陈国忠
- 作品数：7 被引量：46H指数：3
- 供职机构：教育部更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金云南省自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 16S rRNA二级结构的研究进展及其在系统分类中的应用被引量：11
- 2005年
- 16S rRNA作为研究系统进化的生物大分子极受重视,是系统分类中必不可少的一个指标。然而,在进行系统发育分析时通常的序列联配方法有明显的局限性,即无法摆脱一级结构的束缚。20世纪80年代以来,一些研究者把目光投向了16S rRNA二级结构的分析研究,并且已经取得了相当不错的进展。研究表明,16S rRNA二级结构可能作为一个新的分类指标,成为系统分类的一个重要补充。
- 陈国忠李文均徐丽华姜成林
- 关键词：RRNA
- 16S rRNA基因序列的系统发育分析及其二级结构的初步研究
- 近年来，用于系统分类研究的最有力的工具就是基于16SrRNA基因序列的系统发育分析及其二级结构研究，据此，本论文主要包括这两方面的内容。
论文一方面对生物信息学进行了简要的介绍，列举了一些常用的网络生物信息资源，重...
- 陈国忠
- 关键词：系统发育分析进化树
- 文献传递
- 16SrRNA二级结构可变区图形分析在放线菌分类中的应用被引量：8
- 2006年
- 采用16SrRNA可变区二级结构图形分析,比较了姜氏菌属及几个相关属种可变区二级结构的变化。结果表明,在9个可变区二级结构中茎的长度、环的数目和类型、茎的碱基对、以及环内部碱基均有不同。尤其在V5和V6两个区,这种差别尤为明显。这为姜氏菌属的建立提供了又一个证据,并认为16SrRNA可变区二级结构分析,可以应用于属以上原核生物的分类。
- 陈国忠姜怡唐蜀昆李文均徐丽华
- 关键词：RRNA放线菌分类
- PCR法快速识别Actinobacteria的五种模板制备方法的比较被引量：26
- 2004年
- 放线细菌的 2 3SrRNA基因序列具有较好的保守性和相对的可变性 ,被认为是快速筛选放线细菌的合适部位。能否快速有效地扩增特异性区间 ,聚合酶链反应 (PCR)扩增前的模板制备质量是关键 ,故比较了基因组DNA作为PCR模板的 5种制备方法。旨在寻找准确、快速、简便、经济的放线细菌筛选技术 ,为普通和极端环境放线细菌资源的研究和开发利用创造条件。
- 张玉琴李文均陈国忠杨颖田新朋
- 关键词：基因组DNA提取
- 1株革兰氏阴性细菌菌株YIM31327^T的分离和鉴定
- 2004年
- 从云南森林土壤样品中分离到1株革兰氏阴性细菌YIM31327T.通过对其进行的包括形态、生理生化特性、细胞壁化学组份以及16SrDNA序列等多相分类研究,确定其为杜擀氏菌属的1个新种,我们将其命名为黑紫杜擀氏菌(Duganellaviolaceinigrasp.nov.).菌株YIM31327T的最适生长温度为28～30℃,最适生长pH为7.0,细胞短杆状、无孢子形成、有鞭毛、可运动.
- 张玉琴李文均陈国忠徐丽华姜成林
- 关键词：革兰氏阴性细菌RDNA
- 高温单孢菌属分类研究进展被引量：1
- 2005年
- 自从Henssen于1957年建立高温单孢菌属至今,高温单孢菌属各菌种的分类地位一直处于不断的变化之中。近年来,随着该属一些种的重新分类以及新种的发现,高温单孢菌属的分类发生了很大的变化。这主要是由于分类手段已由传统的形态学分类方法向现代的多相分类方法过渡。介绍了自高温单孢菌属建立以来,该属分类的研究现状,认为高温单孢菌属在系统分类上尚需进一步的研究。
- 陈国忠张玉琴李文均
- 关键词：系统学
- 滇南森林土样中的Actinobacteria的分离、快速鉴别及初步鉴定
- 2004年
- Actinobacteria是一类极具开发潜力的微生物资源.Actinobacteria的23SrRNA既有高度的保守性,又有较好的可变性,体外PCR扩增Actinobacteria的23SrDNA的稳定插入片段可有效地对放线细菌进行识别.本研究中结合了16SrDNA部分序列分析对其中9株Actinobacteria菌株进行了初步鉴定,随后又对菌株YIM70056进行了多相分类学研究,最终确定该菌株是红球菌属的一个新种,我们将其命名为云南红球菌.
- 张玉琴李文均陈国忠徐丽华姜成林
- 关键词：PCR微生物资源
