刘基生 作品数:5 被引量:20 H指数:3 供职机构: 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 更多>> 发文基金: 农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室项目 国家高技术研究发展计划 国家科技支撑计划 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
结球甘蓝BoCBF1与BoCBF2基因的CAPS标记及其对耐寒性的影响 被引量:4 2012年 以两份具有不同耐寒性的甘蓝自交系341和21-3为试材,根据已有拟南芥CBF1基因序列及甘蓝基因组测序拼接出的Scaffold信息,获得了甘蓝BoCBF1和BoCBF2基因编码区的全长序列。经PCR产物直接测序发现BoCBF1基因在自交系341和21-3间的变异表现为4个单核苷酸多态性(SNP),而BoCBF2基因则表现为16个SNP及1个18bp碱基的插入缺失(InDel)。为简便快捷地鉴定两个自交系间BoCBF1和BoCBF2基因序列的变异,开发了BoCBF1和BoCBF2基因的CAPS标记,分别命名为BoCBF1-TaqαⅠ和BoCBF2-BstUⅠ。利用这两个CAPS标记对两个自交系、F1、F2群体的基因型与耐寒性进行相关性分析,发现这两个基因的变异与材料的耐寒性极显著相关,可用该标记进行甘蓝耐寒育种的分子标记辅助选择。 靳哲 张扬勇 方智远 刘玉梅 杨丽梅 庄木 刘基生 孙培田关键词:结球甘蓝 CAPS标记 耐寒性 甘蓝自交系背景选择标记的建立 被引量:7 2014年 为了快速、准确识别不同甘蓝自交系的遗传背景,提高回交育种效率,利用36对多态性EST-SSR引物对8个甘蓝变种的101份自交系进行扩增,应用NTSYSpc2.11a进行遗传背景分析表明,不同甘蓝变种种内平均遗传相似系数都大于0.55,变种间遗传相似系数为0.45~0.59,101份自交系在遗传相似系数0.62处基本可聚为8个类群。在此基础上,选出23份具有代表性的自交系材料,增加筛选获得多态性稳定的50对EST-SSR引物,初步建立了一套包含86对引物的甘蓝背景选择标记,并应用于甘蓝自交亲和性的回交选择。 刘基生 苗雯雯 王冬梅 庄木 方智远 刘玉梅 杨丽梅 张扬勇 李占省关键词:甘蓝 自交系 EST-SSR 与甘蓝中心柱长相关联的EST-SSR标记分析 被引量:2 2014年 利用40个EST-SSR标记,对100份甘蓝自交系组成的自然群体进行遗传结构分析,采用TASSEL3.0软件的GLM(general linear model)和MLM(mixed linear model)模型,对甘蓝中心柱长和中心柱长/球高比值性状进行关联分析。结果显示供试材料可分为3个亚群;EST-SSR位点间有较高的多态性和一定程度的连锁不平衡;以GLM模型分析,共检测出5个标记的7个位点与中心柱长性状相关联,2个标记的3个位点与中心柱长/球高性状相关联,其中2个位点同时与两个性状相关联;以MLM模型分析,共检测出3个标记的4个位点与中心柱长性状相关联,1个标记的2个位点与中心柱长/球高性状相关联,其中2个位点同时与两个性状相关联。GLM和MLM两种模型同时检测到了与中心柱长/球高相关联的1个标记的2个位点以及与中心柱长相关联的3个标记的4个位点。 孙朋朋 刘基生 张扬勇 方智远 刘玉梅 杨丽梅 龚义勤 柳李旺 李占省 庄木关键词:甘蓝 EST-SSR 结球甘蓝核基因组密码子使用偏爱性分析 被引量:7 2013年 根据甘蓝测序结果,利用CodonW软件对结球甘蓝的48 000个蛋白质编码基因序列进行了分析,计算出同义密码子相对使用频率,确定了TCT、CCT、AGA、GTT、GCT、GAT等6个高频密码子。将甘蓝与大肠杆菌、拟南芥、棉花、水稻的密码子使用频率进行了比较,发现甘蓝密码子使用偏爱性与同为双子叶植物的拟南芥、棉花基本一致,而与大肠杆菌及单子叶植物水稻均具有较大差异。以甘蓝密码子用法分析结果为依据,对Bt cry1C抗虫基因进行了密码子的改造,得到了具有甘蓝密码子使用特点的cry1C基因序列,为甘蓝的转基因研究奠定了分子基础。 仪登霞 杨丽梅 方智远 刘玉梅 庄木 张扬勇 刘基生 刘博 武剑 耿丽丽 张杰 张振贤关键词:甘蓝 密码子用法 密码子偏爱性 96份甘蓝变种的遗传多样性及聚类分析 利用EST-SSR分子标记对96份甘蓝类材料进行多样性及聚类分析.50对引物共扩增出153条多态性DNA谱带,平均每对引物扩增出3.06条带;每对引物扩增的条带数变幅为2-6,引物的多态信息量(PIC)变化范围是0.15... 刘基生 王冬梅 庄木 刘玉梅 杨丽梅 张扬勇 方智远关键词:聚类分析 EST-SSR