刘桂霞
- 作品数：27 被引量：60H指数：4
- 供职机构：华东理工大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金教育部“新世纪优秀人才支持计划”更多>>
- 相关领域：医药卫生文化科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 一种基于网络推理的药物通路预测方法
- 本发明提供了一种基于网络推理的药物通路预测方法及预测模型，采用以下步骤构建得到：首先通过使用大规模药物基因组学数据，构建已知的药物‑通路网络；通过计算化学子结构的信息，构建子结构‑药物网络；整合子结构‑药物网络和药物‑通...
- 唐贇吴曾睿王吉烨刘桂霞李卫华
- 细胞色素P450配体通道的研究进展被引量：2
- 2011年
- 细胞色素P450(CYP)是一类含亚铁血红素的酶,不但能催化内源性底物的生物合成和代谢,而且对外源性化合物的代谢、激活以及降解毒性等起着重要作用.P450也是人体内最主要的药物代谢酶,能催化代谢约75%的临床药物.已有的P450酶晶体结构显示,绝大多数酶呈现闭合的构象,其催化活性位点位于血红素上方且深埋于蛋白质的中心,没有明显的通道用于配体进出活性中心.因此一个有趣而重要的问题是,配体如何进出酶的活性中心达到被氧化或发生抑制作用?近年来,关于P450酶配体通道的研究取得了显著进展.本文重点综述了通道研究的实验方法及6类P450酶可能存在的通道和作用机制,并对其未来的发展方向进行了展望.
- 沈中华李卫华许柚刘桂霞唐赟
- 关键词：细胞色素P450分子动力学定点突变
- 整合药理学和毒理学谱预测内分泌干扰物的模型及其构建方法和应用
- 本发明提供了整合药理学和毒理学谱预测内分泌干扰物的模型及其构建方法和应用。具体地，本发明基于药理学和毒理学数据，结合化合物子结构的分子指纹，构建了一种内分泌干扰物预测模型。本发明的内分泌干扰物预测模型，可更准确高效地评估...
- 唐贇吴曾睿俞卓杭刘桂霞李卫华
- 一种二肽基肽酶Ⅳ新抑制剂
- 本发明涉及一种二肽基肽酶IV新抑制剂，所述二肽基肽酶IV新抑制剂是N′-[(2-羟基-1-萘基)亚甲基]-4，5，6，7-四氢化-1H-吲唑-3-酰肼(N′-[(2-hydroxy-1-naphthyl)methylen...
- 刘桂霞唐赟黄瑾李璀卢伟强卢春华
- 文献传递
- 免费软件在药物设计实验中的应用被引量：7
- 2014年
- 计算机辅助药物设计是一门新兴的交叉学科,不仅理论性强,而且注重实践动手能力。为巩固理论课的教学成果,增强学生的实践操作能力和学习兴趣,我们为药学专业本科生开设了"药物设计实验"课程。制药企业和学术界的药物设计平台通常采用商业软件包。虽然商业软件功能丰富,但也存在费用昂贵、对硬件要求高等问题,不适用于大规模的实验教学。过去几年我们尝试将一些能免费获取的软件应用于"药物设计实验"课程的教学,取得了较好的效果。论文根据该课程实验的设置内容,介绍了这些免费软件在药物设计实验中的应用,具有较好的推广价值。
- 李卫华刘桂霞程家高唐赟
- 关键词：计算机辅助药物设计免费软件实验教学
- 计算机辅助药物设计——大学生创新项目实践与体会
- 2019年
- 大学是学生全面发展的时期,只学习课本知识已经不能满足社会发展的需要。为了拓展自己的专业知识,提高专业水平,学生要积极投身各项创新实验中,找到自己感兴趣的方向,坚持不懈地在实践中提升自己。在互联网和大数据迅速发展的时代,计算机辅助药物设计技术(CADD)顺应潮流,高速发展。学生在兴趣的驱动下,投身新型学科的学习中,既是机遇,又是挑战。
- 刘丽萍李婷廖承云田成壮刘桂霞李卫华唐赟
- 关键词：计算机辅助药物设计
- A Five Featured Pharmacophore Model for the Sodium-Dependent Glucose Co-Transporter 2(SGLT2)Inhibitors
- As we all know,type 2 diabetes is dangerous to our mankind.To year 2010,there are about 92 million diabetic pa...
- 徐聪颖李卫华刘桂霞唐赟
- 关键词：MODEL
- 文献传递
- 有机化合物生物富集因子的计算机预测研究被引量：2
- 2015年
- 有机化合物在生物体内的富集,通常用生物富集因子(bioconcentration factor,简称BCF)来表达,这是化合物生态环境毒性评估的重要指标。为合理预测有机化合物是否易于生物富集,首先从美国环保局网站收集了624个具有不同BCF值的化合物,然后采用7种分子指纹结合5种机器学习方法(包括支持向量机、C4.5决策树、k最近邻法、随机森林法和朴素贝叶斯法),构建了化合物BCF的分类预测模型,所有模型均采用独立外部验证集进行验证。其中,使用Chemo Typer分子指纹结合支持向量机方法得到的二分类模型,整体预测准确度最好,达到了85.4%。通过采用信息增益、频率分析等方法,进一步确定了化合物中易于引起生物富集的关键子结构,包括芳基氯、二芳基醚、氯代烷烃等。研究中所用到的方法为有毒化学品的生态风险评价提供了良好可靠的预测工具。
- 孙露陈英杰吴曾睿李卫华刘桂霞Philip W.Lee唐赟
- 关键词：生物富集因子环境毒理学
- “药物设计实验”课程的建设被引量：15
- 2010年
- 计算机辅助药物设计是现代药物研究的前沿领域和发展方向,它不仅是一门理论学科,而且具有很强的实践性,因此在药学本科专业开设"药物设计实验"课程是专业发展的必然。从实验平台建设、教学内容与方法、学生成绩考核等方面,对"药物设计实验"的课程建设进行了探索与实践。
- 刘桂霞李卫华唐赟
- 关键词：计算机辅助药物设计课程建设教学改革
- GPCR配体药效团数据库的构建被引量：1
- 2011年
- G蛋白偶联受体(GPCR)是人体内一类重要的药物作用靶标。针对GPCR配体进行了较全面的药效团模拟研究,有效地整合针对GPCR进行药物发现研究的数据,并构建了相应的药效团数据库。收集并构建了GPCR的8个大类17个亚型的不同配体共110个药效团模型,作为GPCR配体药效团数据库的首批数据。通过统计分析发现:87%GPCR配体药效团中含有疏水性基团(Hydrophobic,HY)、66%包含芳香性基团(Ring aromatic,RA)、45%含有正离子基团(Positiveions,PI)。GPCR药效团数据库的建立极大地方便了开发设计新的具有选择性的GPCR配体。
- 许哲军程飞雄孙宪强程建昕刘桂霞唐赟
- 关键词：药效团数据库G蛋白偶联受体
