黄俊
- 作品数:32 被引量:39H指数:4
- 供职机构:广西科学院更多>>
- 发文基金:广西壮族自治区自然科学基金国家高技术研究发展计划广西壮族自治区科技攻关计划更多>>
- 相关领域:生物学轻工技术与工程化学工程环境科学与工程更多>>
- 一种外切型海藻酸裂解酶Alg1982基因及其应用
- 本发明公开了一种外切型海藻酸裂解酶Alg1982基因及其应用,本发明的海藻酸裂解酶Alg1982基因经过工程菌构建后获得产外切型海藻酸裂解酶Alg1982的工程菌,其产生的外切型海藻酸裂解酶Alg1982对底物PolyG...
- 林梅廖思明王巧贞卢波 梁士颉黄俊 欧阳玉滢 覃秋容黄庶识
- 参环毛蚓(Amynthas aspergillum)基因组测序及其特征分析
- 2024年
- 参环毛蚓(Amynthas aspergillum),俗称广地龙,是中国广东与广西地区广泛分布的蚯蚓(Earthworm)物种,具有重要的药用价值。本研究采用流式细胞术与高通量测序方法对参环毛蚓基因组进行分析,测算出其大小、重复序列、杂合率和GC含量等,并利用生物信息学对基因组进行预测、注释和基因家族鉴定。结果表明,参环毛蚓基因组大小约1 Gb,通过从头组装二代测序数据,获得全长为765.69 Mb的Contig序列,组装成单倍体基因组641 Mb左右。其中,重复序列为386.28 Mb,占全长的50.42%,GC含量为40.34%,杂合率为1.68%,表明参环毛蚓基因组具有高重复、高杂合等特征。该基因组共预测到27864个基因,其中99.04%基因能在功能数据库中找到注释,较多基因富集于信号转导(Signal transduction)、内分泌系统(Endocrine system)及与传染疾病(Infectious disease)相关功能上。通过对巨蚓科(Megascolecidae)所属物种的线粒体组的分析,蚯蚓种内的遗传距离(p-distance)有着较宽的分布(0-15.1%),其中壮伟远盲蚓(A.robustus)显示最大的种内遗传距离(15.1%),其次是Duplodicodrilus acinctus(13.6%)与Pheretima kutamaensis(10.9%),而参环毛蚓种内遗传距离为1.9%。不同物种间的遗传距离计算结果表明,参环毛蚓与加州腔蚓(Metaphire californica)的遗传距离(16.0%)最小,其次是标记远盲蚓(A.masatakae,16.2%)与壮伟远盲蚓(16.2%),以上4个物种同属于广西区域广泛分布的蚯蚓物种。根据核基因组的数据,参环毛蚓与通俗腔蚓(M.vulgaris)、皮质远盲蚓(A.corticis)的遗传距离分别为15.64%、20.03%,而通过线粒体基因组计算的遗传距离分别为21.00%与19.80%,提示无论是基于形态和解剖特征的传统分类学,还是基于线粒体谱系的分类,在单独使用时均有一定的局限性,因此全面厘清蚯蚓物种间的进化历程需依赖更多的核基因组数据。本研究为参环毛蚓全基因组的精细测序、遗传多样性保�
- 张君江顺达李秀芝李雪松卢波黄俊刘军彭立新
- 关键词:参环毛蚓基因组分析基因组大小
- 里氏木霉纤维二糖水解酶基因cbh1的分子改造被引量:4
- 2014年
- 【目的】用分子改造的方法改造里氏木霉(Trichoderma reesei)的纤维二糖水解酶基因cbh1,提高其纤维素酶活力,为工业化生产纤维素酶提供参考。【方法】用DNase Ⅰ消化里氏木霉cbb1,回收100bp左右的片段后用T4DNA连接酶连接,以连接产物作为模板进行PCR扩增,将PCR改造的cbh1基因转化里氏木霉原生质体,使改造的cbh1基因与里氏木霉原有的cbh1基因发生同源重组。通过比较滤纸酶活力的方法筛选纤维素酶活力提高的突变菌株,在NCBI上比对分析突变菌株的cbh1序列。【结果】经克隆测序获得基因片段大小为637bp,与里氏木霉同属菌株cbh1基因的相似性在88%-98%,确定为里氏木霉cbh1的基因片段。经DNaseⅠ消化15min、T4DNA连接酶连接、经PCR扩增获得改造后的cbh1基因。将改造cbh1基因片段转化里氏木霉原生质体,得到cbh1基因突变体库。从cbh1基因突变体库中筛选获得1株纤维素酶滤纸酶活比出发菌株高1.7518倍的突变菌株E2-1。序列比对分析发现,与出发菌株相比,突变菌株E2-1的cbh1基因有14个碱基发生了突变,其中5个碱基为置换突变,8个碱基为缺失突变,1个碱基为插入突变,分布于cbh1基因的9个位置。【结论】改造后的cbhI基因能与里氏木霉的染色体DNA发生同源重组,进而提高突变菌株的纤维素滤纸酶活力。
- 陈小玲张穗生黄俊雷富陈东
- 关键词:里氏木霉纤维素酶分子改造碱基突变
- 酸性木聚糖酶产生菌XYW5的筛选及酶学性质被引量:7
- 2018年
- 【目的】选育优良的产酸性木聚糖酶的微生物,考察酸性木聚糖酶的酶学性质(尤其是pH值为4.0),为实现纤维素乙醇低成本清洁生产打下基础。【方法】从广西大学农场采集土壤,富集后经产酸性木聚糖酶的培养,比较酸性木聚糖酶酶活力,选育酸性木聚糖酶高产菌株,鉴定菌种,分析酶学性质。【结果】筛选出产酸性木聚糖酶酶活力较高的菌株XYW5。扩增菌株XYW5的ITS rDNA序列,经测序分析比对,将其初步鉴定为日本曲霉Aspergillus japonicus XYW5。菌株XYW5产酸性木聚糖酶和酸性木糖苷酶的酶活力最高分别达(26. 26±0. 97)U/mL和(0.63±0.02) U/mL,比活力分别为(85.50±0.63) U/mg和(1.80±0.01) U/mg;其酸性木聚糖酶最适温度和最适pH值分别为65℃和6.5,酸性木糖苷酶最适温度和最适pH值分别为70℃和4.5;酸性木聚糖酶兼有酸性CMCase酶活力,达到8.54 U/mL。【结论】菌株XYW5所产的酸性木聚糖酶具有开发成为优良工业酸性木聚糖酶的潜力。
- 吴仁智黄俊黄俊芦志龙陈小玲陈英陆琦陈东王青艳
- 关键词:日本曲霉酶学性质纤维素乙醇
- 一种高产乙醇发酵菌株及其诱变育种方法
- 本发明公开了一种高产乙醇发酵菌株,保藏编号为CCTCC No:M 20211067,该菌株的诱变育种方法包括以下步骤:选取原始菌株置于甘油中保存,配制培养基备用;接种与培养基中培养至对数期;离心后采用无菌生理盐水洗涤并控...
- 吴仁智陈东关妮陈英陈小玲曹树威芦志龙陆琦翁磊浩黄俊蒙莉黄日波
- 木糖产乙醇微生物的育种研究进展被引量:1
- 2023年
- 甘蔗渣水解产物中含量第二高的是木糖,利用微生物高效转化木糖产乙醇是目前蔗渣纤维综合利用的关键途径之一,但野生型酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)不能利用木糖发酵产乙醇,这成为当前纤维素乙醇实现产业化生产的主要瓶颈之一。本文从微生物木糖代谢途径、利用木糖产乙醇的微生物、木糖产乙醇基因工程菌的构建、利用传统诱变方法改良木糖乙醇菌种等4个方面综述当前木糖产乙醇微生物的育种研究进展,指出木糖乙醇发酵最为理想的微生物菌种和最有应用前景的微生物分别是树干毕赤酵母(Pichia stipitis)和酿酒酵母基因工程菌,为改良木糖乙醇微生物提供理论依据。
- 吴仁智吴仁智覃丽垚黄俊黄俊关妮芦志龙陈小玲陈英陈东
- 关键词:木糖乙醇代谢途径树干毕赤酵母酿酒酵母
- Spt蛋白与酿酒酵母压力抗性研究进展
- 2018年
- Spt是一大类参与酿酒酵母转录调控的蛋白质。Spt蛋白是SAGA复合体的组成部分,该复合体与基因上游TATA框区域相互作用而发挥调控作用。根据目前的研究,约有10%的酿酒酵母基因转录受到Spt蛋白的调控,且与环境压力下上调基因的调控密切相关。Spt蛋白参与的庞大的调控网络及其复杂的调节机制是当前一个研究热点。Spt蛋白还具有转座子抑制的功能,是转座子功能调控和适应性进化意义上的重要"开关"。除此之外,一些Spt蛋白可以直接调控不饱和脂肪酸的合成,从而直接影响细胞膜重塑,对于酵母广泛抗性具有重要意义。文中从以上3个维度对迄今为止Spt蛋白的研究进展进行综述,结合前期研究工作,对于Spt蛋白通过转录调控、细胞膜转变、转座活性调节用以增强酿酒酵母抗性的潜在作用谨作展望。
- 芦志龙芦志龙陆琦陈英黄俊吴仁智黄俊陈小玲
- 关键词:SPT转座子
- 一株高产甘蔗糖蜜酒精的基因重组酿酒酵母
- 本发明涉及了一株高产甘蔗糖蜜酒精的基因重组酿酒酵母TGS11。该菌株‑70℃保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号为CCTCC NO:M2013562,保藏日期为2013年11月10日。本发明所提供的酿酒酵母菌菌株具有如...
- 陈英陈东陆琦陈小玲芦志龙黄俊吴仁智黄日波
- 文献传递
- 一种褐藻胶裂解酶AlgX1989及其应用
- 本发明提供了一种褐藻胶裂解酶AlgX1989及其应用,属于生物技术技术领域。所述褐藻胶裂解酶AlgX1989的氨基酸序列如SEQIDNo.1所示。采用本发明提供的褐藻胶裂解酶AlgX1989制备褐藻寡糖方法简单、高效、环...
- 卢波廖思明黄庶识林梅梁士颉黄巧珍林波黄俊彭立新
- 利用联合生物加工生产纤维素乙醇的研究进展被引量:5
- 2021年
- 联合生物加工(consolidated bioprocessing)是将纤维素酶的产生、纤维素酶解、糖发酵全部同时在一个反应器中完成,整个反应过程由一种微生物或微生物集合体来完成。联合生物加工具有工艺简便、成本低、效率高等优点,被广泛认为是最优的纤维素乙醇生产策略,又被称为第三代生物燃料。本文介绍构建符合联合生物加工要求菌株的2条途径,第1类联合生物加工菌株改造纤维素酶生产菌,使其能够高产乙醇;第2类联合生物加工菌株改造乙醇高产菌株,使其能够分泌纤维素酶。本文还对联合生物加工候选菌株及其优缺点做了概括,为今后研究提供了理论基础和指导方法。
- 黄俊梁士劼
- 关键词:纤维素微生物乙醇纤维素酶