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现在自然界和人群中已不存在非典病毒被引量：5: 2013年; 非典(SARS)流行至今已近10年,虽被进行了全面广泛深入的研究,但其起源和贮存宿主仍不明确。我们发现SARS的流行自然史和迄今世界上的传染病均不相符,其原因是非典病毒(SARS CoV)经"非寻常进化"方式,很可能是"非自然"方式进入人群。对几乎所有的SARS CoV基因变异、进化、跨种传播等既往研究,我们进行重新审视并综合分析,发现以往研究多从微观和一个侧面思考问题,而本文则从全新之视角,结合流行病学和生物进化理论,首次阐明:SARS CoV经历了逆向进化;自然界根本不存在SARS CoV的直接祖先和贮存宿主,故其流行后即从人群和动物界消失。因此建议卫生部正式向WHO等有关国际机构申请组织专家委员会,实证自然界和人群中已无SARS CoV,并予宣布。; 徐德忠孙慧敏谭雅慧; 关键词：SARS冠状病毒流行病学

西安地区乙肝携带产妇宫内感染的基因型研究: 目的了解西安地区乙肝病毒表面抗原(HBsAg)携带产妇的乙肝病毒(HBV)基因型状况,探讨其所生新生儿发生宫内感染传播的,为今后进一步探索宫内感染的机制提供依据。对象与方法连续收集2011年12月至2013年2月期间在陕...; 徐锐张磊谭雅慧于晓寒闫永平徐德忠; 关键词：宫内感染 HBSAG 基因型宫内感染率

SARS病毒和其他冠状病毒中性突变速率初步的比较研究被引量：4: 2011年; 目的比较SARS冠状病毒(SARS-CoV)与第1至第3组(其他3组)冠状病毒的中性突变速率之异同,为更深入研究SARS-CoV起源提供新的思路。方法在美国国立生物技术信息中心中获取其他3组26条病毒序列,同时选取7条SARS-CoV序列。计算各病毒株5个主要基因串联序列的同义替换核苷酸的数量(Ks值),以此值与时间创建散点图,并进行直线拟合,取得各自中性突变速率并比较。结果 SARS-CoV中性突变速率为7.33×10-6/位点.天,而其他3组冠状病毒为2×10-6/位点.天,仅约前者的1/3.5,但决定系数R2极低,无意义。经多种拟合检验,发现标本量和离散性不是本文R2低值的主要原因。结论用同一方法对SARS-CoV和其他3组冠状病毒的中性突变速率进行比较研究,结果显示两者明显不同或具不同的模式;提示和其他3组冠状病毒相比较,SARS-CoV在分子进化或起源模式上似有特别之处。; 孙慧敏唐晓凤王波谭雅慧于晓寒张景霞闫永平夏结来徐德忠; 关键词：SARS病毒冠状病毒科

京、港、台和新加坡SARS流行室模型的新分析和群体防控度的提出与思考被引量：1: 2013年; 目的 SARS病毒起源至今未搞清,必须对其流行重新审视;本文提出室模型新的思路,比较四地流行的群体防控度,为重新探讨病毒起源开辟新的模型实践。方法赋予室模型主要参数传播力(Ka)和群体防控力(Ke)新的定义,并提出"群体防控度(Ke/Ka)"新参数;采用NOSA软件进行SARS流行曲线拟合并计算相关参数以相关分析法筛选Ke/Ka的影响因素。结果 Ka和Ke由高到低依次均为新加坡、北京、台湾、香港;Ke/Ka由高到低依次为新加坡、台湾、香港、北京。SARS病毒传入某地区时间越晚,发病人数越少,病例最高峰数值越小,Ke/Ka值越大,提示对抗传播和流行的综合力度越强。结论新参数Ke/Ka能够综合反映传播和防控相互作用的力度;并能为将来揭示SARS病毒起源的新路径提供模型支持。; 于晓寒王波唐晓凤张景霞谭雅慧孙慧敏徐德忠夏结来; 关键词：SARS病毒

SARS-CoV中性突变速率和有根系统发育树再研究及其起源的新思考被引量：3: 2012年; 目的 SARS-CoV起源仍未清楚,本文应用系统发育分析方法重建有根系统发育树,比对文献资料,提出SARS-CoV起源的新思考,为最终找到SARS-CoV的真实起源打下基础。方法在美国国立生物技术信息中心(national center for biotechnology information,NCBI)中获取9条SARS-CoV序列。计算其同义替换核苷酸的数量(Ks值),并构建散点图,进行直线拟合,获得SARS-CoV的中性突变速率;进一步计算最近共同祖先日期(time ofmost recent common ancestor,TMRCA),最后绘制系统发育树。结果 SARS-CoV中性突变速率为7.6×10-6/位点.天(t=18.95,P<0.001),R2=0.98,直线拟合的可信度较高。绘制出的有根系统发育树发现有异常之处,并和有关文献无根树对照,提示SARS-CoV进化上存在"逆向进化"。结论 SARS-CoV在流行中出现"逆向进化",SARS-CoV的起源可能是非自然性的,可能是非完全动物源性。; 谭雅慧孙慧敏唐晓凤张景霞于晓寒王波夏结来徐德忠; 关键词：SARS病毒突变

西安地区乙肝孕产妇宫内感染的流行病学研究: 目的了解西安地区乙肝病毒(HBV)产妇所生新生儿发生宫内感染传播的现状及其相关影响因素,为今后进一步探索宫内感染的机制及制定有效干预措施和评估干预实施效果提供依据。方法连续收集2011年12月至2013年2月期间在陕西省...; 张磊谭雅慧于晓寒徐锐闫永平徐德忠; 关键词：宫内感染 HBV HBSAG 流行病学研究

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