潘晓玲
- 作品数：9 被引量：81H指数：5
- 供职机构：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项广西壮族自治区卫生厅重点科研课题国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 广西北流市分离到基因Ⅰ型流行性乙型脑炎病毒被引量：8
- 2010年
- 目的从广西流行性乙型脑炎(乙脑)监测点之一的北流市分离乙脑病毒并研究其基因分型。方法2006年在广西北流市采集蚊虫标本,在C6/36和BHK-21细胞上进行病毒分离,对病毒分离物进行多种虫媒病毒抗体的酶联免疫吸附试验,获得的乙脑病毒进行E基因扩增、测序和基因分型。结果在北流市采集骚扰阿蚊2588只和三带喙库蚊230只,分61批进行处理,获得3个病毒分离物,酶联免疫吸附试验与乙脑抗体反应,E基因测序后基因分型显示为基因Ⅰ型乙脑病毒。结论从广西蚊虫标本分离到基因Ⅰ型乙脑病毒。
- 莫兆军吕新军谭毅谢长江闭福银李幸乐潘晓玲孙肖红王环宇付士红梁国栋
- 关键词：乙型脑炎病毒E基因基因型蚊虫
- 2005年广西媒介蚊虫中流行性乙型脑炎病毒的分离鉴定被引量：8
- 2010年
- 目的对广西流行性乙型脑炎(乙脑)流行区的蚊虫进行乙脑病毒分离鉴定。方法2005年6、7月在北流市和靖西县居民区的畜圈内采集蚊虫标本,用C6/36和BHK21细胞分离乙脑病毒,用ClustalX(1.8)、Mega3.1等软件进行分离株E基因序列比对和系统进化分析。结果两地共采集三带喙库蚊771只、骚扰阿蚊425只,从三带喙库蚊中分离到3株基因1型乙脑病毒,3株病毒之间E基因片段核苷酸和氨基酸的最大同源性为99.3%和99.8%,与越南毒株之间核苷酸和氨基酸的最大同源性为98.4%和99.6%。结论从2005年采集自广西的蚊虫中分离到3株基因1型乙脑病毒,这是首次报道在广西分离到基因1型乙脑病毒。
- 孙肖红谭毅王环宇莫兆军谢艺红冯云闭福银周开娇孟维珊潘晓玲付士红梁国栋
- 关键词：乙脑病毒
- 流行性乙型脑炎病毒脑脊液分离株“47株”全基因组特征分析被引量：3
- 2009年
- 目的对1950年分离自我国黑龙江省患者脑脊液的乙脑病毒“47株”进行全基因组序列的测定和分析，全面了解其全基因组特征。方法复苏毒种提取病毒RNA，使用自行设计的乙脑病毒全基因组扩增测序引物，完成对病毒全基因组序列的测定。采用DNAStar、Modehest、Phylip等生物软件完成全基因组核苷酸、氨基酸序列差异分析和乙脑病毒全基因组的系统进化分析。结果乙脑病毒“47株”全长10977个核苷酸。96至10391位为开放读码框ORF，共10296个核苷酸，编码3432个氨基酸。“47株”与5株疫苗株在全基因组水平的核苷酸差异在2．4％-4．4％之间，氨基酸差异在0．3％～1．1％之间。乙脑病毒全基因组最适进化模型为GTR＋I＋G。全基因组进化分析显示“47株”属于基因Ⅲ型乙脑病毒。结论“47株”全基因组核苷酸和氨基酸高度保守，属于基因Ⅲ型乙脑病毒。
- 潘晓玲王环宇付士红韩娜刘海舟Simon Rayner梁国栋
- 关键词：种系发生基因扩增
- 我国新分离乙脑病毒02-76株的全基因序列特征被引量：11
- 2006年
- 目的对我国新分离乙脑病毒02-76株进行全基因序列测定和分析，了解乙脑病毒基因组结构及毒力特性。方法设计乙脑病毒全基因组扩增引物，RT-PCR扩增片段，PCR产物直接测序，拼接后获得全基因序列。通过Clustal X（1．8）、DNASTAR、GENEDOC（3．2）等生物学软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析。结果新分离乙脑病毒02．76株全基因组全长10977个核苷酸，从96位到10391位，共10296个核苷酸编码一个开放阅读框，编码3432个氨基酸。与我国1949年分离的Beijing-1株相比较共存在248个核苷酸差异，16个氨基酸差异。与GenBank中选择的29株乙脑病毒全基因序列比较发现，其核苷酸总体差异率为0．6％-15．1％，氨基酸总体差异率为0．2％-4．6％。通过PrM／C区段、E区段、3’NTR区段及全基因序列进行系统进化分析均显示该毒株属于基因3型乙脑病毒。结论新分离的乙脑病毒02-76株属于基因3型，与中国分离株SA-14进化关系最接近。
- 王环宇潘晓玲付士红王雷李铭华Ichiro Kurane梁国栋
- 关键词：脑炎病毒基因种系发生
- 两种基因型流行性乙型脑炎病毒在上海市共同流行被引量：3
- 2012年
- 目的掌握上海市流行性乙型脑炎(乙脑)病毒基因型别特征。方法 2002-2005年在上海市奉贤县养猪场采集蚊虫标本,研磨处理后分离病毒,完成病毒细胞学、动物学、血清学及分子生物学鉴定。测定病毒全基因组序列,应用ATGC、ClustalX(1.83)、MegAlign、GeneDoc3.2和Mega5.0等生物学软件完成序列拼接、比对、核苷酸与氨基酸同源性分析、系统进化分析。结果共采集38347只蚊虫标本,主要是三带喙库蚊。分离到13株乙脑病毒。测定13株乙脑病毒全基因组序列,结合上海市其他年份分离的乙脑病毒及涵盖5个基因型别的其他乙脑病毒全基因组序列,通过系统进化分析发现,上海市2001、2003、2005和2007年分离的乙脑病毒属于基因Ⅰ型,2004年和2006年分离的乙脑病毒属于基因Ⅲ型。结论 2种基因型别乙脑病毒(Ⅰ、Ⅲ型)在上海市共同流行。
- 王环宇付士红何英闵继光潘晓玲梁国栋
- 关键词：流行性乙型脑炎病毒基因型系统进化分析
- 病毒性脑炎被引量：48
- 2006年
- 潘晓玲梁国栋
- 关键词：病毒性脑炎无菌性脑膜炎病毒性脑膜炎脑实质炎症病毒性脑膜脑炎中枢神经系统
- 中国滇西北地区分离流行性乙型脑炎病毒的分子特征研究被引量：5
- 2009年
- 目的对中国滇西北地区分离的流行性乙型脑炎（乙脑）病毒进行分子特征研究，了解与云南省内其他地区病毒株的差异。方法用RT-PCR的方法扩增滇西北地区分离的13株乙脑病毒PrM、E片段和3’非编码区，对扩增产物进行序列测定。用Clustal1．8X、DNASTAR、GENEDOC等生物学软件进行核苷酸序列和系统进化分析。结果基于PrM和E基因核苷酸序列的系统进化显示，滇西北分离的13株乙脑病毒中有12株属于基因I型，1株为基因Ⅲ型；12株基因I型乙脑病毒与云南省其他地区分离的病毒株处于不同分支；和云南省其他地区分离株之间E基因核苷酸序列差异度为0．2％～13．9％；3’非编码区存在两种核苷酸缺失情况，基因I型毒株在终止密码子后出现3处缺失，而基因Ⅲ型毒株只有1处缺失。结论滇西北地区乙脑病毒分离株以基因I型为主，E基因核苷酸序列与云南省其他地区分离株差异不明显；基因I型毒株在3’非编码区存在3处缺失，而基因Ⅲ型毒株则只有1处缺失。
- 孙肖红王环宇潘晓玲付士红冯云孟维珊梁国栋
- 关键词：流行性乙型脑炎病毒分子特征基因分型
- 乙型脑炎病毒全基因组分子进化及基因重组研究
- 乙脑病毒(Japanese Encephalitis Virus,JEV)为黄病毒科黄病毒属单股正链RNA病毒。病毒基因组全长约11kb,编码十余个结构与非结构蛋白。该病毒感染可以引起人畜共患传染病,临床称为乙脑,病死率...
- 潘晓玲
- 关键词：乙型脑炎病毒分子进化同源重组
- 文献传递
- 2008年辽宁省乙脑病毒分离株全基因组特征分析被引量：4
- 2009年
- 目的对2008年分离自辽宁蚊虫的乙脑病毒株进行全基因组序列测定和分析，了解其全基因组特征。方法使用针对乙脑病毒全基因组测序引物，RT-PCR扩增片段，完成对病毒全基因组序列的测定。应用ClustalX（1．83）、ATGC（V4）、DNAStar、GENEDOC（3．2）、Mega（4．0）等生物学软件完成全基因组核苷酸和氨基酸序列分析及病毒的系统进化分析。结果乙脑病毒LN0828株基因组全长10965个核苷酸，其中从97位到10392位为开放读码框，编码3432个氨基酸。与GenBank中的32株乙脑病毒在全基因组水平的核苷酸总体差异率为1．6％～16．4％，氨基酸总体差异率为0．3％～5．1％。与减毒活疫苗株SA14—14．2相比，编码区共存在1186个核苷酸差异，86个氨基酸差异。全基因组序列系统进化分析显示LN0828株属于基因Ⅰ型乙脑病毒。结论与该地区2002年和2007年乙脑病毒分离株高度同源，关键位点氨基酸未见变异。
- 曹玉玺付士红王环宇潘晓玲张稷博梁国栋
- 关键词：基因型种系发生
