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基于网络药理学方法研究枳实薤白桂枝汤治疗冠心病的作用机制被引量：15: 2019年; 目的通过网络药理学方法,对枳实薤白桂枝汤治疗冠心病的作用机制进行研究。方法收集枳实薤白桂枝汤中5味药的有效化合物,预测这些化合物对冠心病的作用靶点,对这些靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络图构建、基因本体(gene ontology,GO)富集分析和KEGG通路注释分析,将这些化合物与靶点进行分子对接。结果枳实薤白桂枝汤共收集到51个有效化合物,作用于31个冠心病相关靶点,PPI网络图显示ALB、ACE、REN、F2、NOS3、MAPK1、MMP9、MMP2、PPARG、SELE为10个联系最多的靶点,联系最密切的3组靶点为凝血组、斑块稳定组、其他保护组。GO富集分析显示出76个生物过程、26个分子功能、14个细胞成分,通路注释分析显示出19条通路,155组分子对接结果显示91组具有较好的结合活性。结论枳实薤白桂枝汤治疗冠心病具有多成分、多靶点的特点,可能通过抗凝血、稳斑块、抗氧化、抗炎症、降血脂、抑制RASS系统、增加NO保护、促进雌激素保护8个方面发挥治疗冠心病的作用。; 赵阳郑景辉徐文华赵新望伍燕宏罗蔚朱梓铭; 关键词：枳实薤白桂枝汤冠心病胸痹网络药理学分子对接

枳实薤白桂枝汤治疗冠心病的网络药理学研究及对TNF信号通路的验证: 目的:(1)通过文献计量学分析方法,探究枳实薤白桂枝汤的研究现状;(2)通过网络药理学方法,在分子的水平上,从化学成分、靶点、信号传导通路的角度对枳实薤白桂枝汤治疗冠心病的作用机制进行系统研究;(3)以TNF信号通路为例...; 赵阳; 关键词：枳实薤白桂枝汤冠心病网络药理学

基于文献计量学和系统药理学分析血府逐瘀汤治疗冠心病的分子机制被引量：12: 2020年; 目的基于计量文献学方法探究中医药治疗冠心病的主要方剂并利用生物信息学方法分析血府逐瘀汤治疗冠心病的具体作用机制。方法检索中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)并根据口服生物利用度(OB)、药物相似性(DL)筛选出到血府逐瘀汤的活性成分,挖掘CTD、Genecards数据库筛选与冠心病相关的作用靶点,利用Cyto-scape 3.6.1软件构建到血府逐瘀汤的蛋白互作网络图、化合物靶点图并通过计算拓扑学参数找到血府逐瘀汤中关键的作用靶点和化合物。利用David数据库对到血府逐瘀汤对冠心病的作用靶点进行GO分析和KEGG分析。并利用SystemsDock Web Site进行分子对接预测作用靶点和主要化合物的结合度。结果通过筛选得到血府逐瘀汤活性成分148种,潜在作用靶点138个;作用于冠心病的靶点38个;GO分析得到27个生物学过程、3个细胞组成和4个分子功能;KEGG分析得到22条信号通路。结论本研究初步验证和预测了血府逐瘀汤对治疗冠心病的作用机制,并为进一步深入揭示其作用机制提供参考。; 徐文华赵阳宁桂兰马晓聪赵新望王海娟张晓文郑景辉; 关键词：血府逐瘀汤冠心病生物信息学分子对接

基于网络药理学葛根素注射液对高血压的作用机制被引量：12: 2019年; 目的基于网络药理学探讨葛根素注射液对高血压的作用机制。方法利用CTD数据库筛选葛根素注射液中的作用靶点,构建葛根素注射液作用靶点的蛋白互作网络;基于Genecards数据库筛选高血压相关的靶点,并利用venn工具绘制葛根素注射液药物靶点与高血压疾病靶点的韦恩图,并通过生物信息学手段对葛根素注射液对高血压的作用靶点进行GO分析及KEGG分析。结果经CTD筛选99个靶点,包括与高血压相关30个作用靶点;经Bonferroni校正P值均<0.01,经Kappa算法分为活性氧代谢过程、外分泌细胞凋亡、骨髓白细胞分化、细胞对外界刺激的反应等27大类别;得出19条信号通路,经Bonferroni校正P值均<0.01。结论研究结果初步预测了葛根素注射液对高血压的基本药理基础及功效机制,与现代药理学研究以及临床用药规律有一定契合,葛根素注射液治疗高血压具有多基因参与的特点,可能与细胞分化凋亡以及活性氧代谢有关。; 徐文华赵新望赵阳董音汝郑景辉; 关键词：葛根素注射液高血压生物信息学

基于分子对接和系统药理学探讨人参汤治疗冠心病的作用机制被引量：8: 2019年; 目的探讨人参汤的功效物质基础和作用机制。方法利用TCMSP平台检索人参汤4味中药人参、甘草,干姜,白术的化学成分和作用靶点,并根据口服生物利用度以及药物相似性对潜在的生物活性成分进行筛选。本研究采用David v6.8数据库对交集靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果共得出126个活性成分,对应81个靶点,与冠心病相关靶点18个,通过GO分析得出85条生物过程(BP,biological process)、10条细胞组分(CC,cellular component)、14条分子功能(MF,molecular function),通过KEGG通路富集得出23条信号通路。结论本研究结果初步分析人参汤防治疾病的分子机制,为进一步深入探讨其作用机制提供先导信息和基础。; 徐香梅徐文华杨文娜陈旋赵阳赵新望郑景辉; 关键词：人参汤冠心病蛋白相互作用信号转导通路

基于网络药理学的小青龙汤治疗肺心病作用机制探讨被引量：15: 2019年; 目的:利用网络药理学探讨小青龙汤治疗肺心病的作用靶点,及并对其进行生物信息学分析。方法:利用TCMSP数据库筛选小青龙汤化合物,并上传PharmMapper数据库筛选出小青龙汤的作用靶点,利用GeneCards数据库筛选肺心病疾病作用相关靶点。将以上数据导入STRING数据库进行蛋白互作(Protein-protein interaction, PPI)网络分析。利用Cytoscape构建化合物靶点网络、PPI网络;利用David进行GO分析和KEGG分析。结果:共得出169个活性成分,对应167个靶点,包括与肺心病相关靶点11个,通过GO分析得出25个生物学过程(Biological Process,BP),4个细胞组成(Cellular Component,CC),11个分子功能(Molecular Function,MF),通过KEGG分析得出富集通路14条。结论:基于网络药理学分析得出小青龙汤有效化学成分,初步预测了小青龙汤作用于肺心病的靶点以及和P13K-Akt3、补体与凝血级联反应等信号通路,为下一步深入验证提供了良好的理论基础。; 徐文华杨文娜赵阳赵新望郑景辉; 关键词：小青龙汤肺心病网络药理学生物信息学

基于分子对接和系统药理学小青龙汤治疗哮喘的作用机制被引量：14: 2019年; 为从分子层面阐述小青龙汤治疗哮喘的作用机制,探索小青龙汤的潜在靶标,本研究检索中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)并根据口服生物利用度(oralbioavailability,OB)、药物相似性(drug-likeness,DL)筛选出小青龙汤的活性成分,利用Pharmmapper数据库筛选小青龙汤潜在作用靶点,挖掘CTD、Genecards数据库以筛选与哮喘相关的作用靶点,利用Cytoscape 3.6.1软件构建小青龙汤的蛋白互作网络图、化合物靶点图,并通过计算拓扑学参数找到小青龙汤中关键的作用靶点和化合物。对小青龙汤对哮喘的作用靶点进行GO分析和KEGG分析。利用iGEMDOCK软件进行分子对接,预测作用靶点和主要化合物的结合度。通过筛选得到小青龙汤活性成分、潜在作用靶点;GO分析得到43个生物学过程、11个细胞组成和9个分子功能;KEGG分析包括PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路、Wnt信号通路等。初步验证和预测了小青龙汤对治疗哮喘的作用机制,并为进一步深入揭示其作用机制提供参考。; 徐文华郑景辉杨文娜董音汝赵阳赵新望; 关键词：小青龙汤哮喘网络药理学生物信息学分子对接

基于网络药理学和生物信息学的丹参酮Ⅱ_A治疗冠心病的分子生物学机制分析被引量：42: 2019年; 目的基于网络药理学和生物信息学方法分析丹参酮Ⅱ_A治疗冠心病(CHD)的分子生物学机制。方法利用Pharm Mapper数据库筛选出丹参酮Ⅱ_A的作用靶点,利用OMIM、GeneCards、CTD数据库筛选CHD疾病作用相关靶点。利用STRING数据库进行蛋白互作网络分析,利用Cytoscape构建蛋白相互作用网络,利用ClueGO插件进行GO分析和KEGG信号通路富集分析,利用Systemsdock数据库进行系统分子对接,利用i GEMDOCK软件进行分子对接来预测丹参酮Ⅱ_A对CHD作用靶点的结合性。结果筛选出丹参酮Ⅱ_A的潜在靶点173个;与CHD相关的靶点42个;信号通路49条。结论丹参酮Ⅱ_A治疗CHD具有多靶点、多通路作用的特点;其可能作用机制是通过调控CHD发展过程中的血压调节、细胞代谢、血管新生、内分泌、活性氧代谢等过程对CHD进行干预。; 徐文华郑景辉赵阳赵新望董音汝李丽; 关键词：冠心病网络药理学生物信息学分子对接

基于网络药理学研究川芎治疗冠心病的作用机制被引量：42: 2019年; 目的基于网络药理学研究川芎治疗冠心病的作用机制。方法以化合物口服药物生物利用度(OB)和类药性(DL)为标准,根据中药系统药理学技术平台(TCMSP)等数据库预测和筛选川芎化合物及治疗冠心病的作用靶点。然后,Cytoscape 3.5.1软件构建川芎化合物-靶点网络,String平台构建靶点蛋白相互作用网络,生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点基因进行GO富集分析及KEGG通路分析。结果从川芎中筛选得到7个化合物,作用于31个冠心病靶点,关键靶点包括血管性血友病因子、凝血因子2、跨膜受体蛋白1、心肌细胞增强因子2 A、超氧化物歧化酶1、氧化氮合酶2等,参与对缺氧的反应、对过氧化氢的反应、血压调节、心脏发育、凝血功能等生物过程,调节补体级联与凝血级联、缺氧诱导因子-1信号通路、过氧化物酶体等代谢通路。结论川芎可能主要通过抗氧化、抗炎、抗凝血、促进血管生成、扩张血管、调节血压等方面来治疗冠心病。; 赵新望徐文华赵阳伍燕宏罗蔚朱梓铭郑景辉; 关键词：川芎冠心病网络药理学

中医药干预干细胞治疗缺血性心脏病的中英文数据库文献计量学分析被引量：1: 2018年; 目的:通过文献检索、共现分析和聚类分析等文献计量学分析,探讨中医药干预干细胞治疗缺血性心脏病的研究现状与热点,方便为该领域今后的相关研究提供参考。方法:检索中国知网和PubMed数据库中收录的中医药干预干细胞治疗缺血性心脏病相关的文献,运用书目共现分析系统软件(BICOMB)、CytoScape3.6.1及SPSS软件对高频词进行共现分析和聚类分析。结果:从中国知网检索到文献116篇,频次≥3的高频词共43个,共有226对共现关系,聚类共分别出7个类别;从PubMed检索到文献44篇,频次≥3的高频词共35个,共有355对共现关系,聚类共分别出8个类别。结论:中医药干预干细胞治疗缺血性心脏病的研究在2005年之后在世界多个国家开始兴起,中药、益气温阳活血方、三七总皂苷、地黄低聚糖、丹参注射液、丹参6个方面是在中医药范围内的研究热点。; 赵阳赵新望徐文华伍燕宏罗蔚朱梓铭郑景辉; 关键词：中医药干细胞缺血性心脏病文献计量学

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赵阳

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