来实现农作物增产的目的.尽管杂种优势在生产应用中创造了巨大的经济效应,但人们对于杂种优势的机理的认识仍然十分有限,这严重束缚了对杂种优势的进...
- 陈学峰
- 关键词:水稻杂种亲本差异表达基因功能基因组研究杂交水稻组合农作物增产
- 红莲优6号杂交水稻与亲本三系不同发育时期幼苗叶片基因表达差异分析
- 运用 DDRT-PCR 对红莲型杂交稻组合红莲优6号及其亲本、保持系(粤泰 A、粤泰 B、9311)的一叶期、三叶期叶片基因表达状况进行分析。结果表明:杂种与亲本之间在同一发育时期基因表达既有质量上又有数量上的差异,但差...
- 张义平陈学峰熊建华朱英国
- 关键词:红莲优6号杂种优势幼苗
- 文献传递
- 水稻景天庚酮糖-1,7-二磷酸酶基因的克隆及表达分析
- 通过cDNA-AFLP从水稻9311(Oryza sativa L,indica)中分离到了杂种与亲本间差异表达的基因片段S600,测序结果显示S600为水稻景天庚酮糖-1,7-二磷酸酶部分编码序列。该酶对于控制Calv...
- 陈学峰熊建华李阳生朱英国
- 关键词:磷酸酶基因
- 文献传递