何翔 作品数:36 被引量:165 H指数:8 供职机构: 广东省疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 国家自然科学基金 国家科技重大专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 自动化与计算机技术 更多>>
苏云金杆菌毒蛋白基因克隆和工程菌株构建 陈启民 耿运琪 马明 刘淑红 王金忠 陈晨 何翔 刘子敬 刘坤 李冬颖 将地衣芽孢杆菌(B.licheniformis)的热稳定α-淀粉酶基因通过原生质体转化的方法引入Bt.ken-Ag,构建成高效工程菌株,解决了发酵液中淀粉固形物含量高和粘度大的问题。以pUC19为母体,加入pUC4K的K...关键词:关键词:苏云金芽孢杆菌 毒蛋白 生物杀虫剂 贵州省HIV-1毒株基因亚型变异特征分析 被引量:4 2011年 目的分析贵州省人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株亚型的变异特征,为获得性免疫缺陷综合征(艾滋病,AIDS)防治提供科学依据。方法收集贵州省1998、2002、2007年HIV-1感染者190例,采集血液样品,采用巢式聚合酶链反应(nested PCR)扩增env基因并进行测序分析,与国际标准亚型毒株和其他地区阳性株进行对比,根据[同源性、离散率等]分析HIV-1毒株亚型的变异特征。结果贵州省HIV-I毒株经变异产生3种新亚型毒株,B、B'、C亚型通过基因重组变异为CRF 07-BC、CRF08-BC流行性重组亚型毒株;E亚型毒株变异成了CRF01-AE重组亚型毒株;3种亚型毒株分别占当年核酸检测阳性数的63.41%、36.59%、52.10%;CRF07-BC、CRF08-BC与来源于印度的C.IN.92.同源,CRF01-AE与从欧美传入泰国的01AE.TH90.同源;变异后的BC亚型组内基因离散率为(0.049±0.007)%,AE亚型的组内基因离散率为(0.064±0.008)%。结论贵州省的HIV-1毒株具有高度变异特性;HIV-I变异毒株在传播和流行中较易形成当地流行的优势毒株。 孙显光 邢辉 李志坚 何翔 申莉梅 邵一鸣河北省不同途径感染人群HIV-1基因亚型分析 被引量:8 2011年 目的了解河北省不同途径感染人群艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)亚型分布特点。方法从感染者的血浆样品中提取病毒RNA,反转录后采用套式聚合酶链反应(Nested PCR)扩增HIV-1 gag和env基因的部分片段,对PCR产物直接进行核苷酸序列测定,所获序列与各亚型国际参考株序列比对,进行系统进化树分析,确定基因型。结果对154份HIV-1感染者的样品进行扩增,得到了146份样品的HIV-1基因片段。发现6种HIV-1亚型和重组型,其中B’亚型61例(41.8%),CRF01_AE 59例(40.4%),CRF07_BC 16例(11.0%),CRF08_BC 6例(4.1%),C亚型和B01重组株各2例(1.4%)。血液途径传播为B’亚型,男男性行为传播以CRF01_AE和B'亚型为主。结论河北省不同途径感染人群HIV-1亚型分布具有明显的人群特征。血液途径传播者为单一B’亚型,性传播人群中亚型分布较广。 赵翠英 李巧敏 李保军 赵宏儒 路新利 李岩 王莹莹 邢辉 何翔关键词:基因亚型 浙江省HIV-1 CRF01_AE流行株的分子特征分析 被引量:7 2008年 目的分析艾滋病病毒1型(HIV-1)CRF01AE重组毒株在浙江省的分子流行特征。方法提取234例HIV-1感染者基因组DNA用巢式聚合酶链反应(nPCR)方法扩增gag部分基因片段,测定序列以后分析核苷酸和氨基酸序列。结果在扩增阳性并成功测序的192个序列中HIV-1CRF01AE有81个,占42%,是浙江省HIV主要的流行毒株之一。系统进化树中存在3个bootstrap值〉60的分支簇,其中MIX组包括47个序列,内部基因离散率为2.4%±0.7%,与参考株CM240的基因离散率为3.4%±0.5%;SEX组包括7个样本,组内基因离散率为3.0%±1.2%,与参考株的基因离散率为3.9%±1.0%;MSM组包括12个样本,组内基因离散率为2.8%±1.1%,与参考株的基因离散率为4.9%±0.6%,三者差别有统计学意义。特征性氨基酸分析表明MIX组、SEX组、MSN组共享序列与国际参考株共享序列之间分别存在2个、4个和8个位点的差异。结论浙江省内HIV-1CRF01AE流行株中主要存在三个进化簇,其中两个簇与广西来源株密切相关。CRF01AE毒株在浙江省内主要以异性性途径和注射吸毒形式传播。 姚亚萍 辛若雷 何翔 孟哲峰 潘晓红 郭志宏 杨介者 徐云 邢辉关键词:人类免疫缺陷病毒 分子特征 凉山州2009年HIV-1主要流行区分子流行病学调查 被引量:5 2014年 目的了解凉山州艾滋病病毒I型(HIV-1)流行毒株的亚型、传播途径和病毒在人群中的分布。方法运用反转录巢式聚合酶链反应(PCR)的方法,扩增2009年凉山州266份血浆样本中HIV的gag基因片段。对获得的核酸序列进行系统进化分析。结果凉山HIV-1的流行毒株为CRF07_BC和CRF08_BC毒株,其中CRF07_BC比例为98.3%,为最主要的流行毒株。266份HIV-1阳性样本中,静脉注射吸毒感染者的比例为63.5%,其次为异性性接触感染者,比例为14.3%。结论凉山HIV-1感染者最主要的感染途径是静脉注射吸毒,最主要的流行毒株是CRF07_BC毒株,具有共同的病毒来源。 冯毅 梁姝 肖林 程春林 魏静 秦光明 阮玉华 邢辉 邵一鸣 何翔关键词:分子流行病学 感染性EIAV嵌合克隆的构建及其生物学特性的研究 该文利用基因替换和定点突变的方法对EIAV的膜蛋白基因功能进行精细研究,希望在分子水平上确定氨基酸变异与致病性的关系,这将有助于解释马传染性贫血病毒的减毒机制,同时也为HIV疫苗研制提供直接的理论依据.该文通过对EIAV... 何翔关键词:马传染性贫血病毒 ENV基因 定点突变 感染性克隆 文献传递 宿主HLA限制性的CTL选择压力对于HIV进化的影响 2009年 在宿主免疫选择压力的作用下,病毒为了生存改变自身的结构而不断进化。人白细胞抗原(HLA)限制的细胞毒性T细胞(CTL)反应,在控制人类免疫缺陷病毒(HIV)感染过程中发挥重要作用,是宿主体内驱动HIV进化的一种主要选择压力。该文简要综述了HLA限制性的CTL反应对病毒的控制作用,及目前在人群水平上HLA限制性的CTL反应,对HIV进化影响的研究进展。 周晓兰 洪坤学 何翔 邵一鸣关键词:人类免疫缺陷病毒 人白细胞抗原 陕西省MSM人群中HIV-1分子流行病学研究 被引量:3 2012年 目的了解陕西省近年来发现的男男性行为人群(Men who have sex with men,MSM)中,艾滋病病毒(Human immunodeficiency virus,HIV)流行株的基因序列特征、亚型、流行现状和趋势,为艾滋病防治工作提供科学依据。方法对HIV感染者进行流行病学相关因素调查,无菌采集全血,分离血浆提取病毒核酸,应用套式反转录聚合酶链式反应(Nested reverse transcription-polymerase chain reaction,Nested RT-PCR)扩增gag、env和pol基因的部分片段,并对扩增产物进行测序,用Mega 5.0软件将测序结果与各亚型国际参考株比对,根据基因离散率和系统进化树分析确定基因型及其特征。结果 71份样本中成功获得51份PCR扩增阳性产物并得到相应序列。综合gag、env和pol基因离散程度和系统进化树分析发现,陕西省MSM人群中至少存在3种HIV-1基因亚型和重组毒株(即B亚型、CRF01_AE和CRF07_BC重组型)。其中CRF01_AE为主要流行株,共28例(54.9%),其次是CRF07_BC重组型20例(39.2%)和B亚型3例(5.9%),重组型占到了94.1%(48/51)。根据基因离散率,在三种不同基因片段中,以env基因变异程度最大,HIV-1B亚型、CRF07_BC和CRF01_AE重组型的组内离散率分别为(12.8%±1.2%)、(6.6%±0.6%)和(8.4%±0.7%)。结论首次在陕西省MSM人群HIV感染者中,发现至少存在HIV-1B亚型和CRF01_AE、CRF07_BC重组型,以CRF01_AE重组型为主。该人群显示多亚型且近期呈高度流行的趋势。加强对MSM人群的行为干预,控制HIV在MSM人群中的传播,将是今后陕西省艾滋病防治工作的重点之一。 邢爱华 李翔 张梦妍 何翔 任强 常文辉 付钰淋 董丽芳 贾华 邢辉 王敬军关键词:男男性行为人群 基因测序 系统进化树 HIV/AIDS患者肺脏移植进展 2022年 HIV/AIDS患者的实体器官移植在国外已快速发展,但我国实施器官移植手术较少。本文通过回顾当前HIV/AIDS患者的肺移植开展情况,从抗排斥反应、高效抗反转录病毒治疗、术后并发症及生存状况等多个角度讨论我国开展HIV/AIDS患者肺移植手术的可行性。 李小杉 高蓉 钟平 何翔 胡春晓 陈静瑜关键词:艾滋病病毒 艾滋病 肺移植 器官移植 适用于中国HIV-1分型的gag基因引物及其应用 被引量:18 2009年 目的对中国流行的主要HIV-1毒株进行遗传特征分析,确定适用于中国HIV分子流行病学调查的gag基因扩增引物。方法从HIV序列数据库下载CRF07_BC、CRF08_BC、C亚型及M组参考毒株的gag全长序列,经序列比对后设计gag基因扩增引物;获得的基因片段采用邻接法构建系统进化树,评价不同片段用于分析和确定HIV-1亚型的可靠性,并检测部分样本以评定效果。结果目前我国常用的gag基因306/c-gag引物扩增片段(HXB2836~1507)构建的系统进化树中,CRF07_BC、C亚型进化簇的Bootstrap值分别为70%和59%,其可靠性较低,难以形成较为稳定的进化簇用于病毒亚型判断。而利用设计的gag基因GUX/GDX引物扩增片段(HXB2781~1861)构建的系统进化树中,CRF07_BC、CRF08_BC和C亚型序列能够独立成簇,其Bootstrap值分别为99%、99%和77%,具有较高的可靠性。在实际应用中,新设计的引物具有较高的扩增阳性率和测序成功率,获得序列形成B、C亚型和CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC等5个大的进化簇,其Bootstrap值均超过80%。即使仅用下游引物GDX测序获得的较短片段亦能获得较为可靠的系统进化树。结论GUX/GDX引物扩增获得的gag基因片段可以构建较为可靠的系统进化树,用于区分和判断我国流行的主要HIV-1毒株亚型,尤其是BC重组毒株和C亚型毒株。该方法在我国HIV分子流行病学调查和研究中有广泛的应用价值。 辛若雷 冯毅 程春林 胡园园 孟哲峰 邢辉 邵一鸣 何翔关键词:HIV-1 流行病学 分子 基因 GAG