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北京市某区1例人感染H7N9禽流感病毒的HA和NA基因特征分析被引量：1: 2020年; 目的了解北京市某区1例人感染H7N9禽流感病毒基因特征,为禽流感病例的早期发现、疫情控制提供参考。方法提取病例临床样本病毒核酸,反转录扩增后进行病毒血凝素基因(hemagglutinin, HA)、神经氨酸酶基因(neuraminidase, NA)序列测定。获得的病毒序列与全球流感共享数据库中H7N9禽流感病毒株进行序列分析,比较该病毒与北京市既往发现株和其他省市毒株同源性,构建系统发育树,并对部分耐药位点和糖基化位点进行分析。结果北京市某区1例H7N9禽流感病毒为低致病性禽流感。HA、NA与北京既往发现的29株毒株氨基酸同源性为97.2%~100%和96.8%~100%,基于系统进化分析与之最为相近的疫苗株为A/Hunan/02650/2016。HA蛋白受体结合位点发生了G186V、Q226L突变,HA和NA的糖基化位点均未发生变化。结论该区出现的H7N9病毒与北京地区既往发现H7N9毒株具有高度同源性,部分氨基酸位点存在变异,但未发生耐药突变。; 吴杨牛桓彩庄鹏李东迅刘重程李飒舒高林潘阳; 关键词：禽流感

2020-2021年北京市昌平区诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情流行病学特征被引量：6: 2023年; 目的分析2020-2021年北京市昌平区诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情流行特征,为科学制定诺如病毒急性胃肠炎疫情防控措施提供依据。方法收集2020-2021年北京市昌平区诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情流调和临床资料,用实时荧光PCR方法检测诺如病毒;采用描述性的流行病学方法,分析疫情三间分布等流行病学特征。结果2020-2021年北京市昌平区共报告51起诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情,疫情样本中诺如病毒检出率为20.08%(303/1 509);诺如病毒疫情冬季高发,发生在冬季的疫情占52.94%(27/51),其中12月占50.98%(26/51);城乡结合部的2个镇发生疫情起数最多,占47.06%(24/51),不同地区罹患率差异有统计学意义(χ^(2)=653.553,P<0.05);托幼机构发生疫情起数最多,占58.82%(30/51),不同人群罹患率差异有统计学意义(χ^(2)=797.526,P<0.05);病例最常见的症状是呕吐,占78.61%(305/388),呕吐、腹泻和发热症状在不同人群间差异有统计学意义(P均<0.05)。结论城乡结合部和托幼机构更易发生诺如病毒疫情;一年四季均有诺如病毒疫情发生,冬季高发,12月为流行高峰;病例以呕吐为主要临床表现。; 彭华李飒银安琪李东迅王维钧舒高林严寒秋; 关键词：诺如病毒急性胃肠炎疫情防控

2012-2019年北京市昌平区散发腹泻病例四种病毒监测结果分析被引量：10: 2021年; 目的对北京市昌平区2012-2019年散发腹泻病例4种病毒监测结果进行分析,了解其流行特征。方法采集此期间辖区2家哨点医院肠道门诊散发腹泻病例便样本960份,提取核酸后用实时荧光RT-PCR方法检测A组轮状病毒、GⅠ/GⅡ组诺如病毒、星状病毒和肠道腺病毒,用描述性流行病学方法从时间、性别和年龄分布分析其流行特征。结果960份便样本的病毒总检出率为32.29%(310/960),GⅠ/GⅡ组诺如病毒、A组轮状病毒、星状病毒和肠道腺病毒检出率分别为18.96%(182/960)、10.63%(102/960)、1.98%(19/960)和0.73%(7/960);在不同年份、性别和年龄组中,均为GⅠ/GⅡ组诺如病毒检出率最高,A组轮状病毒次之;GⅠ/GⅡ组诺如病毒春季检出率最高(28.33%,68/240),冬季次之(22.50%,54/240);A组轮状病毒冬季检出率最高(25.42%,61/240),春季次之(9.58%,23/240)。结论GⅠ/GⅡ组诺如病毒和A组轮状病毒是北京市昌平区冬春季散发腹泻病例的主要病原。; 彭华李东迅李楠王维钧舒高林田祎闻艳红徐代庆银安琪严寒秋; 关键词：病毒性腹泻诺如病毒星状病毒肠道腺病毒

北京市昌平区食源性单增李斯特菌特征分析被引量：6: 2018年; 目的了解北京市昌平区食源性单增李斯特菌(Lm)的毒力基因携带情况、抗生素敏感性及分子特征。方法对2010-2016年12类食品中分离的22株Lm进行血清型、毒力基因、抗生素敏感性、多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析。结果 22株Lm分为5种血清型(以1/2c、3a血清型为主);19种毒力基因携带谱(T1~T19),毒力基因阳性数为6~12个;对氨苄西林、青霉素、美罗培南、复方新诺明、万古霉素和环丙沙星敏感,出现对四环素、红霉素耐药菌株;分为8个序列型(ST)(包括7个新型STA1~STA7),STA3为主要型别;分为17种PFGE带型,其相似系数为63.5%~100.0%,PTⅠ为主要PFGE带型。结论昌平区食源性Lm以1/2c、3a血清型为主,STA3为主要型别,PTⅠ为主要PFGE带型,其毒力基因的携带具有差异性,出现对四环素、红霉素耐药株,为食源性Lm的研究提供了参考。; 牛桓彩吴杨舒高林刘毅马文军李东迅; 关键词：单增李斯特菌血清型毒力基因多位点序列分型脉冲场凝胶电泳

北京市一些地区生肉标本中单增李斯特菌的分离及其分子流行病学特征分析被引量：25: 2015年; 目的了解北京市一些地区生肉中单增李斯特菌的污染情况及其分子流行病学特征。方法采用北欧食品分析标准(NMKL)对北京市一些地区采集的340份牛、羊、猪、鸡和鸭生肉标本进行单增李斯特菌的分离鉴定,并对分离菌株进行血清学分型(Serotyping)、脉冲场凝胶电泳(Pulsed Field Gel Electrophoresis,PFGE)分型及多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing,MLST)分析。结果生肉标本中单增李斯特菌污染率为6.2%(21/340)。分离菌株含3种血清型(1/2a,1/2b和1/2c),以1/2c为优势血清型(占47.6%)。PFGE分析中,使用内切酶AscI酶切电泳将21株单增李斯特菌分为12个型别,可聚类为3个群。MLST分析将21株单增李斯特菌分为7个ST型,其中ST9型最多(10株)。结论北京市一些地区的生肉类食品中存在6.2%的单增李斯特菌污染率,这些单增李斯特菌以家系II菌株占据绝对优势(80.1%),其中1/2c型,GX6A16.CN0004和ST9型分别为血清型、PFGE带型以及MLST序列型的优势型别,与我国食源性单增李斯特菌的优势菌群特征一致。; 马爱静王艳王毅李东迅许华青袁雪娇刘凯叶长芸; 关键词：单增李斯特菌脉冲场凝胶电泳分型多位点序列分型

两起GII.2型诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情的病原学分析被引量：1: 2017年; 目的调查2016年10月昌平区某两所幼儿园两起急性胃肠炎暴发疫情的病原体,为疫情防控提供依据.方法采集两所幼儿园各一起急性胃肠炎暴发疫情的病例和密切接触者粪便标本,采用实时荧光RT-PCR检测方法检测病毒核酸,抽取部分阳性标本采用一步法RT-PCR扩增诺如病毒衣壳蛋白区部分基因,将PCR产物双向测序,采用Bio Edit和MEGA 6.06软件进行序列比对和进化分析.结果 70份粪便标本中37份为诺如病毒GII组核酸阳性,检出率为52.86％;未检出GI组.13份阳性标本的测序结果经序列比对均为诺如病毒GII.2基因型.两所幼儿园疫情代表毒株同源性为99.6％,与2016年北京和江苏毒株（GenBank序列号KY421122和KY421121）同源性最高.进化分析显示,两所幼儿园疫情代表毒株与诺如病毒GII.2基因型位于一个大的进化簇上,同中国的3株GII.2基因型毒株（GenBank序列号KY457736、KY421122、KY421121）亲缘关系最近.结论北京昌平区两所幼儿园出现的病毒性腹泻疫情的毒株为GII.2型,应加强日常监测与防控.; 闫革彬彭华舒高林李东迅王维钧徐代庆严寒秋; 关键词：诺如病毒进化树

北京市昌平区腹泻患者弯曲菌感染现状及其分子特征分析被引量：5: 2022年; 目的了解北京市昌平区腹泻患者弯曲菌感染现状及其分子流行特征,为该地区弯曲菌腹泻病的预防控制提供科学依据。方法收集2019年北京市昌平区某哨点医院腹泻患者粪便样本382份,进行弯曲菌、沙门菌、致泻大肠埃希菌、副溶血性弧菌检测,并对分离到的空肠弯曲菌进行脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)分析。结果382份样本中,弯曲菌(58株,15.18%)检出率高于致泻大肠埃希菌(37株,9.69%)、沙门菌(24株,6.28%)和副溶血性弧菌(21株,5.50%),差异有统计学意义(χ^(2)=26.735,P=0.000)。季节分析显示:弯曲菌春季(14.71%)、夏季(18.33%)、秋季(15.00%)、冬季(10.00%)四季均有检出,但其差异无统计学意义(χ^(2)=2.197,P=0.533)。PFGE分析显示:30株空肠弯曲菌具有26种PFGE带型,相似系数为31.00%~100.00%,其PFGE带型具有多样性。结论弯曲菌检出率居于首位,四季检出,提示昌平区弯曲菌感染较严重,应引起重视,并制定相应的方针政策,防止由弯曲菌感染引起的疫情发生。; 李东迅王维钧彭华银安琪舒高林牛桓彩; 关键词：腹泻患者弯曲菌空肠弯曲菌脉冲场凝胶电泳

单增李斯特菌1/2c血清型菌株生物膜相关基因分析及耐药性研究被引量：1: 2016年; 目的了解单增李斯特菌1/2c血清型菌株与其他血清型菌株的生物膜相关基因和抗生素耐药性是否有差异。方法采用聚合酶链反应技术对19个生物膜相关基因全长扩增测序分析,并与参考菌株EGD-e序列进行比对确定基因变异情况;根据K-B纸片法对选取的实验菌株进行药敏实验。结果氨基酸序列比对发现1/2c血清型菌株的fla A基因编码的氨基酸在141位点发生突变,其他血清型菌株则没有,1/2c血清型菌株在prf A基因编码的89氨基酸位点、lux S基因编码的112和140氨基酸位点都不发生突变,其他血清型菌株则发生突变。78.43%的1/2c血清型菌株对头孢西丁中度敏感,对氨苄西林、米诺环素、利福平和呋喃妥因有不同程度的耐药。结论不同血清型单增李斯特菌的fla A、lux S、prf A 3个基因编码的氨基酸在某些位点突变有一定的规律性;1/2c血清型单增李斯特菌对某些抗生素呈现不同程度的耐药。; 李东迅王艳马爱静王毅刘凯刘东鑫王和叶长芸; 关键词：单增李斯特菌血清型点突变耐药性

北京市昌平区临床分离沙门菌株分子分型与耐药分析被引量：11: 2019年; 目的了解北京市昌平区沙门菌临床菌株血清型、分子特征及耐药性。方法对2017年昌平区分离的沙门菌进行血清分型、脉冲场凝胶电泳分型分析及药敏实验。结果42株沙门菌主要血清型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。PFGE分析得到31种PFGE带型,菌株相似系数为56.9%~100.0%。沙门菌对萘啶酸、链霉素、氨苄西林和磺胺异恶唑的耐药率较高,分别为57.14%、42.86%、40.48%和40.48%;19株(45.24%)沙门菌同时耐受3种及以上抗生素。结论北京市昌平区引起腹泻的沙门菌主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌,对萘啶酸、磺胺异恶唑、链霉素和氨苄西林等抗生素耐药率高,多重耐药严重,且PFGE带型呈高度多态性。; 李东迅舒高林王维钧吴杨; 关键词：腹泻沙门菌血清型分子分型脉冲场凝胶电泳

2012-2016年北京市昌平区感染性腹泻病原菌检测结果分析被引量：35: 2017年; 目的分析北京市昌平区2012-2016年感染性腹泻病原菌构成、流行特征及主要致病菌血清型分布,为本地区感染性腹泻防控提供参考依据。方法收集2012-2016年北京市昌平区2家哨点医院肠道门诊腹泻患者的粪便标本进行志贺菌、沙门菌、致泻性大肠埃希菌、副溶血性弧菌等肠道致病菌的检验。结果 1 948份标本中,395份标本检出病原菌,总阳性率为20.28%。副溶血性弧菌、沙门菌、致泻性大肠埃希菌、志贺菌的阳性检出率分别为6.31%、6.26%、5.65%、3.39%。8月份检出率最高。30~39岁年龄组病原菌检出率最高为26.03%(101/388)(x^2=23.294,P=0.001)。副溶血性弧菌以O3:K6血清型为主,致泻性大肠埃希菌以EPEC为主,志贺菌以宋内志贺菌为主,沙门菌以肠炎沙门菌血清型为主。结论北京市昌平区细菌性腹泻病原菌主要以副溶血性弧菌为主,其次为沙门菌、致泻性大肠埃希菌、志贺菌,但不同年份细菌谱存在差异。; 闻艳红彭华徐代庆李楠高进玺李东迅; 关键词：感染性腹泻副溶血性弧菌沙门菌致泻性大肠埃希菌志贺菌

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