李显航
- 作品数:4 被引量:9H指数:2
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- 家蝇小热休克蛋白(sHsp20.6)的生物信息学分析被引量:7
- 2013年
- 研究家蝇小热休克蛋白sHsp20.6的生物学功能。方法应用生物信息学的方法和工具对家蝇sHsp20.6的理化性质、疏水性、跨膜区和信号肽、膜体分析、二级结构功能域、蛋白质的功能分类预测、多重序列比对与系统发育树构建、三级结构建模进行分析。结果表明:家蝇sHsp20.6是一个亲水蛋白,分子量为20.64kD,等电点为5.66,不具有跨膜区和信号肽,包含有一个HSP20的结构域,主要构成原件为α螺旋和无规则卷曲,三维结构预测显示该蛋白为棒状结构,C端结构域具有7个片层结构。聚类分析显示,家蝇sHsp20.6蛋白与昆虫中的直系同源小热休克蛋白(orthologoussmallheatshockprotein)聚为一类。
- 李显航刘红美
- 关键词:家蝇生物信息学
- 家蝇转铁蛋白基因的克隆和生物信息学分析被引量:2
- 2012年
- 为了研究家蝇转铁蛋白基因功能,获得全长cDNA序列并对其蛋白序列进行生物信息学分析,利用在线分析程序和相关工具软件分析转铁蛋白基因的开放读码框,分析编码蛋白的理化性质、结构域、并预测其空间结构和功能。结果表明家蝇转铁蛋白基因编码蛋白由622个氨基酸组成,分子量为70.58kDa,理论等电点为5.33,为稳定蛋白,有跨膜区,含有信号肽,该蛋白属于TR-FER保守结构域家族,亚细胞定位于细胞核,二级结构以无规则卷曲为主,功能预测该蛋白具有酶活性。
- 龚晓林张洁李显航刘红美
- 关键词:家蝇转铁蛋白生物信息学
- 家蝇小热休克蛋白(HSP20.6)基因的克隆和表达分析
- 目的:克隆家蝇小热休克蛋白Hsp20.6基因,研究该基因在家蝇各生长发育阶段的表达情况,并进行原核表达,为最终阐明其生物学功能奠定基础。 方法:应用生物信息学方法分析家蝇小热休克蛋白Hsp20.6理化性质、疏水性、跨膜...
- 李显航
- 关键词:家蝇原核表达基因克隆生长发育
- 家蝇Hsp20.6基因原核表达及其在高温胁迫下的表达分析
- 2015年
- 目的对家蝇小热休克蛋白Hsp20.6基因进行原核表达,并研究高温胁迫下该基因在家蝇各生长发育阶段及成虫不同部位的表达变化情况,为最终阐明其生物学功能奠定基础。方法利用p ET28a(+)原核表达载体构建家蝇Hsp20.6基因的重组表达载体,酶切、测序鉴定后,诱导蛋白的表达。采用半定量RT-PCR和实时荧光定量PCR研究Hsp20.6在家蝇卵、3日龄幼虫、蛹、成虫4个生长发育阶段及成虫头部、胸部、腹部的表达情况。结果成功构建p ET28a(+)-Hsp20.6重组表达载体,IPTG诱导表达产物大小约为Mr21 000,与生物信息学预测结果相符。RT-PCR与实时荧光定量PCR表明Hsp20.6基因在家蝇各个发育时期和成虫各部位有不同程度的表达,热激能上调该基因的表达(P<0.05),以幼虫和成虫头部组织上调量最高。结论 Hsp20.6基因属于热诱导型基因,参与了家蝇适应热胁迫的调控,可能在其中具有某种重要功能。
- 张洁李显航刘红美
- 关键词:家蝇原核表达热激