广东海洋大学水产学院广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心
- 作品数：20 被引量：59H指数：5
- 相关机构：中山大学生命科学学院水生经济动物繁殖营养和病害控制国家重点学科专业实验室中山大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 卵形鲳鲹生物学及繁养殖技术研究进展
- 2025年
- 卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)是海水网箱、深远海大型化设施养殖的优良品种。近年来,中国卵形鲳鲹养殖业快速发展,卵形鲳鲹繁养殖关键技术获得突破,但其基础生物学及遗传育种研究相对薄弱导致的养殖性能下降等问题已成为产业可持续发展的瓶颈。为揭示产业研究发展现状,本文综述了卵形鲳鲹的生物学特征,包括资源分布、栖息环境、形态及和繁殖生物学特征等,总结了近年来相关人工繁育与养殖、生理生态、遗传学等方面的研究成果,并结合卵形鲳鲹资源开发、养护及发展前景提出了未来的研究方向,包括良种选育、基础遗传机制、性腺发育调控机制及新品系开发4个方面,以期为未来卵形鲳鲹产业的稳定发展提供有益参考。
- 陈华谱
- 关键词：卵形鲳鲹生物学养殖
- 金钱鱼Sox3基因cDNA克隆及组织表达被引量：1
- 2020年
- 金钱鱼是中国重要经济型鱼类,但其人工繁殖难以取得成功。本研究利用cDNA末端快速扩增法(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)克隆了金钱鱼(Scatophagus argus)Sox3基因cDNA全长序列,分析该基因序列在不同物种间的差异,并用RT-PCR半定量方法分析其在雌、雄组织中的表达差异。结果表明:金钱鱼Sox3 c DNA全长1270 bp,包括5’非翻译区(5’-UTR)217 bp、3’非翻译区(3’-UTR)150 bp和开放阅读框(open reading frame,ORF)903 bp,编码300个氨基酸,该氨基酸序列34104位为HMG保守盒。金钱鱼Sox3氨基酸序列与大黄鱼(Larimichthys crocea)的同源性最高,为99.3%,其次是金头鲷(Sparus aurata),为98.7%。Sox3前体蛋白的系统进化树显示,金钱鱼与大黄鱼亲缘关系最近。金钱鱼Sox3基因的组织表达有明显的组织特异性及性别差异,在性腺中表达量最高,雄性个体脑和垂体次之,肌肉、肾脏、心脏和肠有低量的表达,肝脏、脾脏、胃和鳃中未检测到表达;雌性个体在卵巢中观察到表达水平最高,脑、垂体和鳃次之,脾脏、肌肉、肾脏、心脏和肠中有低量的表达,肝脏和胃中未检测到表达。本研究为研究Sox3基因在金钱鱼人工繁殖与养殖产业方面提供理论参考。
- 李智渊洪广王耀嵘李广丽朱春华陈华谱田昌绪
- 关键词：金钱鱼克隆
- 基于高通量测序的多鳞鱚性别相关功能基因挖掘
- 多鳞鱚Sillago sihama(Forsk(a)l),又名沙锥鱼,是我国沿海重要经济鱼类.目前,有关该物种研究多集中于渔业资源调查、人工繁殖、食性及群体遗传学等方面,而有关多鳞鱚基因组及其转录组学相关研究尚属空白.本...
- 田昌绪李智渊黄洋陈华谱杜涛朱春华李广丽
- 关键词：转录组分子标记功能基因
- 高体鰤Na^(+)/K^(+)-ATPase基因家族的生物信息学分析及其在盐度胁迫下的表达
- 2025年
- 为了鉴定高体鰤(Seriola dumerili)Na^(+)/K^(+)-ATPase基因家族成员,并探究不同盐度胁迫下高体鰤Na^(+)/K^(+)-ATPase基因家族成员的表达情况,揭示其对外界环境盐度变化的响应。从数据库下载高体鰤Na^(+)/K^(+)-ATPase基因家族成员的mRNA和氨基酸序列,并对家族成员进行勘定、系统发育分析、共线性分析、基因结构分析和蛋白质保守基序分析。然后,利用荧光定量PCR检测不同盐度胁迫下高体鰤主要渗透压组织鳃和肾脏中Na^(+)/K^(+)-ATPase基因家族成员mRNA的表达变化。结果显示,本研究共鉴定出高体鰤Na^(+)/K^(+)-ATPase基因12个家族成员(atp1a1a.4、atp1a1b、atp1a2a、atp1a3a、atp1a3b、atp1b1a、atp1b1b、atp1b2a、atp1b2b、atp1b3a、atp1b3b、atp1b4)。系统发育分析结果显示,高体鰤Na^(+)/K^(+)-ATPase基因家族的各成员与其他鱼类先各自聚为一支,再同四足类动物(包括人、鼠、鸟类、爬行类、两栖类)中相对应的成员聚在一起。共线性分析结果显示,Na^(+)/K^(+)-ATPase基因家族成员及其上下游基因具有良好的共线性;基因结构分析结果表明,Na^(+)/K^(+)-ATPase基因家族各亚家族的各成员有着相似的结构。同时,Na^(+)/K^(+)-ATPase家族成员的蛋白基序和保守结构域也较为保守。转录组和qRT-PCR分析结果显示,急性盐度处理72 h时,高盐度组高体鰤鳃中atp1b1b mRNA的表达水平显著上调;慢性盐度处理30 d时,鳃中atp1b1a mRNA的表达水平随着盐度的升高而降低。此外,慢性盐度处理下,高盐度组高体鰤肾脏中atp1b1b mRNA的表达水平显著低于低盐度组,而低盐度组atp1b3b mRNA的表达水平相较对照组显著下调。这表明在高体鰤鳃中的β1亚基,肾脏中β1和β3亚基主要参与渗透调节,以响应高盐和低盐胁迫。该结果为研究鱼类Na^(+)/K^(+)-ATPase基因家族的进化具有一定的参考意义,也为进一步研究高体鰤Na^(+)/K^(+)-ATPase基因家族的功能奠定基础。
- 周彤李欣怡茹笑影袁嘉慧黄洋黄洋李广丽朱春华
- 关键词：基因家族盐度胁迫基因表达水平
- ERR-dsRNA对罗氏沼虾卵巢中ERR及生殖相关基因表达的影响被引量：9
- 2018年
- 【目的】研究雌激素相关受体(Estrogen-related receptor,ERR)在雌性罗氏沼虾生殖过程中的功能。【方法】通过注射双链RNA(Double-strandedRNA,dsRNA)干扰罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)ERR的表达,对干扰组和对照组的卵巢样本进行转录组测序,筛选与生殖相关的差异表达基因,并通过qPCR检测它们在卵巢发育过程中的表达。【结果】注射ERR-dsRNA后,卵巢中ERR mRNA和ERR蛋白的表达显著下降。ERR-dsRNA干扰组和对照组卵巢转录组测序获得的差异表达Unigene中,9条被富集到生殖GO条目,3条被富集到生殖过程GO条目,21条被富集到卵母细胞减数分裂Pathway条目。这些生殖相关的Unigene中差异倍数较大的有9条,经qPCR验证,5条在ERR干扰组和对照组间的表达差异有统计学意义。这5条Unigene中有3条在卵巢发育过程中的表达差异有统计学意义,其中2条(CL7112.Contig4_All和Unigene4600_All)与卵母细胞减数分裂有关,1条(CL4888.Contig2_All)与生殖相关激素的合成及释放有关。【结论】ERR可通过调控卵母细胞减数分裂和生殖相关激素的合成与释放调控罗氏沼虾卵巢发育。
- 刘金磊邓思平江东能陈华谱陈华谱吴天利田昌绪朱春华
- 关键词：罗氏沼虾生殖RNA干扰(RNAI)
- 金钱鱼性别决定与分化的分子机制初步研究
- 金钱鱼(Scatophagus argus)是一种海水养殖鱼类,雌鱼比雄鱼生长快,因此研究其性别决定与分化分子机制有助于性别控制.Dmrt1(doublesex-and mab-3-related transcripti...
- 江东能奥马尔·法鲁克·穆斯塔法邓思平陈华谱石红娟朱春华李广丽
- 关键词：金钱鱼DMRT1性别决定与分化分子标记转录调控
- 水解单宁对凡纳滨对虾生长性能和肠道微生物的影响被引量：19
- 2019年
- 为分析水解单宁对凡纳滨对虾生长及其肠道微生物菌群结构的影响,以基础饲料为空白组,在基础饲料中分别添加0.1%、0.2%和0.3%的水解单宁作为实验组,进行为期60 d的养殖实验后,统计生长性能,并取其肠道内容物提取DNA,用Illumina MiSeq测序平台进行16S rDNA基因V3~V4区高通量测序,检测对虾肠道内菌群结构及变化情况。结果表明:(1)3个水解单宁添加组的增重率、特定生长率和肥满度与对照组相比均显著升高(P<0.05),肝体比均显著降低(P<0.05)。(2)4组样品中共获得206192条优化序列,操作分类单元(OUT)总数达542个。对照组凡纳滨对虾肠道微生物以变形菌门和蓝细菌门为主,其次是放线菌门和拟杆菌门;试验组肠道主要菌群为变形菌门、软壁菌门。试验组与对照组相比,蓝细菌门、放线菌门和拟杆菌门的比例降低,变形菌门、软壁菌门和厚壁菌门比例增加。(3)Rank-Abundance曲线和多样性指数结果可见,实验组的物种丰度和均匀度大体上均高于对照组。PCoA分析发现,0.1%和0.3%添加组的微生物群落较为接近,而与0.2%添加组差别较大,结合生长性能指标可知,饲料中水解单宁的最适添加量为0.1%。以上研究表明,饲料添加水解单宁可显著改变对虾肠道的微生物组成,提高对虾生长速度,影响凡纳滨对虾的生长性能。
- 郭慧郭慧陈锦霖李广丽朱春华
- 关键词：凡纳滨对虾肠道微生物
- 泰国斗鱼foxl2基因的分子克隆及组织表达模式被引量：2
- 2021年
- Foxl2 (winged helix/forkhead transcription factor gene 2)是叉头框转录因子家族成员之一,在鱼类性别决定与分化中起重要的作用。为了探讨foxl2基因在泰国斗鱼(Bettas plendens)雌雄组织中的表达差异,本研究利用分子克隆技术分离并鉴定了泰国斗鱼foxl2基因cDNA序列1 246 bp,其中开放阅读框为921 bp,共编码306个氨基酸。多重序列比对分析,泰国斗鱼Foxl2氨基酸序列与其他鱼类的Foxl2具有较高的同源性,显示出序列进化的保守性。组织表达结果显示,雌性泰国斗鱼foxl2基因在性腺中表达量最高;在雄鱼中,foxl2基因在性腺中表达量最低,结果表明foxl2基因组织表达具有显著的特异性及性别差异。本研究结果为后续开展泰国斗鱼的性别调控机理提供了参考。
- 任席林梁帅淇钟艳芳王耀嵘劳键潼李广丽黄海陈华谱
- 关键词：FOXL2分子克隆
- 多鳞鱚phds基因家族序列特征及其在低氧胁迫后表达变化被引量：5
- 2020年
- 【目的】分析多鳞鱚(Sillago sihama)脯氨酸羟化酶(prolyl hydroxylases,Phds)基因家族序列特征,探讨其在低氧响应过程的作用。[方法]通过硬骨鱼类phds基因,在多鳞鱚转录组和基因组数据中比对筛选多鳞鱚phds基因。对多鳞鱚Phds蛋白序列进行结构域预测、系统进化和共线性分析等。采用实时荧光定量PCR检测phds基因在低氧胁迫和复氧后的表达变化。【结果】在多鳞鱚基因组中共鉴定到三个phds基因,分别是phd1、phd2和phd3,开放阅读框(ORF)全长分别为1635、1092、723 bp,分别编码544、363、240个氨基酸。结构域预测表明,多鳞鱚Phd1、Phd2、Phd3蛋白均含有P4Hc保守结构域。系统进化分析发现,多鳞鱚Phds均与大黄鱼(Larimichthys crocea)亲缘关系最近。共线性分析表明,多鳞鱚phds与尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)上下游基因高度一致。phd1、phd2在低氧处理4 h鳃组织中mRNA表达显著高于常氧组(P<0.05),但在心脏中无显著性差异(P>0.05);phd3在低氧处理4 h的鳃组织中显著低于常氧组(P<0.05),而在心脏中显著高于常氧组(P<0.05)。【结论】多鳞鱚存在phd1、phd2和phd3基因,并在不同组织的低氧响应中起重要作用。
- 林星桦叶明慧SEATAN Wanida潘炎杨陈芳圆黄洋朱春华李广丽田昌绪
- 关键词：基因家族低氧胁迫基因表达
- 12月龄多鳞鱚形态性状对体质量的影响被引量：5
- 2022年
- 【目的】研究12月龄多鳞鱚(Sillago sihama Forsskål)形态性状与体质量之间的关系,筛选适用于选育的主要形态性状。【方法】测定12个形态性状与体质量的表型参数,通过通径分析、相关分析和多元回归分析估计主要性状对体质量的直接影响和间接影响。【结果】12月龄多鳞鱚13个性状之间的相关系数均达到极显著水平(P<0.01)。通径分析表明,体高(X1)、体厚(X2)、眼径(X7)、体长(X10)和背鳍前长(X11)对体质量(Y)有明显的直接影响;除体长外,其他生长性状对体质量的直接影响均小于它们对体质量的间接影响,同时,体长对体质量的直接影响最大。相关分析表明,上述5个主要性状是体质量变化的主要影响因素。体长对体质量的单独决定系数最大(0.331),5个主要性状对体质量的总决定系数为0.928。建立的以主要性状为自变量、体质量为因变量的回归方程为Y=-13.339+2.913X1+3.352X2-4.467X7+1.473X10+0.763X11。【结论】体长、体厚、眼径、体高和背鳍前长等5个主要性状是影响多鳞鱚体质量的核心性状,其中体长影响最大。
- 余家旺王耀嵘林星桦沈奕君李广丽黄洋朱春华田昌绪
- 关键词：形态性状通径分析
