孙昭宁
- 作品数：6 被引量：76H指数：5
- 供职机构：中国水产科学研究院黄海水产研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技支撑计划山东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 微卫星DNA标记用于中国对虾亲子关系的鉴定被引量：19
- 2007年
- 在水产养殖中应用微卫星标记来确定亲缘关系已经得到认同和广泛使用。本研究通过控制交尾,利用微卫星标记确定中国对虾后代的亲缘关系,对微卫星标记应用于中国对虾的家系识别进行初步探讨。作者以4个谱系清晰的家系为基础,检测两对微卫星标记EN0033和RS062在中国对虾家系鉴别中的应用。结果表明,利用两对微卫星引物产生的DNA指纹图谱,能够有效地区分中国对虾4个家系。根据微卫星数据计算各家系之间的遗传距离,构建UPGMA图,得到的结果与各家系来源情况一致,进一步证明了微卫星技术在进行家系间的遗传分析中的可行性。EN0033和RS062两对微卫星标记的累积个体识别率高达0.989,属于高识别力的遗传标记系统,可以利用它们进行中国对虾的亲缘关系鉴定。
- 孙昭宁刘萍李健何玉英张秀梅
- 关键词：微卫星标记亲缘关系
- 微卫星DNA技术用于中国对虾家系构建中的系谱认证被引量：17
- 2005年
- 用6个微卫星标记对中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)的5个家系进行系谱鉴别和遗传多样性研究.6个微卫星位点中有5个位点是多态的,并在所有家系中都显示了高度的遗传差异.5个家系中,5个多态微卫星位点共发现了30个等位基因,每个位点的等位基因数在5～8之间.实验中共发现了4个家系特异性等位基因:2#家系及4#家系各1个,5#家系2个.根据已知亲本及子代基因型,可推断出5个家系中全部亲本的基因型,据此鉴别各家系.在EN0033位点,可将5#家系与其他4个家系相区别;在RS0859位点,可将3#和4#家系与其他3个家系相区分.因此,EN0033和RS0859标记可用于鉴别5#、3#和4#家系的家系特异性标记.研究表明,用5个微卫星标记,且最少用2对微卫星标记即可鉴别5个中国对虾家系.
- 孙昭宁刘萍李健何玉英张秀梅
- 关键词：中国对虾微卫星标记
- 中国对虾遗传连锁图谱的构建被引量：23
- 2008年
- 利用RAPD、SSR和AFLP三种标记技术结合"拟测交"策略,以中国对虾"黄海1号"雌虾与野生雄虾作为亲本进行单对杂交产生的F1家系为作图群体,初步构建了中国对虾雌、雄性遗传连锁图谱。对460个RAPD引物和44对SSR引物进行筛选,共选出61个RAPD和20对SSR引物,结合88对AFLP引物组合对父母本和82个F1个体进行了遗传分析。共得到783个分离标记(RAPD标记237个,微卫星标记45个,AFLP标记501个),761个标记用于连锁分析。雌性图谱包括40个连锁群和15个三联体,20个连锁对,标记间平均间隔为12.5cM,图谱共覆盖2835.5cM,覆盖率为73.5%;雄性图谱包括41个连锁群和6个三联体,12个连锁对,标记间平均间隔为11.9cM,图谱共覆盖2776.7cM,覆盖率为73.3%。中国对虾遗传图谱的构建为其分子标记辅助育种、比较基因组作图及数量性状位点(QTL)的定位与克隆奠定了基础。
- 李健刘萍王清印李朝霞孙昭宁何玉英
- 关键词：中国对虾遗传连锁图谱RAPDSSRAFLP
- RAPD和SSR两种标记构建的中国对虾遗传连锁图谱被引量：17
- 2006年
- 利用RAPD和SSR分子标记结合拟测交策略,对中国对虾(Fenneropenaeuschinensis)“黄海1号”雌虾与野生雄虾作为亲本进行单对杂交产生的F1代,采用RAPD和SSR两种分子标记技术初步构建了中国对虾雌、雄遗传连锁图谱。对460个RAPD引物和44对SSR引物进行筛选,共选出61个RAPD引物和20对SSR引物,用于对父母本和82个F1个体进行遗传分析。共得到母本分离标记146个(RAPD标记128个,微卫星标记18个)和父本分离标记127个(RAPD标记109个,微卫星标记18个)。雌性图谱包括8个连锁群、9个三联体和14个连锁对,标记间平均间隔为11·28cM,图谱共覆盖1173cM,覆盖率为59·36%;雄性图谱包括10个连锁群、12个三联体和7个连锁对,标记间平均间隔为12·05cM,图谱共覆盖1144·6cM,覆盖率为62·01%。中国对虾遗传图谱的构建为其分子标记辅助育种、比较基因组作图及数量性状位点的定位与克隆奠定了基础。
- 孙昭宁刘萍李健孟宪红孔杰张秀梅
- 关键词：中国对虾RAPDSSR遗传连锁图谱
- 中国对虾生长性状相关遗传标记的筛选与克隆被引量：11
- 2007年
- 采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,对中国对虾“黄海1号”快速生长的第6代群体同一养殖池中生长性状发生分离的两个极端群体、海捕的中国对虾对照群体,进行生长相关遗传标记的筛选。采用240个RAPD引物,共产生标记数2156个。筛选出与生长性状相关的遗传标记65个,其中正相关标记55个,负相关标记10个。依据这些标记在群体中出现的频率和变化规律,筛选出9个特异性标记,其中正相关标记7个,负相关标记两个。对这些特异性标记进行序列测定,获得了6个完整的DNA序列(Genebank注册号DQ185932-DQ185937),并将测序结果进行BLAST分析,发现测得DNA的序列与数据库中已注册序列的相似性较低,未能找到同源性较高的功能基因。根据每一序列重新设计引物,已有两个RAPD标记成功转化为稳定的SCAR标记。
- 刘萍何玉英孙昭宁李健王清印
- 关键词：中国对虾RAPD标记生长性状克隆
- 中国对虾的系谱认证研究及遗传连锁图谱的构建
- 本论文的主要内容是用微卫星技术进行中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)的家系识别研究以及用RAPD与SSR两种分子生物学技术构建中国对虾的遗传连锁图谱。一方面对微卫星DNA技术在中国对虾亲缘关系鉴...
- 孙昭宁
- 关键词：中国对虾SSRRAPD遗传连锁图谱
- 文献传递
