王燕群
- 作品数：5 被引量：6H指数：2
- 供职机构：四川农业大学更多>>
- 发文基金：长江学者和创新团队发展计划国家科技支撑计划四川省青年科技基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 猪巨细胞病毒PCR检测方法的建立及应用被引量：2
- 2011年
- 参考GenBank中收录的猪巨细胞病毒(PCMV)DNA聚合酶基因序列设计合成了一对引物,扩增目的片段为236 bp。进行PCR检测方法的特异性、敏感性和重复性试验,建立了PCMV的PCR检测方法。结果表明,该方法对模板的最低检测量为1.1 pg,具有良好的特异性、敏感性和重复性。应用该法对猪同时感染PCMV和PRRSV相关性进行初步探究,36份PRRSV阳性病料中,PCMV检出率为63.89%。该法可用于PCMV的临床发病诊断和流行病学监测等。
- 刘红亮朱玲徐志文王燕群魏浩澈郭万柱赵玲
- 关键词：DNA聚合酶PCR
- 猪巨细胞病毒SC株DNA聚合酶基因的克隆及生物信息学分析被引量：2
- 2011年
- 为克隆出猪巨细胞病毒SC株DNA聚合酶(DPOL)基因并对其进行分析,根据GenBank中的DPOL基因序列(AF268040)设计了1对引物,用PCR法扩增出猪巨细胞病毒SC株DPOL基因,将其克隆到T载体,测序并进行生物信息学分析。测序结果表明,猪巨细胞病毒DPOL基因全长3 024bp,为一个完整ORF,共编码1 008个氨基酸;与参考毒株的核苷酸同源性为98%,系统进化树表明猪巨细胞病毒与人疱疹病毒6型和7型关系最近;运用生物信息学软件推导出该蛋白的基本性质,并预测出高级结构。成功地进行了猪巨细胞病毒SC株DPOL基因的克隆和生物信息学分析,为今后此基因生物学功能和猪巨细胞病毒复制机理的研究以及病毒系统分类工作提供了参考。
- 王燕群徐志文郭万柱朱玲梅淼
- 关键词：DNA聚合酶基因克隆生物信息学分析
- 四川省猪巨细胞病毒病感染调查及分析被引量：2
- 2013年
- 为了掌握四川省猪巨细胞病毒病感染情况,为今后的猪巨细胞病毒病防治打下基础,进行了猪巨细胞病毒病感染情况的调查和分析工作。实验采用四川农业大学动物生物技术中心建立的PCMV套式PCR检测方法,对采自四川省11个地市的204份血清和组织样品进行了检测,感染调查结果显示,目前四川地区的规模化猪场普遍存在猪巨细胞病毒感染情况,抗原平均阳性率高达81.9%。该病毒在猪各器官内均有分布,在不同类别的猪群中,仔猪、保育猪和种母猪的抗原阳性率很高,都达到80%以上,种母猪平时不发病,但受感染母猪会产出木乃伊胎和弱仔,会严重影响猪种群质量和猪场经济效益。
- 刘骁徐志文周远程王燕群史小红
- 关键词：PCR检测
- PCMV DPOL基因的克隆分析及基于此基因PCR检测方法的建立与初步应用
- 本研究根据GenBank登录序列(AF268040)设计一对特异性引物,用PCR法扩增出PCMV SC株DPOL基因,将其克隆到T载体,测序并进行生物信息学分析。测序结果表明PCMV DPOL基因全长3024bp,为一个...
- 王燕群
- 关键词：DNA聚合酶猪伪狂犬病病毒猪细小病毒猪圆环病毒2型多重PCR
- 文献传递
- 猪细胞巨化病毒四川株MCP基因克隆及其编码蛋白的生物信息学分析被引量：1
- 2011年
- 参照GenBank公布的仅有的日本株猪细胞巨化病毒较大衣壳蛋白(MCP)基因序列(登录号:AB051069)设计2对引物,采用分步克隆的方法,将PCMV MCP全序列克隆入pMD19-T载体进行测序,成功获得了pMD-MCP重组质粒,将所得序列录入到GenBank中(登录号:HQ025802)。测序结果表明,该MCP基因全长4 017bp,共编码1 338个氨基酸;与NCBI上公布的仅有的日本毒株MCP基因的核苷酸同源性为96.8%,氨基酸同源性为94.1%;进化分析显示:PCMV MCP基因与人疱疹病毒6型或7型的MCP基因亲缘关系较近;利用生物信息学软件对蛋白质结构特征进行分析,发现该蛋白含有59个潜在的磷酸化位点,潜在功能强大;亚细胞定位预测结果表明该蛋白主要存在于线粒体中和细胞质中并各占39.1%和26.1%,内质网占17.4%,高尔基体占8.7%,空泡和细胞核均占4.3%,表明PCMV MCP蛋白属于胞质蛋白,抗原区位集中于胞膜,有向胞质移动的趋势;另该成熟蛋白存在18个主要的抗原位点,将肽链经亲水性与抗原表位的共同分析,发现其肽链的C端极有可能分布有抗原决定簇。
- 史小红徐志文郭万柱朱玲漆信桥王燕群赵玲
- 关键词：克隆生物信息学分析
