蔡津津
- 作品数：6 被引量：4H指数：1
- 供职机构：中国科学院计算技术研究所更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家科技重大专项国家科技攻关计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学医药卫生更多>>
- 蛋白质磷酸化位点预测与规则抽取方法研究
- 磷酸化是最重要的蛋白质翻译后修饰之一，蛋白质磷酸化和去磷酸化为真核细胞提供了调节机制。随着高通量鉴定磷酸化蛋白质技术的发展，尤其是质谱技术在蛋白质组学中的应用，磷酸化修饰数据不断积累，从现有数据中挖掘规律从而对未知蛋白质...
- 蔡津津
- 关键词：磷酸化位点预测规则抽取蛋白质组学生物学实验
- 文献传递
- 蛋白质组质谱信息处理的关键算法研究
- 应用质谱数据进行蛋白质的定性鉴定与定量分析是蛋白质组生物信息学研究中的一个关键问题。由于质谱仪器类型的多样化,实验过程样本中混入杂质的干扰,不同实验室质谱实验参数的不同选取,实验人员的操作水平,以及人们目前对于离子碎裂机...
- 孙瑞祥付岩张京芬李德泉王海鹏蔡津津王晓彪曾嵘贺思敏高文
- 关键词：蛋白质组学质谱生物信息学蛋白质鉴定
- 文献传递
- AproPhos:基于AdaBoost方法的蛋白质磷酸化修饰预测系统被引量：3
- 2007年
- 磷酸化是最重要的蛋白质翻译后修饰之一,随着蛋白质磷酸化修饰数据不断积累,利用已有数据进行蛋白质磷酸化修饰位点预测的条件日益成熟。利用修饰位点附近氨基酸性质取代氨基酸种类作为特征,对现有516种氨基酸性质做了详细分析和筛选,提出了采用AdaBoost方法进行特征选择和分类器训练的磷酸化修饰位点预测系统AproPhos,该系统在特异性高于已有预测系统(约2%)的基础上,大大提高了预测的灵敏度(约10%),使磷酸化位点预测方法用于提高磷酸化蛋白质质谱鉴定效率成为可能,并有发现磷酸化修饰位点氨基酸性质分布的潜力。
- 蔡津津赵杰煜王乐珩
- 关键词：磷酸化ADABOOST
- 基于AdaBoost方法的蛋白质磷酸化修饰规则抽取被引量：1
- 2007年
- 磷酸化是最重要的蛋白质翻译后修饰之一,随着蛋白质磷酸化数据的增加,利用已有数据对蛋白质磷酸化修饰进行规律挖掘和预测的条件日益成熟。设计新的基于AdaBoost(adaptivc boost)分类器的规则抽取算法和利用修饰位点附近氨基酸性质作为特征并采用AdaBoost方法进行特征选择和分类器训练的磷酸化修饰位点预测方法AproPhos(using amino acid pro- perties for phosphorylation sites prediction),使其在具有较高预测精度的同时可以对预测结果进行可理解的规则解释,规则抽取还有助于发现新的磷酸化修饰氨基酸性质分布规律,对揭示生命活动规律和药物开发有着重要意义。
- 蔡津津赵杰煜贺思敏
- 关键词：磷酸化规则抽取ADABOOST算法蛋白质
- 用串联质谱中碎片离子的同位素峰预测离子分子式的方法
- 本发明公开了一种用串联质谱中碎片离子的同位素峰预测离子分子式的方法，该方法从串联质谱和从各元素的原子个数待定的通用分子式中分别获取碎片离子的单同位素的质量以及各同位素谱峰相对于单同位素的相对丰度；将分别获取的质量和相对丰...
- 高文张京芬蔡津津贺思敏曾嵘陈润生王海鹏
- 文献传递
- 用串联质谱中碎片离子的同位素峰预测离子分子式的方法
- 本发明公开了一种用串联质谱中碎片离子的同位素峰预测离子分子式的方法，该方法从串联质谱和从各元素的原子个数待定的通用分子式中分别获取碎片离子的单同位素的质量以及各同位素谱峰相对于单同位素的相对丰度；将分别获取的质量和相对丰...
- 高文张京芬蔡津津贺思敏曾嵘陈润生王海鹏
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